More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A1265 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  100 
 
 
340 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  99.41 
 
 
340 aa  685    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  100 
 
 
340 aa  691    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  100 
 
 
340 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  99.41 
 
 
340 aa  685    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  99.12 
 
 
340 aa  682    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  100 
 
 
340 aa  691    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  92.94 
 
 
340 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  72.06 
 
 
340 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  70.29 
 
 
340 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  70.29 
 
 
340 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  70.88 
 
 
340 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  71.47 
 
 
340 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  69.71 
 
 
340 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  72.35 
 
 
340 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  67.57 
 
 
340 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  72.65 
 
 
341 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  72.94 
 
 
341 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  66.77 
 
 
341 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  72.65 
 
 
340 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  72.65 
 
 
341 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  72.65 
 
 
340 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  72.65 
 
 
340 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  72.35 
 
 
340 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  63.64 
 
 
368 aa  442  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  60.24 
 
 
337 aa  436  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  67.16 
 
 
340 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  48.54 
 
 
342 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  47.65 
 
 
342 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  47.79 
 
 
342 aa  289  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  45.61 
 
 
342 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  45.16 
 
 
357 aa  282  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  45.17 
 
 
353 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  46.08 
 
 
341 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  45.53 
 
 
341 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  43.9 
 
 
347 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  46.49 
 
 
346 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  42.98 
 
 
347 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  45.11 
 
 
342 aa  267  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  43.55 
 
 
342 aa  266  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  43.64 
 
 
346 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  41.91 
 
 
341 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  43.35 
 
 
346 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  43.02 
 
 
347 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  43.35 
 
 
344 aa  262  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  44.88 
 
 
341 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  43.19 
 
 
347 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  42.2 
 
 
344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  41.26 
 
 
344 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  40.46 
 
 
361 aa  242  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  41.83 
 
 
343 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  37.86 
 
 
343 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  42.61 
 
 
345 aa  239  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  43.8 
 
 
345 aa  235  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  41.55 
 
 
344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  42.03 
 
 
358 aa  232  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  41.83 
 
 
344 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  39.02 
 
 
341 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  42.73 
 
 
343 aa  227  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  42.07 
 
 
345 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  41.14 
 
 
359 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  42.36 
 
 
345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  40.35 
 
 
346 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  40.06 
 
 
346 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  39.83 
 
 
356 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  38.15 
 
 
341 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  40.57 
 
 
354 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  43.28 
 
 
341 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  40.07 
 
 
578 aa  202  7e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  38.02 
 
 
577 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  34.08 
 
 
325 aa  193  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  29.09 
 
 
315 aa  184  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  36.83 
 
 
582 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  35.53 
 
 
353 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  42.01 
 
 
334 aa  155  7e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  41.1 
 
 
340 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  32.52 
 
 
407 aa  152  8e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  40.72 
 
 
344 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  36.48 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  44.55 
 
 
336 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  45.65 
 
 
373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.23 
 
 
380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  38.7 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  38.53 
 
 
335 aa  139  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.38 
 
 
371 aa  139  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  36.2 
 
 
385 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  34.75 
 
 
346 aa  137  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  36.82 
 
 
385 aa  136  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  39.57 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  31.02 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  37.09 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  44.79 
 
 
378 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  35.04 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  36.09 
 
 
336 aa  132  6e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  37.7 
 
 
336 aa  133  6e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  39.82 
 
 
344 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0976  hypothetical protein  37.62 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  34.24 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  30.61 
 
 
438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  39.32 
 
 
364 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>