More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3274 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 
375 aa  751    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  70.59 
 
 
374 aa  510  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  67.77 
 
 
390 aa  474  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  66.76 
 
 
369 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  66.2 
 
 
369 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0697  histone deacetylase superfamily protein  45.86 
 
 
357 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.22424  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  43.16 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  43.16 
 
 
388 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  42.47 
 
 
406 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  40.06 
 
 
404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  34.25 
 
 
379 aa  241  1e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  35.93 
 
 
383 aa  189  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  34.26 
 
 
385 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  34.98 
 
 
385 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  35.28 
 
 
385 aa  179  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  35.58 
 
 
385 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  35.28 
 
 
385 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  30.71 
 
 
388 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  31.12 
 
 
388 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  31.12 
 
 
388 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  31.12 
 
 
388 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  32.61 
 
 
388 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  32.61 
 
 
388 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  32.61 
 
 
388 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  32.61 
 
 
388 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  30.45 
 
 
388 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  31.12 
 
 
388 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  32.61 
 
 
388 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  32.02 
 
 
381 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  35.24 
 
 
397 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  34.29 
 
 
393 aa  156  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  32.61 
 
 
370 aa  155  8e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  30.93 
 
 
396 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  32.92 
 
 
403 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  31.06 
 
 
378 aa  155  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  34.7 
 
 
393 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  31.99 
 
 
389 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  33.66 
 
 
394 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  33.33 
 
 
387 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  31.87 
 
 
378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  35.26 
 
 
417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  36.04 
 
 
393 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  28.8 
 
 
453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  38.08 
 
 
396 aa  145  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  34.8 
 
 
392 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  32.08 
 
 
378 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  34.17 
 
 
410 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  30.77 
 
 
327 aa  143  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  35.02 
 
 
387 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  31.37 
 
 
407 aa  143  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  34.38 
 
 
392 aa  143  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  34.58 
 
 
435 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  33.77 
 
 
482 aa  142  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  35.08 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  34.14 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  33.7 
 
 
659 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  33.99 
 
 
406 aa  140  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  36.22 
 
 
412 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  31.19 
 
 
426 aa  139  8.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  30.45 
 
 
500 aa  137  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  35.16 
 
 
411 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  35.99 
 
 
393 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  30.83 
 
 
374 aa  135  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  28.25 
 
 
424 aa  135  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  36.36 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  30 
 
 
487 aa  134  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  34.31 
 
 
687 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  32.81 
 
 
426 aa  133  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  34.7 
 
 
424 aa  132  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  33.86 
 
 
426 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  31.6 
 
 
414 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  32.36 
 
 
621 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  35.2 
 
 
360 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  34.23 
 
 
475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  33.94 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  28.25 
 
 
351 aa  127  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  28.43 
 
 
389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  28.43 
 
 
389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  32.79 
 
 
466 aa  125  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  35.2 
 
 
390 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  33.75 
 
 
387 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  34.06 
 
 
395 aa  120  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  30.28 
 
 
364 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  31.27 
 
 
488 aa  119  7e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  29.93 
 
 
321 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1885  histone deacetylase superfamily protein  37.24 
 
 
451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  31.07 
 
 
345 aa  113  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53146  predicted protein  28.21 
 
 
398 aa  113  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  31.35 
 
 
379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  31.11 
 
 
379 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  32.62 
 
 
398 aa  109  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1009  Histone deacetylase  36 
 
 
450 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  29.77 
 
 
379 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2789  histone deacetylase superfamily protein  29.96 
 
 
298 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  30.51 
 
 
369 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6387  histone deacetylase superfamily protein  32.43 
 
 
298 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.006244  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  30.51 
 
 
369 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  28.84 
 
 
348 aa  104  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2127  Histone deacetylase  35.18 
 
 
447 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.003009  normal  0.054608 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  31.92 
 
 
336 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>