More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0478 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 
342 aa  655    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  45.06 
 
 
344 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  43.52 
 
 
344 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  44.36 
 
 
344 aa  228  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  45.2 
 
 
336 aa  228  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  49.62 
 
 
352 aa  226  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  52 
 
 
330 aa  224  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  45.83 
 
 
340 aa  224  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  42.6 
 
 
334 aa  223  3e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  46.82 
 
 
380 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  44.77 
 
 
308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  43.34 
 
 
306 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  45.1 
 
 
370 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  45.95 
 
 
309 aa  218  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  45.95 
 
 
309 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  45.69 
 
 
380 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  45.73 
 
 
341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  46.99 
 
 
343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  47.84 
 
 
328 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  46.9 
 
 
331 aa  212  9e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  41.1 
 
 
364 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  40.72 
 
 
309 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  38.26 
 
 
306 aa  209  6e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  39.14 
 
 
336 aa  207  2e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  42.55 
 
 
370 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  42.72 
 
 
309 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  44.19 
 
 
369 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  49.32 
 
 
359 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  44.19 
 
 
369 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  44.57 
 
 
369 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  44.57 
 
 
369 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  42.59 
 
 
335 aa  201  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  42.35 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  43.55 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  40.51 
 
 
309 aa  200  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  40.72 
 
 
309 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  46.74 
 
 
345 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  47.2 
 
 
365 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  46.44 
 
 
373 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  41.94 
 
 
309 aa  199  7.999999999999999e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  39.3 
 
 
337 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  43.82 
 
 
369 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  42.71 
 
 
345 aa  195  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  39.3 
 
 
316 aa  195  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  38.36 
 
 
312 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  38.68 
 
 
399 aa  195  9e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  38.68 
 
 
399 aa  195  9e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1746  histone deacetylase superfamily protein  38.81 
 
 
336 aa  195  1e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.115562 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  44.44 
 
 
309 aa  195  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  38.19 
 
 
378 aa  195  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  38.44 
 
 
308 aa  194  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  38.36 
 
 
312 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0381  histone deacetylase superfamily protein  37.89 
 
 
336 aa  194  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0601969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  40.72 
 
 
309 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  41.88 
 
 
309 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  36.29 
 
 
336 aa  193  4e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  41.56 
 
 
328 aa  192  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  38.98 
 
 
316 aa  192  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  40.19 
 
 
323 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  40.95 
 
 
347 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  38.71 
 
 
309 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  40.2 
 
 
306 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  41.5 
 
 
369 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  39.07 
 
 
326 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  40.07 
 
 
304 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.89 
 
 
371 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  41.56 
 
 
325 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  39.94 
 
 
346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  40.07 
 
 
309 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  43.75 
 
 
322 aa  190  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  43.67 
 
 
319 aa  189  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  38.46 
 
 
311 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  40.07 
 
 
309 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  40.45 
 
 
341 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  39.81 
 
 
341 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  38.98 
 
 
311 aa  186  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  44.52 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  38.73 
 
 
314 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  41.89 
 
 
345 aa  182  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  36.45 
 
 
311 aa  182  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  40.54 
 
 
323 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  38.51 
 
 
341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  36.99 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  40.07 
 
 
309 aa  180  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  42.13 
 
 
348 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  41.02 
 
 
324 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  39.61 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  41.41 
 
 
307 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  43.97 
 
 
340 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  36.91 
 
 
307 aa  179  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  37.27 
 
 
379 aa  178  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  35.57 
 
 
322 aa  178  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  42.32 
 
 
340 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  40.74 
 
 
307 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  39.37 
 
 
313 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  38.38 
 
 
309 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  42.32 
 
 
369 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  40.8 
 
 
373 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3319  histone deacetylase superfamily protein  42.63 
 
 
306 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  36.6 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>