More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1461 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 393 aa  780    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  92.62 
 
 		 393 aa  710    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  60.76 
 
 		 393 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  60.57 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  60.31 
 
 		 394 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  61.22 
 
 		 387 aa  435  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  58.93 
 
 		 393 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  60.95 
 
 		 412 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  57.39 
 
 		 426 aa  424  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  60.62 
 
 		 392 aa  422  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  58.38 
 
 		 393 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  55.25 
 
 		 435 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  56.48 
 
 		 406 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  58.35 
 
 		 396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  53.81 
 
 		 410 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  58.1 
 
 		 387 aa  396  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  52.04 
 
 		 407 aa  398  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  50.64 
 
 		 403 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  55.32 
 
 		 392 aa  388  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  51.12 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  51.65 
 
 		 394 aa  375  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  51.69 
 
 		 395 aa  363  2e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  49.87 
 
 		 406 aa  362  7.0000000000000005e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  49.28 
 
 		 414 aa  351  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  53.43 
 
 		 424 aa  343  4e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  50.78 
 
 		 411 aa  341  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  51.79 
 
 		 398 aa  341  1e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  49.49 
 
 		 390 aa  333  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  46.93 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  39.59 
 
 		 396 aa  276  7e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  42.49 
 
 		 389 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  44.04 
 
 		 370 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  39.17 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  40.28 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  38.89 
 
 		 388 aa  263  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  38.89 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  38.61 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  38.61 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  38.89 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  38.89 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  38.61 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  38.61 
 
 		 388 aa  259  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  38.61 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  44.41 
 
 		 378 aa  243  6e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  40.48 
 
 		 378 aa  227  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  34.77 
 
 		 385 aa  222  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  41.56 
 
 		 378 aa  220  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  34.27 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  37.31 
 
 		 383 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  34.27 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  34.49 
 
 		 385 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  38.3 
 
 		 385 aa  212  9e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  37.85 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  35.9 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  35.9 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  36.08 
 
 		 351 aa  207  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  39.36 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  36.89 
 
 		 327 aa  179  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  34.16 
 
 		 426 aa  177  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  32.56 
 
 		 659 aa  176  8e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  36.45 
 
 		 374 aa  176  8e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  35.08 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  37.81 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  32.4 
 
 		 687 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  40.38 
 
 		 390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  30.39 
 
 		 466 aa  167  4e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  32.8 
 
 		 424 aa  167  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  32.78 
 
 		 379 aa  166  5e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  37.03 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  37.03 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  31.39 
 
 		 488 aa  164  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  35.96 
 
 		 475 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  37.32 
 
 		 621 aa  162  7e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  32.36 
 
 		 500 aa  162  7e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  40.07 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  31.58 
 
 		 426 aa  160  5e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  30.3 
 
 		 487 aa  159  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  34.29 
 
 		 482 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  33.23 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  39.35 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  39.35 
 
 		 369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  36.59 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  37.05 
 
 		 379 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  35.05 
 
 		 404 aa  152  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  34.33 
 
 		 331 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  37.89 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  32.5 
 
 		 316 aa  150  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  32.92 
 
 		 360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  36.04 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  32.81 
 
 		 315 aa  146  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  35.12 
 
 		 340 aa  146  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  37.02 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  34.87 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  36.47 
 
 		 344 aa  144  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  35.24 
 
 		 406 aa  144  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  31.88 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  34.68 
 
 		 334 aa  142  9e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  33.64 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  29.52 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  31.48 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>