More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0708 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  100 
 
 
389 aa  809    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  83.72 
 
 
396 aa  689    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  68.57 
 
 
388 aa  578  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  68.83 
 
 
388 aa  577  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  69.09 
 
 
388 aa  578  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  68.31 
 
 
388 aa  578  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  68.31 
 
 
388 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  68.31 
 
 
388 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  68.83 
 
 
388 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  68.57 
 
 
388 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  68.05 
 
 
388 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  68.31 
 
 
388 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  68.32 
 
 
388 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  49.06 
 
 
389 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  49.06 
 
 
389 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  50 
 
 
387 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  47.23 
 
 
378 aa  311  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  45.2 
 
 
387 aa  298  8e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  45.48 
 
 
435 aa  292  7e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  45.51 
 
 
387 aa  289  6e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  41.16 
 
 
378 aa  288  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  46.77 
 
 
426 aa  288  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  45.07 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  45.24 
 
 
394 aa  282  8.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  43.82 
 
 
393 aa  279  7e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  44.61 
 
 
393 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  41.79 
 
 
393 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  45.51 
 
 
406 aa  275  7e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  43.2 
 
 
417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  44.64 
 
 
412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  41.86 
 
 
370 aa  273  3e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  41.32 
 
 
410 aa  272  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  42.49 
 
 
393 aa  272  8.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  42.86 
 
 
407 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  41.54 
 
 
406 aa  271  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  41.16 
 
 
392 aa  271  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  42.25 
 
 
424 aa  269  5e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  42.9 
 
 
395 aa  268  8.999999999999999e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  41.09 
 
 
403 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  43.06 
 
 
411 aa  265  7e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  40.16 
 
 
378 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  43.66 
 
 
392 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  42.6 
 
 
394 aa  257  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  43.24 
 
 
390 aa  255  8e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  43.06 
 
 
393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  41.84 
 
 
414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  42.94 
 
 
396 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  37.14 
 
 
385 aa  229  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  40.3 
 
 
398 aa  226  7e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  36.53 
 
 
351 aa  225  1e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  38.12 
 
 
374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  36.21 
 
 
383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  37.4 
 
 
385 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  35.71 
 
 
385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  35.71 
 
 
385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  39.53 
 
 
381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  40.59 
 
 
385 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  37.98 
 
 
348 aa  194  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  37.19 
 
 
321 aa  187  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  34.83 
 
 
315 aa  184  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  32.81 
 
 
453 aa  183  4.0000000000000006e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  33.86 
 
 
404 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  33.86 
 
 
388 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  30.36 
 
 
379 aa  177  4e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  35 
 
 
327 aa  176  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  32.72 
 
 
426 aa  170  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  32.06 
 
 
487 aa  168  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  35.08 
 
 
331 aa  168  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  29.71 
 
 
426 aa  166  5e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  32.81 
 
 
390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  31.17 
 
 
406 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  30 
 
 
424 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  30.69 
 
 
659 aa  162  7e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  35.4 
 
 
306 aa  162  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  30.67 
 
 
404 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  36.1 
 
 
360 aa  159  8e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  29.97 
 
 
364 aa  159  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  32.05 
 
 
488 aa  158  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  30.16 
 
 
500 aa  157  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  33.74 
 
 
369 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  32.97 
 
 
475 aa  156  7e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  34.24 
 
 
369 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  28.43 
 
 
621 aa  154  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  30.06 
 
 
687 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  29.23 
 
 
466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  31.99 
 
 
375 aa  153  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  28.46 
 
 
482 aa  149  6e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  33.92 
 
 
369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  30.67 
 
 
344 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  34.83 
 
 
369 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  35.57 
 
 
369 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  35.57 
 
 
369 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  32.49 
 
 
374 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  34.98 
 
 
343 aa  143  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  34.78 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  32.67 
 
 
369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  30.82 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  29.01 
 
 
379 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  31.38 
 
 
380 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  31.25 
 
 
370 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>