More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3338 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  90.46 
 
 
388 aa  743    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  89.95 
 
 
388 aa  741    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  90.21 
 
 
388 aa  740    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  90.46 
 
 
388 aa  743    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  89.69 
 
 
388 aa  739    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  90.72 
 
 
388 aa  744    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  90.21 
 
 
388 aa  742    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  89.18 
 
 
388 aa  732    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  90.21 
 
 
388 aa  741    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  90.46 
 
 
388 aa  743    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 
388 aa  813    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  69.45 
 
 
396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  68.32 
 
 
389 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  50.39 
 
 
389 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  50.39 
 
 
389 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  45.97 
 
 
387 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  45 
 
 
378 aa  314  9.999999999999999e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  40.79 
 
 
378 aa  300  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  41.33 
 
 
378 aa  288  8e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  43.57 
 
 
417 aa  285  7e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  40.74 
 
 
370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  43.53 
 
 
426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  43.54 
 
 
435 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  42.61 
 
 
394 aa  273  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  44.35 
 
 
387 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  39.43 
 
 
406 aa  272  6e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  40.9 
 
 
406 aa  272  6e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  41.83 
 
 
393 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  42.69 
 
 
407 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  41.59 
 
 
424 aa  270  4e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  40.95 
 
 
393 aa  270  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  46.91 
 
 
387 aa  269  8e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  39.62 
 
 
403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  43.41 
 
 
410 aa  265  8e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  40.28 
 
 
393 aa  263  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  40.17 
 
 
392 aa  261  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  40.18 
 
 
397 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  42.14 
 
 
393 aa  259  7e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  41.33 
 
 
414 aa  257  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  38.9 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  42.81 
 
 
412 aa  253  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  42.12 
 
 
392 aa  252  6e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  41.64 
 
 
411 aa  252  6e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  40.28 
 
 
393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  39.58 
 
 
394 aa  243  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  39.4 
 
 
390 aa  239  6.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  44.16 
 
 
396 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  40.9 
 
 
385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  41.37 
 
 
374 aa  228  9e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  38.51 
 
 
385 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  39.71 
 
 
383 aa  225  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  38.51 
 
 
385 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  37.56 
 
 
385 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  36.1 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  35.05 
 
 
398 aa  218  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  34.6 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  36.6 
 
 
381 aa  206  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  38.63 
 
 
321 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  39.64 
 
 
315 aa  192  9e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  38.62 
 
 
348 aa  191  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  34.35 
 
 
453 aa  189  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  33.54 
 
 
379 aa  182  9.000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  32.63 
 
 
424 aa  178  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  32.29 
 
 
327 aa  177  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  33.54 
 
 
404 aa  176  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  33.54 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  32.32 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  32.19 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  30.62 
 
 
426 aa  169  6e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  29.12 
 
 
500 aa  167  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  32.61 
 
 
375 aa  166  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  30.84 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  35.94 
 
 
475 aa  162  7e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  32.85 
 
 
621 aa  162  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  32.05 
 
 
487 aa  161  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  30.43 
 
 
426 aa  160  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  32.45 
 
 
466 aa  159  9e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  32.52 
 
 
369 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  32.53 
 
 
331 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  26.99 
 
 
488 aa  158  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  32.38 
 
 
369 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  29.31 
 
 
374 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  36.26 
 
 
360 aa  157  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  37.81 
 
 
306 aa  157  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  35.66 
 
 
659 aa  155  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  30.91 
 
 
687 aa  153  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0432727 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  33.33 
 
 
482 aa  151  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  32.2 
 
 
379 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  29.34 
 
 
364 aa  149  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  34.5 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  32.57 
 
 
316 aa  146  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  30.21 
 
 
344 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  35.17 
 
 
309 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  31.39 
 
 
345 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  33.33 
 
 
369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  34.48 
 
 
309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  32.99 
 
 
369 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  32.99 
 
 
369 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1009  Histone deacetylase  33.54 
 
 
450 aa  140  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  33.01 
 
 
309 aa  139  7e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>