More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0570 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 360 aa  729    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  36.77 
 
 		 351 aa  219  5e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  40.91 
 
 		 348 aa  219  7.999999999999999e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2090  Histone deacetylase  41.01 
 
 		 345 aa  192  7e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  37.87 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  37.87 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  37.59 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  35.71 
 
 		 385 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1556  histone deacetylase superfamily protein  35.19 
 
 		 341 aa  172  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  38.7 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  37.09 
 
 		 385 aa  169  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  34.02 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  34.09 
 
 		 406 aa  168  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  36.82 
 
 		 374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  36.51 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  34.08 
 
 		 378 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  34.91 
 
 		 407 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  42.33 
 
 		 364 aa  160  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  34.65 
 
 		 327 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  36.82 
 
 		 388 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  36.82 
 
 		 388 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  32.52 
 
 		 424 aa  159  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  36.86 
 
 		 388 aa  159  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  36.47 
 
 		 388 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  36.86 
 
 		 388 aa  159  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  36.86 
 
 		 388 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  36.1 
 
 		 389 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  36.86 
 
 		 388 aa  159  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  36.47 
 
 		 388 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  36.74 
 
 		 378 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  36.47 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  36.26 
 
 		 388 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  38.62 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  40.09 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  36.82 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  31.34 
 
 		 392 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  36.33 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  33.54 
 
 		 387 aa  153  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  36.74 
 
 		 396 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  34.58 
 
 		 393 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  31.71 
 
 		 412 aa  153  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  32.73 
 
 		 403 aa  153  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  33.95 
 
 		 411 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  29.93 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  32 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0381  histone deacetylase superfamily protein  39.57 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0601969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  40.28 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  32.97 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  32.35 
 
 		 414 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  34.95 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  35.31 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  31.73 
 
 		 396 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  35.42 
 
 		 378 aa  149  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  32.92 
 
 		 393 aa  149  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  30.51 
 
 		 621 aa  149  9e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  35.42 
 
 		 393 aa  149  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  34.03 
 
 		 393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  30.77 
 
 		 453 aa  148  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  39.16 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  30.93 
 
 		 659 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  34.37 
 
 		 394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  33.33 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  30.63 
 
 		 410 aa  146  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  35.15 
 
 		 487 aa  145  9e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  34.19 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  35.07 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  35.66 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  31.29 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  31.02 
 
 		 435 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  38.17 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  32.23 
 
 		 500 aa  142  8e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  31.48 
 
 		 488 aa  141  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  34.83 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  32.92 
 
 		 393 aa  139  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  34.04 
 
 		 325 aa  139  7.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  34.09 
 
 		 389 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  35.92 
 
 		 341 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  34.09 
 
 		 389 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  32.3 
 
 		 426 aa  138  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1746  histone deacetylase superfamily protein  36.64 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.115562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  36.19 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  35.04 
 
 		 346 aa  137  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  33.86 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  34.43 
 
 		 309 aa  136  7.000000000000001e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  28.77 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  34.17 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  35.63 
 
 		 370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  32.77 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  35.09 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  34.67 
 
 		 406 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  31 
 
 		 424 aa  133  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  39.25 
 
 		 343 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  34.34 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  31.94 
 
 		 466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  32.91 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  32.7 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  39 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  30.99 
 
 		 687 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  32.54 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  32.19 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>