More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1010 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1010  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 366 aa  751    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.942652  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  66.94 
 
 		 365 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  66.11 
 
 		 379 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  65.56 
 
 		 379 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  52.57 
 
 		 371 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  53.13 
 
 		 370 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  53.55 
 
 		 380 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  54.25 
 
 		 373 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  53.01 
 
 		 380 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  52.33 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  54.1 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  51.91 
 
 		 369 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  51.37 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  51.37 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  51.09 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  51.09 
 
 		 369 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  52.05 
 
 		 369 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3337  histone deacetylase family protein  51.64 
 
 		 367 aa  349  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.937629  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1968  histone deacetylase family protein  51.64 
 
 		 369 aa  345  7e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2334  histone deacetylase family protein putative  51.37 
 
 		 369 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  52.21 
 
 		 340 aa  324  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  51.62 
 
 		 340 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1475  histone deacetylase family protein  51.33 
 
 		 340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.157085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  44.35 
 
 		 379 aa  269  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  42.11 
 
 		 370 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0141  histone deacetylase family protein  40.12 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  34.59 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2258  histone deacetylase family protein  40.12 
 
 		 370 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2332  histone deacetylase family protein  40.12 
 
 		 370 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2827  histone deacetylase family protein  40.12 
 
 		 370 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2309  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  40.12 
 
 		 370 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0125  histone deacetylase family protein putative  40.12 
 
 		 370 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0124  histone deacetylase family protein  43.05 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0332  histone deacetylase family protein  43.05 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195031  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  40.29 
 
 		 344 aa  195  9e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  37.46 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  35.13 
 
 		 378 aa  190  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  35.86 
 
 		 344 aa  186  7e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  37.18 
 
 		 331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  39.19 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  37.94 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2921  histone deacetylase superfamily  37.64 
 
 		 386 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  33.15 
 
 		 352 aa  179  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  37.18 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  40.88 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  37.83 
 
 		 364 aa  176  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  35.26 
 
 		 344 aa  176  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  36.17 
 
 		 345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2777  Histone deacetylase  37.25 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0178296  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  36.25 
 
 		 316 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  36.79 
 
 		 323 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  37.5 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  36.25 
 
 		 337 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  38.25 
 
 		 314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  34.67 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  36.93 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  38.41 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  33.33 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  34.67 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  37.54 
 
 		 359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  39.13 
 
 		 312 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  35.92 
 
 		 316 aa  163  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  37.46 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  33.22 
 
 		 379 aa  162  8.000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  39.13 
 
 		 312 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  35.14 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  35.71 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  36.01 
 
 		 306 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  36.29 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  37.86 
 
 		 341 aa  159  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  34.66 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  35 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  37.63 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  36 
 
 		 308 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  35.54 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  34.75 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  36.1 
 
 		 309 aa  155  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  32.4 
 
 		 737 aa  155  8e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  38.52 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  35.74 
 
 		 304 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  37.97 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  35.76 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  35.61 
 
 		 309 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  34.4 
 
 		 348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  35.09 
 
 		 399 aa  152  7e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  35.09 
 
 		 399 aa  152  7e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  35.76 
 
 		 313 aa  152  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  35.25 
 
 		 309 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  35.35 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  38.13 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  35.38 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  34.29 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  35.38 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  35.13 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  33.69 
 
 		 307 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  35.71 
 
 		 309 aa  150  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  36.1 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  33.76 
 
 		 328 aa  149  9e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  36.06 
 
 		 307 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  34.53 
 
 		 309 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>