More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0246 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 392 aa  783    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  63.68 
 
 		 387 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  62.27 
 
 		 387 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  58.97 
 
 		 394 aa  443  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  62.31 
 
 		 412 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  59.74 
 
 		 392 aa  435  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  56.03 
 
 		 426 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  58.44 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  53.33 
 
 		 407 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  55.64 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  55.38 
 
 		 393 aa  398  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  56.54 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  54.02 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  51.69 
 
 		 403 aa  392  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  56.36 
 
 		 393 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  55.32 
 
 		 393 aa  388  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  56.05 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  55.5 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  55.61 
 
 		 411 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  55.09 
 
 		 394 aa  381  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  54.12 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  52.86 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  54.55 
 
 		 393 aa  361  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  52.53 
 
 		 398 aa  358  8e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  47.91 
 
 		 406 aa  356  5e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  47.61 
 
 		 410 aa  342  5.999999999999999e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  48.03 
 
 		 414 aa  332  8e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  48.12 
 
 		 424 aa  323  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  48.31 
 
 		 387 aa  279  7e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  41.39 
 
 		 396 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  41.16 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  39.17 
 
 		 388 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  40.17 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  43.73 
 
 		 370 aa  264  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  38.33 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  40.46 
 
 		 388 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  39.17 
 
 		 388 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  40.46 
 
 		 388 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  39.17 
 
 		 388 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  39.17 
 
 		 388 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  40.46 
 
 		 388 aa  262  8e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  38.61 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  40.17 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  39.22 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  41.52 
 
 		 378 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  38.07 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  39.16 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  43.06 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  39.27 
 
 		 385 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  42.07 
 
 		 378 aa  227  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  37.07 
 
 		 389 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  37.07 
 
 		 389 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  36.91 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  38.56 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  38.56 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  41.79 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  36.1 
 
 		 381 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  35.67 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  35.69 
 
 		 453 aa  183  4.0000000000000006e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  32.58 
 
 		 424 aa  176  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  33.53 
 
 		 426 aa  173  5.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  33.44 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  32.02 
 
 		 466 aa  170  5e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  34.52 
 
 		 404 aa  169  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  36.97 
 
 		 406 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  34.49 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  36.1 
 
 		 482 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  32.33 
 
 		 500 aa  164  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  31.02 
 
 		 475 aa  162  9e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  33.23 
 
 		 687 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  34.1 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  31.07 
 
 		 488 aa  160  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  34.1 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  34.18 
 
 		 426 aa  159  8e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  33.46 
 
 		 315 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  33.12 
 
 		 487 aa  158  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  33.15 
 
 		 659 aa  157  4e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  38.01 
 
 		 621 aa  152  8e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  35.35 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  31.99 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  35.31 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0778  histone deacetylase superfamily  43.09 
 
 		 435 aa  150  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  37.66 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  35.33 
 
 		 314 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2932  histone deacetylase  41.45 
 
 		 528 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00716511 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0223  Histone deacetylase  43.52 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.195671 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  37.84 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  35.13 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  41.47 
 
 		 343 aa  143  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  34.38 
 
 		 375 aa  143  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  36.89 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  36.89 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1009  Histone deacetylase  48.05 
 
 		 450 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3163  histone deacetylase superfamily protein  38.5 
 
 		 438 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  33.11 
 
 		 344 aa  139  6e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0126  histone deacetylase superfamily  44.09 
 
 		 473 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  35.05 
 
 		 309 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  27.41 
 
 		 438 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  34.11 
 
 		 380 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  34.45 
 
 		 380 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>