More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1181 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 315 aa  646    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  49.21 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  36.69 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  37.68 
 
 		 344 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  43.33 
 
 		 343 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  33.94 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  34.46 
 
 		 342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  38.03 
 
 		 578 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  33.44 
 
 		 342 aa  195  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  33.33 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  31.89 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  34.98 
 
 		 361 aa  192  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  33.84 
 
 		 345 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  38.35 
 
 		 344 aa  191  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  32.82 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  33.74 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  32.31 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  34.95 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  33.84 
 
 		 345 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  32.61 
 
 		 346 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  37.32 
 
 		 344 aa  188  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  33.33 
 
 		 341 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  39.04 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  39.47 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  39.04 
 
 		 347 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  42.72 
 
 		 341 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  32.59 
 
 		 346 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  35.08 
 
 		 577 aa  185  7e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  31.48 
 
 		 340 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  31.17 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  30.56 
 
 		 340 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  34.48 
 
 		 346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  30.86 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  31.48 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  30.86 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  32.86 
 
 		 340 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  41.31 
 
 		 346 aa  182  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  34.17 
 
 		 346 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  36.72 
 
 		 582 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  31.85 
 
 		 359 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  41.75 
 
 		 345 aa  179  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  33.21 
 
 		 340 aa  179  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  40.38 
 
 		 341 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  41.75 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  31.17 
 
 		 341 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  43.75 
 
 		 354 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  34.9 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  42.93 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  32.68 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  39.74 
 
 		 407 aa  171  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  32.04 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  32.43 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  31.29 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  30.89 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  31.29 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  31.19 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  31.19 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  31.55 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  39.23 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  31.06 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  31.06 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  32.23 
 
 		 353 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  28.53 
 
 		 340 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  28.53 
 
 		 340 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  28.53 
 
 		 340 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  28.53 
 
 		 340 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  28.53 
 
 		 340 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  31.65 
 
 		 357 aa  162  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  28.79 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  28.79 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  30.19 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  28.79 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  33.33 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  32.61 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  31.68 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  36.13 
 
 		 353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  34.68 
 
 		 336 aa  153  5e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  37.65 
 
 		 346 aa  152  8e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  36.86 
 
 		 364 aa  149  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  40.12 
 
 		 341 aa  148  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  31.77 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  32.23 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  31.88 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  32.88 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  33.57 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  31.07 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  33.22 
 
 		 309 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  33.33 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  34.01 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  30.33 
 
 		 345 aa  143  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  32.25 
 
 		 344 aa  142  5e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  33.9 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  30.98 
 
 		 309 aa  142  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  31.67 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  33.79 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  33.79 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  31.21 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  30.82 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  34.59 
 
 		 304 aa  140  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  35.09 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>