More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1832 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  100 
 
 		 410 aa  821    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  57.46 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  54.35 
 
 		 414 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  56.27 
 
 		 393 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  53.81 
 
 		 393 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  53.81 
 
 		 393 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  54.48 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  51.48 
 
 		 393 aa  388  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  52.63 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  51.75 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  49.75 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  50.25 
 
 		 392 aa  368  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  49.88 
 
 		 403 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  49.88 
 
 		 435 aa  363  4e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  50.61 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  49.5 
 
 		 426 aa  362  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  50.12 
 
 		 412 aa  358  7e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  50.62 
 
 		 387 aa  358  9e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  50.12 
 
 		 406 aa  351  1e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  46.45 
 
 		 406 aa  347  2e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  48.78 
 
 		 411 aa  347  3e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  47.61 
 
 		 392 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  48.89 
 
 		 396 aa  332  9e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  47.88 
 
 		 394 aa  320  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  46.88 
 
 		 395 aa  317  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  46.08 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  44.72 
 
 		 424 aa  312  5.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  45.93 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  47.48 
 
 		 387 aa  280  5e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  41.32 
 
 		 389 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  43.41 
 
 		 388 aa  265  8e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  39.7 
 
 		 396 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  39.22 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  41.29 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  41.94 
 
 		 388 aa  260  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  38.92 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  38.92 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  38.92 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  40.97 
 
 		 388 aa  256  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  40.97 
 
 		 388 aa  256  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  39.22 
 
 		 388 aa  256  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  40.97 
 
 		 388 aa  256  7e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  42.86 
 
 		 378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  35.88 
 
 		 389 aa  230  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  35.88 
 
 		 389 aa  230  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  37.5 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  36.67 
 
 		 378 aa  210  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  34.92 
 
 		 385 aa  206  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  36.28 
 
 		 385 aa  206  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  36 
 
 		 378 aa  203  6e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  33.42 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  33.42 
 
 		 385 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  35.78 
 
 		 383 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  36.47 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  31.66 
 
 		 351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  37.14 
 
 		 381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  33.85 
 
 		 426 aa  182  7e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  34.17 
 
 		 482 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  31.69 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  33.02 
 
 		 475 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  32.34 
 
 		 424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  33.79 
 
 		 315 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  31.45 
 
 		 379 aa  170  4e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  32.42 
 
 		 488 aa  168  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  32.9 
 
 		 500 aa  168  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  33.79 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  36.43 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  32.41 
 
 		 687 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  30.65 
 
 		 487 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  33.75 
 
 		 327 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  35.12 
 
 		 406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  31.45 
 
 		 426 aa  163  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  29.31 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  30.59 
 
 		 364 aa  159  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  34.84 
 
 		 321 aa  156  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  30.59 
 
 		 659 aa  154  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  33.13 
 
 		 404 aa  152  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  34.74 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  36.03 
 
 		 343 aa  149  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  30.75 
 
 		 621 aa  149  9e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  30.63 
 
 		 360 aa  146  6e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  36.25 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  34.17 
 
 		 375 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  33.12 
 
 		 331 aa  143  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  34.44 
 
 		 388 aa  143  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  34.44 
 
 		 404 aa  143  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  35.92 
 
 		 369 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  35.69 
 
 		 374 aa  142  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  29.75 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0223  Histone deacetylase  31.18 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.195671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  30.28 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2932  histone deacetylase  38.46 
 
 		 528 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00716511 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0778  histone deacetylase superfamily  31.27 
 
 		 435 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1405  histone deacetylase superfamily protein  32.5 
 
 		 478 aa  136  8e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  37.33 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  38.07 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  29.36 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0697  histone deacetylase superfamily protein  34.62 
 
 		 357 aa  133  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.22424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4058  histone deacetylase superfamily protein  38.46 
 
 		 438 aa  133  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>