More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0430 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  100 
 
 		 390 aa  756    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  60.31 
 
 		 406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  60.1 
 
 		 395 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  62.27 
 
 		 398 aa  431  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  55.1 
 
 		 403 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  53.57 
 
 		 407 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  58.35 
 
 		 394 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  55.53 
 
 		 411 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  55.5 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  53.87 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  55.13 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  52.16 
 
 		 412 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  51.23 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  52.99 
 
 		 387 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  52 
 
 		 426 aa  378  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  51 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  53.51 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  51.16 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  49.35 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  50.78 
 
 		 396 aa  352  8.999999999999999e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  49.49 
 
 		 393 aa  349  4e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  51.17 
 
 		 397 aa  345  5e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  49.13 
 
 		 424 aa  344  1e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  49.87 
 
 		 393 aa  344  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  48.71 
 
 		 393 aa  335  5.999999999999999e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  46.08 
 
 		 410 aa  325  6e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  46.82 
 
 		 393 aa  323  4e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  46.47 
 
 		 414 aa  306  3e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  46.22 
 
 		 387 aa  286  5e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  43.24 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  40.66 
 
 		 396 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  38.67 
 
 		 388 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  39.27 
 
 		 388 aa  252  7e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  38.44 
 
 		 388 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  39.4 
 
 		 388 aa  250  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  37.84 
 
 		 388 aa  249  8e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  37.84 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  37.76 
 
 		 388 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  37.76 
 
 		 388 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  37.84 
 
 		 388 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  37.76 
 
 		 388 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  37.76 
 
 		 388 aa  245  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  38.94 
 
 		 370 aa  239  9e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  39.84 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  36.06 
 
 		 389 aa  216  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  36.06 
 
 		 389 aa  216  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  39.46 
 
 		 378 aa  210  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  37.24 
 
 		 378 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  33.96 
 
 		 351 aa  208  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  34.78 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  33.94 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  34.21 
 
 		 385 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  33.42 
 
 		 385 aa  188  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  33.95 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  31.82 
 
 		 381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  33.95 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  35.19 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  36.76 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  37.69 
 
 		 406 aa  173  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  35.36 
 
 		 348 aa  172  7.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  36.62 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  31.93 
 
 		 426 aa  162  8.000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  32.25 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  35.2 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  30.06 
 
 		 659 aa  149  7e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  36.28 
 
 		 388 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  36.28 
 
 		 404 aa  149  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  31.58 
 
 		 487 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  29.93 
 
 		 438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  37.37 
 
 		 390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  36.11 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  32 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  30.3 
 
 		 424 aa  143  6e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4058  histone deacetylase superfamily protein  35.32 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  30.18 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  35.2 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0223  Histone deacetylase  37.61 
 
 		 446 aa  139  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.195671 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  36.63 
 
 		 309 aa  139  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  33.12 
 
 		 426 aa  138  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3163  histone deacetylase superfamily protein  33.85 
 
 		 438 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114353  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  34.06 
 
 		 482 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 466 aa  137  4e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  28.57 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  38.7 
 
 		 369 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  32.19 
 
 		 621 aa  136  8e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  35.2 
 
 		 379 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  29.87 
 
 		 488 aa  135  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  30.94 
 
 		 475 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  34.58 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  29.61 
 
 		 687 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  36 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2337  histone deacetylase family protein  37.71 
 
 		 439 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  34.87 
 
 		 308 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  38.01 
 
 		 369 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2932  histone deacetylase  35.29 
 
 		 528 aa  133  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00716511 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1405  histone deacetylase superfamily protein  37.33 
 
 		 478 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1009  Histone deacetylase  36.61 
 
 		 450 aa  132  9e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  36 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  35.69 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0976  hypothetical protein  35.68 
 
 		 448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>