More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0653 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  100 
 
 		 406 aa  831    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  71.99 
 
 		 404 aa  551  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  56.9 
 
 		 404 aa  435  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  58.59 
 
 		 388 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  42.47 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  44.02 
 
 		 374 aa  272  7e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  35.9 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  40.9 
 
 		 390 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  40.62 
 
 		 369 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  40.06 
 
 		 369 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  36.09 
 
 		 385 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0697  histone deacetylase superfamily protein  34.69 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.22424  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  35.17 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  35.17 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  35.06 
 
 		 370 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  33.02 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  37.11 
 
 		 487 aa  180  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  33.02 
 
 		 388 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  35.45 
 
 		 426 aa  178  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  32.7 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  32.7 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  35.83 
 
 		 687 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  32.7 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  32.7 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  32.7 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  32.7 
 
 		 388 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  32.7 
 
 		 388 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  34.31 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  32.39 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  38.79 
 
 		 393 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  38.12 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  32.19 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  34.69 
 
 		 500 aa  174  2.9999999999999996e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  35.85 
 
 		 488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  36.79 
 
 		 424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  35.06 
 
 		 385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  38.53 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  34.04 
 
 		 381 aa  169  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  33.33 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  33.63 
 
 		 387 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  32.08 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  37.64 
 
 		 466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  36.97 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  31.17 
 
 		 389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  34.69 
 
 		 393 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  35.19 
 
 		 482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  35.94 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  34.63 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  37.42 
 
 		 393 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  35.12 
 
 		 410 aa  163  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  36.9 
 
 		 417 aa  163  5.0000000000000005e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  35.94 
 
 		 407 aa  163  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  30.03 
 
 		 396 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  36.28 
 
 		 387 aa  162  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  34.81 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  37.69 
 
 		 390 aa  160  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  31.83 
 
 		 475 aa  158  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  32.75 
 
 		 394 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  36.81 
 
 		 659 aa  157  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  36.22 
 
 		 435 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  31.5 
 
 		 378 aa  155  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  36.2 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  35.22 
 
 		 397 aa  153  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  36.42 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  34.41 
 
 		 327 aa  150  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  34.53 
 
 		 406 aa  149  7e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  34.64 
 
 		 321 aa  149  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  31.56 
 
 		 351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  35.76 
 
 		 621 aa  146  5e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  29.91 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  33.86 
 
 		 424 aa  145  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  29.91 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  30.05 
 
 		 378 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  35.24 
 
 		 393 aa  144  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  36.86 
 
 		 395 aa  143  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  30.4 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  37.02 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  34.91 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  34.87 
 
 		 411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  35.44 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  32.78 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  32.48 
 
 		 348 aa  134  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  31.19 
 
 		 374 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  34.67 
 
 		 360 aa  133  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  35.23 
 
 		 398 aa  129  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  31.07 
 
 		 341 aa  122  9e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  26.97 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  27.72 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  31.39 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  31.89 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  30.48 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  42.36 
 
 		 342 aa  113  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53146  predicted protein  31.51 
 
 		 398 aa  112  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87707  predicted protein  30.75 
 
 		 480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  42.68 
 
 		 346 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  37.84 
 
 		 341 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1532  histone deacetylase superfamily  29.43 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2562  Histone deacetylase  28.72 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3551  histone deacetylase superfamily  28.72 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2506  histone deacetylase superfamily  34.84 
 
 		 296 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>