More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0517 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  100 
 
 
383 aa  786    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  65.78 
 
 
385 aa  542  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  65.25 
 
 
385 aa  529  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  67.64 
 
 
385 aa  526  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  64.71 
 
 
385 aa  512  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  64.71 
 
 
385 aa  511  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  48.65 
 
 
381 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  40.64 
 
 
370 aa  262  8e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  43.82 
 
 
387 aa  260  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  41.74 
 
 
378 aa  239  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  37.34 
 
 
417 aa  233  3e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  36.73 
 
 
500 aa  228  9e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  38.08 
 
 
453 aa  228  1e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  39.71 
 
 
388 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  39.04 
 
 
388 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  36.91 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  38.12 
 
 
388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  36.91 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  38.12 
 
 
388 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  38.12 
 
 
388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  39.29 
 
 
388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  39.04 
 
 
388 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  39.04 
 
 
388 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  39.04 
 
 
388 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  38.12 
 
 
388 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  37.98 
 
 
396 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  38.74 
 
 
388 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  37.31 
 
 
393 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  36.39 
 
 
397 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  35.58 
 
 
392 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  36.98 
 
 
387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  36.21 
 
 
389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  36.36 
 
 
426 aa  215  9e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  38.53 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  34.96 
 
 
411 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  35.14 
 
 
407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  35.23 
 
 
403 aa  213  7e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  35.19 
 
 
488 aa  212  7.999999999999999e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  37.01 
 
 
387 aa  212  9e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  37.68 
 
 
378 aa  212  9e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  36.5 
 
 
394 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  36.15 
 
 
396 aa  210  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  38.32 
 
 
378 aa  209  6e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  41.85 
 
 
435 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  33.59 
 
 
406 aa  208  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  34.97 
 
 
426 aa  206  6e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  33.95 
 
 
687 aa  204  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  35.82 
 
 
426 aa  204  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  35.16 
 
 
394 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  36.49 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  36.02 
 
 
404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  36.02 
 
 
388 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  34.27 
 
 
412 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  33.76 
 
 
351 aa  199  6e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  33.92 
 
 
406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  37.24 
 
 
393 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  33.95 
 
 
487 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  34.26 
 
 
466 aa  196  7e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  36.97 
 
 
482 aa  195  9e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  38.51 
 
 
393 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  32.35 
 
 
621 aa  194  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  33.04 
 
 
659 aa  193  3e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  35.44 
 
 
424 aa  193  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  35.78 
 
 
410 aa  192  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  34.84 
 
 
424 aa  192  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  34.53 
 
 
390 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  35.93 
 
 
375 aa  189  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  33.33 
 
 
379 aa  189  9e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  35.76 
 
 
389 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  35.76 
 
 
389 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  35.38 
 
 
475 aa  186  4e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  35.08 
 
 
390 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  37.22 
 
 
374 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  36.42 
 
 
348 aa  179  8e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  36.75 
 
 
395 aa  178  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  37.8 
 
 
398 aa  176  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  35.83 
 
 
369 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  33.83 
 
 
404 aa  173  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  35.2 
 
 
369 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  35.4 
 
 
327 aa  170  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  33.33 
 
 
406 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  33.91 
 
 
374 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  36.14 
 
 
364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0697  histone deacetylase superfamily protein  36.57 
 
 
357 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.22424  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  36.33 
 
 
360 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  32.81 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  34.96 
 
 
306 aa  147  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  33.33 
 
 
316 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  33.55 
 
 
334 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  33.67 
 
 
336 aa  143  4e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53146  predicted protein  33.48 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  35.8 
 
 
380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  31.2 
 
 
438 aa  137  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  31.89 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  35.39 
 
 
380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  35.37 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  37.98 
 
 
369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  37.6 
 
 
369 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  37.6 
 
 
369 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  37.12 
 
 
340 aa  133  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>