More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0962 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 321 aa  665    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  56.15 
 
 		 327 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  47.1 
 
 		 315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  41.29 
 
 		 374 aa  229  6e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  37.62 
 
 		 370 aa  216  4e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  38.12 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  38.63 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  37.66 
 
 		 388 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  37.38 
 
 		 388 aa  202  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  37.38 
 
 		 388 aa  202  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  37.38 
 
 		 388 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  37.38 
 
 		 388 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  37.38 
 
 		 388 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  37.66 
 
 		 388 aa  202  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  37.38 
 
 		 388 aa  202  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  37.38 
 
 		 388 aa  202  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  37.38 
 
 		 388 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  37.5 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  37.42 
 
 		 389 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  39.05 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  34.52 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  37.14 
 
 		 406 aa  189  4e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  38.1 
 
 		 387 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  36.96 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  37.03 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  37.91 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  37.81 
 
 		 393 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  34.92 
 
 		 417 aa  179  5.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  36.42 
 
 		 378 aa  177  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  36.79 
 
 		 393 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  34.49 
 
 		 392 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  36.51 
 
 		 387 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  35.39 
 
 		 407 aa  175  7e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  34.07 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  36.71 
 
 		 412 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  34.84 
 
 		 410 aa  170  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  33.75 
 
 		 426 aa  170  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  35.69 
 
 		 390 aa  169  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  33.85 
 
 		 424 aa  169  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  36.33 
 
 		 378 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  37.5 
 
 		 393 aa  168  9e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  38.15 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  31.78 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  31.78 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  38.22 
 
 		 406 aa  166  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  33.44 
 
 		 385 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  34.01 
 
 		 414 aa  165  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  36.08 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  34.77 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  38.8 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  35.92 
 
 		 411 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  34.64 
 
 		 406 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  33.99 
 
 		 316 aa  162  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  32.81 
 
 		 383 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  35.08 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  34.62 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  32.06 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  35.31 
 
 		 394 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  32.06 
 
 		 385 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  31.85 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  34.08 
 
 		 385 aa  152  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  35.52 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  30.89 
 
 		 453 aa  150  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  33.12 
 
 		 404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  36.04 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  32.86 
 
 		 344 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  30.13 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  34.42 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  32.7 
 
 		 390 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  33.78 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  32.04 
 
 		 404 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  32.04 
 
 		 388 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  31.82 
 
 		 398 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  32.97 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  28.98 
 
 		 487 aa  137  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  29.71 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  34.11 
 
 		 310 aa  135  9e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  29.8 
 
 		 306 aa  135  9e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  35.17 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  32.65 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  31.48 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  32.12 
 
 		 381 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  33.93 
 
 		 307 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  37.44 
 
 		 369 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2090  Histone deacetylase  34.44 
 
 		 345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  31.97 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  33.93 
 
 		 324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  29.26 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  34.53 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  30 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  29.37 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  31.18 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  31.46 
 
 		 426 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  29.39 
 
 		 375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  32.48 
 
 		 659 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  34.27 
 
 		 307 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  28.03 
 
 		 488 aa  129  9.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  33.11 
 
 		 309 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  28.71 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  31.63 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>