More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1014 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 387 aa  785    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  50.9 
 
 		 389 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  48.28 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  45.57 
 
 		 388 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  45.57 
 
 		 388 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  45.57 
 
 		 388 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  45.57 
 
 		 388 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  46.3 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  45.83 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  45.57 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  46.56 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  46.56 
 
 		 388 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  46.56 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  45.97 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  49.58 
 
 		 393 aa  310  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  46.37 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  42.13 
 
 		 389 aa  305  6e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  42.13 
 
 		 389 aa  305  6e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  49.26 
 
 		 394 aa  302  5.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  49.25 
 
 		 435 aa  300  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  48.88 
 
 		 406 aa  298  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  48.82 
 
 		 397 aa  296  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  51.36 
 
 		 387 aa  296  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  46.35 
 
 		 407 aa  295  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  48.59 
 
 		 412 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  45.08 
 
 		 378 aa  295  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  47.46 
 
 		 393 aa  293  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  47.11 
 
 		 403 aa  293  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  48.38 
 
 		 393 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  48.22 
 
 		 392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  43.73 
 
 		 378 aa  289  5.0000000000000004e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  44.44 
 
 		 394 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  47.46 
 
 		 426 aa  286  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  43.31 
 
 		 378 aa  286  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  45.52 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  46.45 
 
 		 417 aa  283  4.0000000000000003e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  47.48 
 
 		 410 aa  280  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  48.31 
 
 		 392 aa  279  6e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  46.22 
 
 		 390 aa  277  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  47.08 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  48.17 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  42.58 
 
 		 406 aa  270  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  41.76 
 
 		 370 aa  270  4e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  43.99 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  48.92 
 
 		 398 aa  263  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  43.86 
 
 		 424 aa  261  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  43.82 
 
 		 383 aa  260  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  42.43 
 
 		 385 aa  259  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  45.31 
 
 		 411 aa  253  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  46.23 
 
 		 414 aa  250  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  43.03 
 
 		 385 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  43.03 
 
 		 385 aa  247  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  42.43 
 
 		 385 aa  244  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  42.73 
 
 		 385 aa  237  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  40.77 
 
 		 381 aa  219  7e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  36.36 
 
 		 351 aa  216  7e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  43.01 
 
 		 348 aa  215  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  36.76 
 
 		 374 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  38.01 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  37.46 
 
 		 404 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  37.46 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  33.94 
 
 		 453 aa  186  4e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  35.67 
 
 		 327 aa  186  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  37.91 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  32.65 
 
 		 487 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  37.36 
 
 		 475 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  32.93 
 
 		 424 aa  172  9e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  33.73 
 
 		 404 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  31.3 
 
 		 426 aa  169  6e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  32.16 
 
 		 488 aa  169  7e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  32.66 
 
 		 482 aa  169  8e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  33.63 
 
 		 406 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  32.34 
 
 		 500 aa  167  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  30.77 
 
 		 659 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  34.6 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  33.99 
 
 		 369 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  30.5 
 
 		 379 aa  164  3e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  34.59 
 
 		 466 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  33.71 
 
 		 369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  33.54 
 
 		 687 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  33.53 
 
 		 621 aa  157  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  30.93 
 
 		 426 aa  155  9e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  31.68 
 
 		 316 aa  153  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  34.49 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  33.33 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  40.28 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  34.49 
 
 		 369 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  34.49 
 
 		 369 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  33.45 
 
 		 379 aa  149  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  33.23 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  35.99 
 
 		 365 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  35.31 
 
 		 331 aa  146  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  33.75 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  33.8 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  32.9 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  33.45 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  34.15 
 
 		 340 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  36.59 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  34.4 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  33.09 
 
 		 306 aa  143  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>