More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2732 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  100 
 
 		 396 aa  827    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  83.72 
 
 		 389 aa  689    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  70.94 
 
 		 388 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  71.47 
 
 		 388 aa  593  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  70.94 
 
 		 388 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  70.94 
 
 		 388 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  70.94 
 
 		 388 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  70.68 
 
 		 388 aa  590  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  70.68 
 
 		 388 aa  590  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  70.42 
 
 		 388 aa  588  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  70.42 
 
 		 388 aa  590  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  70.42 
 
 		 388 aa  588  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  69.45 
 
 		 388 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  49.18 
 
 		 389 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  49.18 
 
 		 389 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  48.77 
 
 		 387 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  46.4 
 
 		 378 aa  312  6.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  44.44 
 
 		 426 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  44.44 
 
 		 435 aa  285  7e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  39.33 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  39.89 
 
 		 378 aa  279  7e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  39.41 
 
 		 378 aa  277  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  43.49 
 
 		 406 aa  277  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  41.39 
 
 		 392 aa  278  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  43.07 
 
 		 417 aa  276  3e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  43.18 
 
 		 412 aa  276  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  39.59 
 
 		 393 aa  276  7e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  40.15 
 
 		 387 aa  275  8e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  41.86 
 
 		 370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  41.07 
 
 		 424 aa  273  5.000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  41.84 
 
 		 394 aa  272  8.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  41.69 
 
 		 395 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  41.14 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  40.83 
 
 		 393 aa  270  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  41.57 
 
 		 393 aa  269  8e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  40 
 
 		 403 aa  266  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  39.69 
 
 		 393 aa  265  7e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  42.24 
 
 		 407 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  41.09 
 
 		 411 aa  264  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  39.7 
 
 		 410 aa  262  6.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  38.21 
 
 		 406 aa  258  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  41.12 
 
 		 394 aa  257  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  37.75 
 
 		 414 aa  256  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  39.33 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  42.68 
 
 		 392 aa  252  7e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  40.95 
 
 		 396 aa  245  8e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  40.66 
 
 		 390 aa  243  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  36.48 
 
 		 385 aa  230  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  40.43 
 
 		 398 aa  229  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  38.64 
 
 		 385 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  38.64 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  37.98 
 
 		 383 aa  219  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  36.36 
 
 		 351 aa  219  8.999999999999998e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  36.98 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  38.05 
 
 		 385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  40.87 
 
 		 385 aa  212  9e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  36.72 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  38.12 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  37.1 
 
 		 348 aa  185  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  35.79 
 
 		 315 aa  184  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  33.43 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  32.42 
 
 		 453 aa  180  4e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  33.94 
 
 		 388 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  32.4 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  33.94 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  33.13 
 
 		 390 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  34.25 
 
 		 369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  32.29 
 
 		 404 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  37.99 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  33.94 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  34.33 
 
 		 331 aa  164  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  31.75 
 
 		 487 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  30.79 
 
 		 424 aa  163  6e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  30.03 
 
 		 406 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  32.16 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  30.82 
 
 		 500 aa  158  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  29.41 
 
 		 488 aa  156  5.0000000000000005e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  31.44 
 
 		 659 aa  156  7e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  30.93 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  36.74 
 
 		 360 aa  153  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  29.45 
 
 		 364 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  28.57 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  29.97 
 
 		 687 aa  150  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  34.8 
 
 		 621 aa  150  3e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  30.32 
 
 		 466 aa  150  5e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  34.38 
 
 		 343 aa  149  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  32.47 
 
 		 475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  32.01 
 
 		 374 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  31.74 
 
 		 369 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  31.36 
 
 		 345 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0697  histone deacetylase superfamily protein  31.88 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.22424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  31.86 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  32.08 
 
 		 369 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  32.08 
 
 		 369 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  32.31 
 
 		 346 aa  143  6e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  30.07 
 
 		 344 aa  142  9e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  31.21 
 
 		 370 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  31.79 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  31.74 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  30 
 
 		 380 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>