More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1164 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  100 
 
 
340 aa  693    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  92.94 
 
 
340 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  92.94 
 
 
340 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  92.94 
 
 
340 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  92.94 
 
 
340 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  92.94 
 
 
340 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  92.94 
 
 
340 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  92.94 
 
 
340 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  71.47 
 
 
340 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  70.59 
 
 
340 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  70.29 
 
 
340 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  70 
 
 
340 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  70.88 
 
 
340 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  70 
 
 
340 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  72.06 
 
 
340 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  67.57 
 
 
340 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  67.16 
 
 
341 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  72.06 
 
 
341 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  72.06 
 
 
341 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  71.76 
 
 
341 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  71.76 
 
 
340 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  71.76 
 
 
340 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  71.76 
 
 
340 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  71.47 
 
 
340 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  64.35 
 
 
368 aa  449  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  61.56 
 
 
337 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  66.57 
 
 
340 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  47.37 
 
 
342 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  47.35 
 
 
342 aa  301  9e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  47.31 
 
 
342 aa  286  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  44.44 
 
 
342 aa  279  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  43.7 
 
 
357 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  44.6 
 
 
353 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  42.41 
 
 
342 aa  265  8e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  41.33 
 
 
341 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  44.88 
 
 
341 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  42.44 
 
 
347 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  44.09 
 
 
341 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  44.38 
 
 
346 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  42.12 
 
 
347 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  44.25 
 
 
342 aa  259  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  42.73 
 
 
347 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  42.15 
 
 
347 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  42.49 
 
 
346 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  41.91 
 
 
344 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  43.32 
 
 
341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  42.2 
 
 
346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  40.75 
 
 
344 aa  248  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  37.28 
 
 
343 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  39.88 
 
 
361 aa  237  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  39.54 
 
 
344 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  43.23 
 
 
345 aa  235  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  40.11 
 
 
343 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  41.79 
 
 
345 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  40.92 
 
 
345 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  39.83 
 
 
344 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  42.43 
 
 
343 aa  223  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  40.11 
 
 
344 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  40.58 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  40.82 
 
 
346 aa  219  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  40.29 
 
 
358 aa  219  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 
359 aa  219  7.999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  37.28 
 
 
341 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  39.94 
 
 
346 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  38.34 
 
 
577 aa  207  3e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  44.18 
 
 
341 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  39.74 
 
 
578 aa  206  5e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  39.24 
 
 
356 aa  206  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  39.89 
 
 
354 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  36.99 
 
 
341 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  37.79 
 
 
582 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  34.41 
 
 
325 aa  185  8e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  29.09 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  42.01 
 
 
340 aa  155  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  35.24 
 
 
353 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  42.01 
 
 
334 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  41.63 
 
 
344 aa  152  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  35.86 
 
 
306 aa  150  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  37.71 
 
 
346 aa  145  8.000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  45.55 
 
 
336 aa  145  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  31.6 
 
 
407 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  46.63 
 
 
378 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  38.26 
 
 
328 aa  142  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  38.43 
 
 
371 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.93 
 
 
380 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  35.27 
 
 
322 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  30.61 
 
 
438 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  39.24 
 
 
335 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  37.28 
 
 
336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  39.17 
 
 
380 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  36.36 
 
 
385 aa  135  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  36.62 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  38.42 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  42.93 
 
 
373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  39.31 
 
 
385 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  39.11 
 
 
344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  40.78 
 
 
364 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  34.92 
 
 
330 aa  132  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  37.96 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0381  histone deacetylase superfamily protein  30.72 
 
 
336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0601969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>