More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1785 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 379 aa  790    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  41.57 
 
 		 352 aa  268  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  39.23 
 
 		 344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  37.32 
 
 		 343 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  37.32 
 
 		 345 aa  236  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  36.8 
 
 		 344 aa  223  6e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  39.42 
 
 		 306 aa  222  7e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  37.01 
 
 		 359 aa  222  9e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  37.57 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  38.62 
 
 		 345 aa  216  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  36.53 
 
 		 341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  37.7 
 
 		 341 aa  211  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  37.39 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87707  predicted protein  34.86 
 
 		 480 aa  207  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  39.68 
 
 		 309 aa  207  3e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  37 
 
 		 309 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  35.95 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  36.09 
 
 		 307 aa  203  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  35.89 
 
 		 399 aa  202  7e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  35.89 
 
 		 399 aa  202  7e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  36.19 
 
 		 337 aa  202  8e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  34.9 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  36 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  37.93 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  36.84 
 
 		 347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  36.28 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  35.11 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  38.46 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  35.78 
 
 		 316 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  36.54 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  38.23 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  34.22 
 
 		 364 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  35.67 
 
 		 309 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  34.33 
 
 		 309 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  36.52 
 
 		 341 aa  192  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  36.39 
 
 		 311 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  35.03 
 
 		 309 aa  192  8e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  35.24 
 
 		 316 aa  192  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  33.67 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  34.94 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  35.24 
 
 		 309 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  36.95 
 
 		 308 aa  190  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  34.71 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  35.29 
 
 		 309 aa  189  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  34.94 
 
 		 307 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  35.59 
 
 		 313 aa  189  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  35.47 
 
 		 309 aa  189  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  34.92 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2302  histone deacetylase superfamily  37.67 
 
 		 319 aa  188  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  35.35 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  36.05 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2813  histone deacetylase superfamily protein  37.67 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  32.93 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  38.38 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  35.41 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  34.62 
 
 		 307 aa  185  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  32.46 
 
 		 326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  34.85 
 
 		 309 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  34.29 
 
 		 309 aa  182  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  35.22 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  31.93 
 
 		 380 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  35.2 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  34.1 
 
 		 311 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  35.12 
 
 		 370 aa  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  34.19 
 
 		 314 aa  180  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3376  Histone deacetylase  36.12 
 
 		 317 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  34.58 
 
 		 323 aa  179  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  34.33 
 
 		 306 aa  179  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  34.55 
 
 		 308 aa  178  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  34.71 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  31.68 
 
 		 737 aa  177  3e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  34 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  34.74 
 
 		 307 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  35.46 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  34.74 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2025  histone deacetylase family protein  36.12 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08042  Putative histone deacetylase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z8L7]  31.32 
 
 		 766 aa  176  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.714475 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  33.97 
 
 		 307 aa  175  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  35.44 
 
 		 365 aa  175  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  30.72 
 
 		 380 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  37.63 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  35.1 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  35.67 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  35.33 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1863  Histone deacetylase  34.51 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0992  putative histone deacetylase-family protein  36.88 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  31.58 
 
 		 365 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  34.74 
 
 		 307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2911  histone deacetylase superfamily protein  34.49 
 
 		 311 aa  173  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  36.54 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  33.85 
 
 		 348 aa  172  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  32.48 
 
 		 307 aa  172  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  35.57 
 
 		 314 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  32.77 
 
 		 369 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  32.83 
 
 		 369 aa  172  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0937  histone deacetylase superfamily protein  35.35 
 
 		 307 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  35.26 
 
 		 307 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  34.01 
 
 		 307 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2528  histone deacetylase superfamily protein  33.75 
 
 		 315 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0933  histone deacetylase superfamily protein  35.35 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>