More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1145 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  100 
 
 		 582 aa  1197    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  56.33 
 
 		 578 aa  681    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  50.96 
 
 		 577 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  39.53 
 
 		 341 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  39.18 
 
 		 343 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  38.53 
 
 		 344 aa  239  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  40.82 
 
 		 342 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  37.97 
 
 		 347 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  39.18 
 
 		 344 aa  238  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  37.69 
 
 		 347 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  37.69 
 
 		 347 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  41.9 
 
 		 361 aa  232  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  37.69 
 
 		 347 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  36.62 
 
 		 343 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  39.66 
 
 		 344 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  44.3 
 
 		 343 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  38.68 
 
 		 346 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  38.99 
 
 		 346 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  42.27 
 
 		 341 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  39.08 
 
 		 345 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  41.59 
 
 		 344 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  38.19 
 
 		 345 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  41.74 
 
 		 346 aa  211  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  38.19 
 
 		 345 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  39.37 
 
 		 344 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  41.43 
 
 		 346 aa  209  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  37.5 
 
 		 341 aa  207  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  41.01 
 
 		 341 aa  204  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  40.73 
 
 		 340 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  40.96 
 
 		 340 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  41.19 
 
 		 340 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  40.96 
 
 		 340 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  41.19 
 
 		 340 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  40.69 
 
 		 341 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  40.36 
 
 		 340 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  40.23 
 
 		 353 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  38.73 
 
 		 325 aa  199  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  39.63 
 
 		 340 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  40.37 
 
 		 346 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  36.86 
 
 		 342 aa  196  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  40.12 
 
 		 356 aa  196  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 		 342 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  36.2 
 
 		 341 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  38.85 
 
 		 342 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  37.66 
 
 		 342 aa  194  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  37.7 
 
 		 337 aa  190  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  35.47 
 
 		 357 aa  189  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  41.07 
 
 		 342 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  39.01 
 
 		 359 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  37.76 
 
 		 340 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  39.19 
 
 		 358 aa  183  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  36.72 
 
 		 315 aa  182  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  37.03 
 
 		 368 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  38.85 
 
 		 345 aa  181  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  41.78 
 
 		 341 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  41.78 
 
 		 341 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  41.78 
 
 		 341 aa  177  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  35.85 
 
 		 354 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  41.78 
 
 		 340 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  35.95 
 
 		 341 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  41.78 
 
 		 340 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  42.57 
 
 		 340 aa  173  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  39.39 
 
 		 341 aa  172  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  41.84 
 
 		 340 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  40.31 
 
 		 353 aa  169  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  40.68 
 
 		 340 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  37.79 
 
 		 340 aa  166  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  37.46 
 
 		 340 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  37.46 
 
 		 340 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  37.14 
 
 		 340 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  36.83 
 
 		 340 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  36.83 
 
 		 340 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  36.83 
 
 		 340 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  36.83 
 
 		 340 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  34.3 
 
 		 407 aa  146  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  35.45 
 
 		 336 aa  145  3e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  39.83 
 
 		 328 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  31.89 
 
 		 378 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  33.44 
 
 		 344 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  37.77 
 
 		 346 aa  126  9e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  29.9 
 
 		 336 aa  125  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  38.12 
 
 		 372 aa  123  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  38.14 
 
 		 369 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1746  histone deacetylase superfamily protein  31.89 
 
 		 336 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.115562 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0381  histone deacetylase superfamily protein  33.78 
 
 		 336 aa  120  6e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0601969 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  32.09 
 
 		 330 aa  120  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  29.75 
 
 		 306 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  28.06 
 
 		 322 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  32.01 
 
 		 331 aa  118  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  28.89 
 
 		 316 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  31.9 
 
 		 347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87707  predicted protein  29.19 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  31.65 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  30.71 
 
 		 312 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  38.79 
 
 		 365 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71431  predicted protein  34.38 
 
 		 807 aa  115  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.71958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  30.03 
 
 		 340 aa  114  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  38.57 
 
 		 380 aa  114  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  29.02 
 
 		 379 aa  113  8.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  30.6 
 
 		 312 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>