More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1309 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  100 
 
 
341 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  99.71 
 
 
341 aa  689    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  99.71 
 
 
341 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  99.12 
 
 
340 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  99.12 
 
 
340 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  98.83 
 
 
340 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  98.53 
 
 
340 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  88.2 
 
 
340 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  80.29 
 
 
340 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  79.12 
 
 
340 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  79.41 
 
 
340 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  79.41 
 
 
340 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  79.41 
 
 
340 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  77.65 
 
 
340 aa  532  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  80.29 
 
 
340 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  72.84 
 
 
340 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  70.57 
 
 
341 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  73.24 
 
 
340 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  73.24 
 
 
340 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  72.94 
 
 
340 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  72.94 
 
 
340 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  72.94 
 
 
340 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  72.94 
 
 
340 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  72.65 
 
 
340 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  72.06 
 
 
340 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  63.99 
 
 
337 aa  472  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  61.72 
 
 
368 aa  445  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  49.27 
 
 
342 aa  322  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  48.22 
 
 
342 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  45.74 
 
 
357 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  47.95 
 
 
342 aa  295  7e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  48.17 
 
 
342 aa  288  8e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  48.01 
 
 
353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  48.64 
 
 
341 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  45.91 
 
 
341 aa  269  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  46.2 
 
 
346 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  44 
 
 
344 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  44.35 
 
 
342 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  42.03 
 
 
347 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  41.45 
 
 
341 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  41.74 
 
 
347 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  42.32 
 
 
347 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  45.32 
 
 
341 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  41.45 
 
 
347 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  41.16 
 
 
342 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  41.74 
 
 
344 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  43.02 
 
 
346 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  40.87 
 
 
344 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  40.75 
 
 
361 aa  249  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  44 
 
 
344 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  42.45 
 
 
346 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  43.71 
 
 
344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  43.77 
 
 
343 aa  239  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  36.52 
 
 
343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  39.83 
 
 
343 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  42.36 
 
 
359 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  46.08 
 
 
341 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  42.57 
 
 
345 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  42.24 
 
 
358 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  42.56 
 
 
346 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  42.26 
 
 
346 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  38.15 
 
 
341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  41.33 
 
 
345 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  40.7 
 
 
345 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  38.32 
 
 
578 aa  209  7e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  39.23 
 
 
354 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  43.64 
 
 
577 aa  207  2e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  39.31 
 
 
341 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  40.75 
 
 
345 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  39.66 
 
 
356 aa  203  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  42.42 
 
 
582 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  31.61 
 
 
315 aa  189  7e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  32.21 
 
 
325 aa  187  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  39.26 
 
 
353 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  42.27 
 
 
334 aa  153  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  36.49 
 
 
306 aa  149  5e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  38.61 
 
 
438 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  33.68 
 
 
328 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  40.83 
 
 
344 aa  139  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  33.47 
 
 
322 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  43.43 
 
 
336 aa  139  8.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  39.81 
 
 
340 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  41.31 
 
 
369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  36.4 
 
 
336 aa  137  4e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  39.73 
 
 
335 aa  136  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  44.98 
 
 
378 aa  136  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  30.79 
 
 
407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  40.11 
 
 
336 aa  134  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  34.89 
 
 
346 aa  134  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.93 
 
 
371 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  36.7 
 
 
385 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  40.64 
 
 
385 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  38.5 
 
 
370 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  38.46 
 
 
344 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.4 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  35.5 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  41.01 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  40.51 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  39.81 
 
 
364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3163  histone deacetylase superfamily protein  38.92 
 
 
438 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>