More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0507 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  100 
 
 		 395 aa  783    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  63.17 
 
 		 398 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  57.84 
 
 		 406 aa  439  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  60.1 
 
 		 390 aa  424  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  55.81 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  55.95 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  54.1 
 
 		 387 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  52.69 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  53.45 
 
 		 411 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  51.12 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  50.51 
 
 		 392 aa  382  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  52.3 
 
 		 412 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  52.62 
 
 		 435 aa  385  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  49.75 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  52.3 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  52.05 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  49.38 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  52.86 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  51.69 
 
 		 393 aa  363  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  49.48 
 
 		 406 aa  363  4e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  51.69 
 
 		 393 aa  355  6.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  51.02 
 
 		 393 aa  350  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  48.03 
 
 		 424 aa  348  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  46.88 
 
 		 410 aa  317  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  48.7 
 
 		 393 aa  316  5e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  46.63 
 
 		 397 aa  305  7e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  45.41 
 
 		 393 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  44.5 
 
 		 414 aa  287  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  48.17 
 
 		 387 aa  273  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  41.69 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  42.9 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  38.18 
 
 		 388 aa  256  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  37.89 
 
 		 388 aa  255  8e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  37.61 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  37.61 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  38.9 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  37.61 
 
 		 388 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  37.61 
 
 		 388 aa  254  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  37.61 
 
 		 388 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  37.61 
 
 		 388 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  37.61 
 
 		 388 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  37.89 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  37.28 
 
 		 370 aa  232  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  36.33 
 
 		 389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  36.33 
 
 		 389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  39.94 
 
 		 378 aa  210  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  40.29 
 
 		 378 aa  209  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  40.06 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  34.89 
 
 		 351 aa  193  5e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  35.57 
 
 		 385 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  36.75 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  36.21 
 
 		 385 aa  172  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  36.89 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  36.89 
 
 		 385 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  33.43 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  32.75 
 
 		 385 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  36.79 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  31.31 
 
 		 379 aa  159  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  33.89 
 
 		 381 aa  157  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  36.08 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  36.76 
 
 		 388 aa  150  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  34.04 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  36.76 
 
 		 404 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  29.36 
 
 		 453 aa  148  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  32.28 
 
 		 424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  31.93 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  36.86 
 
 		 406 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  31.49 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  29.62 
 
 		 364 aa  140  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  30.84 
 
 		 426 aa  139  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  32.48 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  32.85 
 
 		 475 aa  138  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  28.87 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  33.03 
 
 		 482 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  38.33 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2337  histone deacetylase family protein  33 
 
 		 439 aa  136  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  27.98 
 
 		 500 aa  135  9e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0223  Histone deacetylase  32.46 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.195671 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  27.63 
 
 		 466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  30 
 
 		 487 aa  133  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  29.94 
 
 		 659 aa  133  6e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  29.39 
 
 		 438 aa  132  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  33.45 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  32.34 
 
 		 360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2932  histone deacetylase  29.87 
 
 		 528 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00716511 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  27.3 
 
 		 488 aa  127  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  31.73 
 
 		 621 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  37.33 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  40.7 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0778  histone deacetylase superfamily  30.1 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0697  histone deacetylase superfamily protein  36.77 
 
 		 357 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.22424  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0976  hypothetical protein  32.77 
 
 		 448 aa  126  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22480  histone deacetylase superfamily  30.74 
 
 		 480 aa  126  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00877873  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  31.44 
 
 		 306 aa  126  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  33.7 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  34.06 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0989  histone deacetylase superfamily protein  33.65 
 
 		 437 aa  124  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  34.12 
 
 		 344 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3163  histone deacetylase superfamily protein  36.17 
 
 		 438 aa  123  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114353  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  32.59 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>