More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1556 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1556  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 341 aa  690    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0460927 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2090  Histone deacetylase  59.32 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  35.78 
 
 		 360 aa  186  6e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  34.97 
 
 		 351 aa  159  6e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  34.68 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  33.72 
 
 		 417 aa  151  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  33.11 
 
 		 393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  34.55 
 
 		 348 aa  145  8.000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  32.67 
 
 		 393 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  33 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  33.33 
 
 		 388 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  30.68 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  33.33 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  33.01 
 
 		 388 aa  139  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  33.01 
 
 		 388 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  33.01 
 
 		 388 aa  139  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  33.01 
 
 		 388 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  33.01 
 
 		 388 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  33.01 
 
 		 388 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  33.11 
 
 		 387 aa  139  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  35.55 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  35.55 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  32.68 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  31.87 
 
 		 385 aa  136  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  33.22 
 
 		 397 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  33.01 
 
 		 388 aa  136  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  31.25 
 
 		 407 aa  136  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  32.23 
 
 		 385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  33.33 
 
 		 378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  33.22 
 
 		 388 aa  133  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  31 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  30.97 
 
 		 424 aa  132  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  32.01 
 
 		 403 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  30.14 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  31.63 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  31.01 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  31.4 
 
 		 394 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  30.14 
 
 		 383 aa  129  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  32.13 
 
 		 385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  33.33 
 
 		 370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  29.41 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  32.31 
 
 		 621 aa  127  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  32.09 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  30.94 
 
 		 406 aa  125  9e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  34.08 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  28.78 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  32.34 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  31.54 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  29.47 
 
 		 379 aa  124  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  32.62 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  34.88 
 
 		 412 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  33.33 
 
 		 378 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  32.12 
 
 		 435 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  35.11 
 
 		 389 aa  123  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  35.11 
 
 		 389 aa  123  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  32.81 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  31.62 
 
 		 385 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  31.88 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  29.8 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  27.96 
 
 		 453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  31.56 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  30.65 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  34.5 
 
 		 426 aa  119  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  30.23 
 
 		 369 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  39.08 
 
 		 392 aa  119  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  30.1 
 
 		 369 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  29.08 
 
 		 500 aa  117  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  33.08 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  31.1 
 
 		 466 aa  117  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  28.84 
 
 		 426 aa  117  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  32.46 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  30.31 
 
 		 659 aa  116  6e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  29.15 
 
 		 381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  32.68 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  29.84 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  37.19 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  30.82 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  29.84 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  32.95 
 
 		 309 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  28.72 
 
 		 487 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  31.23 
 
 		 410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  29.96 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  30.82 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  27.95 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  30.67 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  30.83 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  39.22 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  28.9 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  33.2 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  37.37 
 
 		 343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  40.52 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  32.66 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  30.3 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  29.27 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  29.03 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  30.36 
 
 		 359 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  31.13 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  33.21 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  37.35 
 
 		 346 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  30.17 
 
 		 380 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>