More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_71431 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_71431  predicted protein  100 
 
 		 807 aa  1656    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.71958  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08042  Putative histone deacetylase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z8L7]  38.13 
 
 		 766 aa  474  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.714475 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  37.11 
 
 		 737 aa  403  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87707  predicted protein  36.07 
 
 		 480 aa  236  9e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45906  predicted protein  36.39 
 
 		 693 aa  214  4.9999999999999996e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35869  predicted protein  33.82 
 
 		 534 aa  204  7e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.597228  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  38.66 
 
 		 331 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  35.41 
 
 		 344 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  34.42 
 
 		 344 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  37.43 
 
 		 379 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  35.71 
 
 		 352 aa  192  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  38.85 
 
 		 370 aa  180  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  36.67 
 
 		 345 aa  179  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  34.3 
 
 		 316 aa  177  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  34.13 
 
 		 345 aa  177  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  32.81 
 
 		 343 aa  174  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  33.6 
 
 		 372 aa  174  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  35.81 
 
 		 380 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  35.02 
 
 		 306 aa  174  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  35.47 
 
 		 380 aa  173  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  34.98 
 
 		 334 aa  172  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  32.29 
 
 		 369 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  32.29 
 
 		 369 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  38.54 
 
 		 365 aa  171  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  32.01 
 
 		 369 aa  171  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  32.01 
 
 		 369 aa  170  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  35.76 
 
 		 308 aa  170  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  36.04 
 
 		 330 aa  169  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  31.18 
 
 		 364 aa  169  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  34.59 
 
 		 359 aa  167  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  32.89 
 
 		 369 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  33.13 
 
 		 379 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  32.29 
 
 		 370 aa  166  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  37.6 
 
 		 379 aa  165  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  35.64 
 
 		 369 aa  163  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  36.09 
 
 		 322 aa  163  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  36.52 
 
 		 328 aa  163  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  31.48 
 
 		 345 aa  162  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  39.56 
 
 		 309 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  37.6 
 
 		 365 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  33.85 
 
 		 309 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  35.19 
 
 		 316 aa  162  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  32.91 
 
 		 306 aa  162  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  29.44 
 
 		 379 aa  160  9e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  35.71 
 
 		 311 aa  160  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  34.64 
 
 		 311 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  31.58 
 
 		 309 aa  159  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  31.51 
 
 		 371 aa  159  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  40.19 
 
 		 340 aa  157  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  31.91 
 
 		 326 aa  157  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  40.19 
 
 		 369 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  34.37 
 
 		 335 aa  156  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  37.13 
 
 		 309 aa  155  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  39 
 
 		 340 aa  156  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  33.12 
 
 		 307 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  33.12 
 
 		 307 aa  155  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  31 
 
 		 337 aa  154  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  32.81 
 
 		 307 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0936  histone deacetylase family protein  32.81 
 
 		 307 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  32.81 
 
 		 307 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  32.81 
 
 		 307 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  32.81 
 
 		 307 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  32.81 
 
 		 307 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  31.78 
 
 		 316 aa  152  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3337  histone deacetylase family protein  40.19 
 
 		 367 aa  153  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.937629  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  32.51 
 
 		 309 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  31.8 
 
 		 309 aa  152  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  39.23 
 
 		 340 aa  152  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  35.64 
 
 		 373 aa  152  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  33.13 
 
 		 341 aa  151  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  32.42 
 
 		 309 aa  151  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  42.31 
 
 		 336 aa  150  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2309  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  36.04 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1475  histone deacetylase family protein  40.19 
 
 		 340 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.157085  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  29.88 
 
 		 373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1016  histone deacetylase superfamily protein  33.33 
 
 		 307 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2258  histone deacetylase family protein  36.04 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2332  histone deacetylase family protein  36.04 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  35.78 
 
 		 308 aa  150  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2827  histone deacetylase family protein  36.04 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0933  histone deacetylase superfamily protein  33.33 
 
 		 307 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2247  histone deacetylase superfamily protein  33.02 
 
 		 307 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1968  histone deacetylase family protein  40.19 
 
 		 369 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0141  histone deacetylase family protein  36.04 
 
 		 370 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2334  histone deacetylase family protein putative  40.19 
 
 		 369 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679895  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0124  histone deacetylase family protein  36.04 
 
 		 350 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  39.39 
 
 		 344 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0332  histone deacetylase family protein  36.04 
 
 		 350 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195031  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0937  histone deacetylase superfamily protein  33.12 
 
 		 307 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  31.19 
 
 		 341 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0125  histone deacetylase family protein putative  36.04 
 
 		 370 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  32.82 
 
 		 309 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0992  putative histone deacetylase-family protein  33.33 
 
 		 334 aa  148  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0578  histone deacetylase superfamily protein  33.02 
 
 		 307 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1057  histone deacetylase superfamily protein  33.02 
 
 		 307 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  33.96 
 
 		 307 aa  148  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  30.83 
 
 		 336 aa  147  6e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  35.51 
 
 		 309 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  32.18 
 
 		 307 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  34.07 
 
 		 309 aa  147  7.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>