More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3860 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  100 
 
 
372 aa  761    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  53.08 
 
 
378 aa  379  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2921  histone deacetylase superfamily  54.27 
 
 
386 aa  340  2e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  42.68 
 
 
344 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  43.55 
 
 
334 aa  218  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  36.72 
 
 
344 aa  215  8e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  35.63 
 
 
379 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  41.86 
 
 
340 aa  212  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  36.27 
 
 
370 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  38.85 
 
 
370 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  40.14 
 
 
331 aa  208  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  36.34 
 
 
365 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2258  histone deacetylase family protein  37.63 
 
 
370 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  35.99 
 
 
379 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2309  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  37.63 
 
 
370 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2827  histone deacetylase family protein  37.63 
 
 
370 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2332  histone deacetylase family protein  37.63 
 
 
370 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0125  histone deacetylase family protein putative  37.63 
 
 
370 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  34.96 
 
 
380 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  35.99 
 
 
379 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  36.72 
 
 
373 aa  202  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1010  histone deacetylase superfamily protein  34.59 
 
 
366 aa  202  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.942652  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0332  histone deacetylase family protein  39.32 
 
 
350 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195031  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0124  histone deacetylase family protein  39.32 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0141  histone deacetylase family protein  37.37 
 
 
370 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  35.71 
 
 
380 aa  199  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  39.3 
 
 
344 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  34.76 
 
 
371 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  34.85 
 
 
369 aa  193  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  34.09 
 
 
369 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  34.09 
 
 
369 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  42.07 
 
 
336 aa  190  4e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  33.77 
 
 
369 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  36.31 
 
 
343 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  33.44 
 
 
369 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71431  predicted protein  33.6 
 
 
807 aa  183  3e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.71958  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  31.48 
 
 
364 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  37.98 
 
 
316 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  39.72 
 
 
335 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  34.94 
 
 
352 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  33.01 
 
 
369 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  31.82 
 
 
373 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  40.2 
 
 
359 aa  176  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  42.65 
 
 
345 aa  176  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  38.85 
 
 
341 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87707  predicted protein  33.71 
 
 
480 aa  175  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18467  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  39.8 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  41.06 
 
 
330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  31.34 
 
 
345 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  30.93 
 
 
306 aa  170  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  34.1 
 
 
737 aa  169  9e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  35.57 
 
 
341 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  31.2 
 
 
399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  31.2 
 
 
399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  36.52 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  32.35 
 
 
340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  32.14 
 
 
369 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  37.54 
 
 
341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  38 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  31.53 
 
 
379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  36.88 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  34.74 
 
 
325 aa  163  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  32.33 
 
 
309 aa  162  9e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6515  histone deacetylase superfamily  36.42 
 
 
354 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  32.35 
 
 
340 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  35.15 
 
 
308 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2777  Histone deacetylase  38.75 
 
 
368 aa  159  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0178296  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3337  histone deacetylase family protein  31.49 
 
 
367 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.937629  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  34.95 
 
 
321 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  35.31 
 
 
309 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  35.91 
 
 
307 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  33.22 
 
 
306 aa  157  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  32.23 
 
 
307 aa  156  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  37.15 
 
 
323 aa  155  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08042  Putative histone deacetylase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z8L7]  32.05 
 
 
766 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.714475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  34.64 
 
 
314 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  35.1 
 
 
314 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1968  histone deacetylase family protein  31.82 
 
 
369 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  35.49 
 
 
307 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1475  histone deacetylase family protein  32.03 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.157085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2334  histone deacetylase family protein putative  31.82 
 
 
369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679895  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  35.76 
 
 
309 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  37.59 
 
 
322 aa  153  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  28.53 
 
 
322 aa  153  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  36.82 
 
 
307 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  36.61 
 
 
309 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  35.57 
 
 
307 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.384272 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  32.4 
 
 
351 aa  152  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  34.19 
 
 
311 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  31.1 
 
 
316 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  34.97 
 
 
308 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  31.21 
 
 
337 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  35.12 
 
 
307 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  34.84 
 
 
326 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  33.44 
 
 
306 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  33.44 
 
 
309 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  34.55 
 
 
347 aa  149  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  33.23 
 
 
311 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  31.74 
 
 
438 aa  149  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  31.64 
 
 
346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>