More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0250 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  100 
 
 		 387 aa  778    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  78.04 
 
 		 387 aa  633  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  69.05 
 
 		 392 aa  518  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  66.33 
 
 		 412 aa  502  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  66.84 
 
 		 396 aa  498  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  63.68 
 
 		 392 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  63.38 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  58.35 
 
 		 407 aa  428  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  57.47 
 
 		 393 aa  423  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  57.07 
 
 		 406 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  57.29 
 
 		 394 aa  423  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  56.62 
 
 		 403 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  56.17 
 
 		 426 aa  411  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  56.22 
 
 		 406 aa  409  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  55.75 
 
 		 435 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  58.1 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  58.42 
 
 		 393 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  57.44 
 
 		 397 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  56.7 
 
 		 393 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  54.75 
 
 		 417 aa  393  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  54.38 
 
 		 411 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  53.37 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  53.85 
 
 		 390 aa  382  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  52.05 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  50.62 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  50.78 
 
 		 398 aa  350  4e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  49.63 
 
 		 424 aa  342  9e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  47.04 
 
 		 414 aa  324  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  51.36 
 
 		 387 aa  305  6e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  45.51 
 
 		 389 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  40.15 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  46.91 
 
 		 388 aa  280  4e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  44.38 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  44.38 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  44.69 
 
 		 388 aa  276  7e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  44.06 
 
 		 388 aa  275  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  44.06 
 
 		 388 aa  275  9e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  44.06 
 
 		 388 aa  275  9e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  44.06 
 
 		 388 aa  275  9e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  44.06 
 
 		 388 aa  275  9e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  44.38 
 
 		 388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  44.06 
 
 		 388 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  43.68 
 
 		 370 aa  271  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  38.07 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  38.07 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  42.04 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  38.08 
 
 		 385 aa  229  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  39.62 
 
 		 351 aa  227  3e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  37.01 
 
 		 383 aa  226  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  42.42 
 
 		 378 aa  222  8e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  42.09 
 
 		 378 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  38.16 
 
 		 385 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  35.75 
 
 		 385 aa  206  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  40.34 
 
 		 348 aa  205  9e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  37.96 
 
 		 374 aa  205  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  35.75 
 
 		 385 aa  202  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  35.75 
 
 		 385 aa  202  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  36.81 
 
 		 453 aa  196  5.000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  39.81 
 
 		 381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  34.88 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  35.64 
 
 		 482 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  31.94 
 
 		 466 aa  177  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  31.87 
 
 		 488 aa  176  8e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  38.56 
 
 		 388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  38.56 
 
 		 404 aa  173  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  31.49 
 
 		 687 aa  172  6.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  36.51 
 
 		 321 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  37.7 
 
 		 426 aa  171  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  34.91 
 
 		 327 aa  170  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  31.92 
 
 		 426 aa  169  7e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  30.6 
 
 		 487 aa  169  7e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  36.28 
 
 		 406 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  32.66 
 
 		 659 aa  169  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  34.98 
 
 		 315 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  32.54 
 
 		 424 aa  167  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  29.92 
 
 		 500 aa  167  4e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  34.06 
 
 		 379 aa  166  6.9999999999999995e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  36.08 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  36.98 
 
 		 621 aa  158  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  33.54 
 
 		 360 aa  159  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  37.63 
 
 		 379 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  37.19 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  31.1 
 
 		 364 aa  152  8e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  36.96 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  34.56 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  35.81 
 
 		 380 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  38.1 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  38.08 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  36.57 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  35.16 
 
 		 380 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  35.83 
 
 		 365 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  33.55 
 
 		 369 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  34.43 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  37.19 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  33.44 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  34.44 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  34.73 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  34.73 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  33.33 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  32.68 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>