More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2090 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2090  Histone deacetylase  100 
 
 		 345 aa  697    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1556  histone deacetylase superfamily protein  59.19 
 
 		 341 aa  381  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  37.54 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  41.37 
 
 		 370 aa  180  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  38.72 
 
 		 351 aa  175  9e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  38.18 
 
 		 348 aa  172  5.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  33.45 
 
 		 378 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  33.96 
 
 		 364 aa  149  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  33.77 
 
 		 417 aa  146  6e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  31.65 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  34.27 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  32.23 
 
 		 393 aa  142  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  36.81 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  34.36 
 
 		 387 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  32.16 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  36.29 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  30.51 
 
 		 385 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  32.45 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  30.96 
 
 		 385 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  31.02 
 
 		 392 aa  138  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  31.8 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  31.21 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  32.69 
 
 		 378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  31.35 
 
 		 407 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  35.52 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  35.52 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  28.65 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  32.26 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  34.11 
 
 		 396 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  33.97 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  33.73 
 
 		 659 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  35.48 
 
 		 315 aa  133  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  31.56 
 
 		 344 aa  132  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  29.64 
 
 		 393 aa  132  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  35.14 
 
 		 388 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  34.75 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  34.75 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  34.75 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  34.75 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  33.2 
 
 		 621 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  34.75 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  34.75 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  34.44 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  32.36 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  33.72 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  31.16 
 
 		 453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  29.48 
 
 		 334 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  34.36 
 
 		 388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  36.05 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  34.13 
 
 		 378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  32.35 
 
 		 396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  31.6 
 
 		 394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  30.36 
 
 		 403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  33.84 
 
 		 388 aa  126  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  30.82 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  34.92 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  29.49 
 
 		 424 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  33.2 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  33.2 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  30.77 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  32.56 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  32.34 
 
 		 374 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  32.8 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  31.69 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  30.56 
 
 		 410 aa  123  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  34.24 
 
 		 315 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  30.88 
 
 		 370 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  36 
 
 		 372 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  37.77 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  28.81 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  32.51 
 
 		 369 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1746  histone deacetylase superfamily protein  38.51 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.115562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  32.37 
 
 		 380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  29.61 
 
 		 394 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  27.82 
 
 		 411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  34.13 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  32.01 
 
 		 380 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  31.71 
 
 		 344 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  35.89 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  31.4 
 
 		 328 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  29.63 
 
 		 381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  31.15 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  30.89 
 
 		 426 aa  117  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  35.06 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  32.21 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  28.08 
 
 		 414 aa  115  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  38.82 
 
 		 306 aa  115  8.999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  41.83 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  35.08 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  38.55 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  39.76 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  37.71 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  30.66 
 
 		 500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  31.52 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  32.51 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  31.88 
 
 		 466 aa  114  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  43.14 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  27.57 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  36.84 
 
 		 336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  30.88 
 
 		 369 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>