More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5005 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  100 
 
 
396 aa  799    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  74.68 
 
 
392 aa  578  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  69.41 
 
 
387 aa  531  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  67.17 
 
 
412 aa  510  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  66.84 
 
 
387 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  63.12 
 
 
394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  56.49 
 
 
406 aa  438  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  57.89 
 
 
426 aa  434  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  58.35 
 
 
393 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  58.02 
 
 
393 aa  423  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  56.39 
 
 
435 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  58.44 
 
 
392 aa  420  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  56.38 
 
 
394 aa  408  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  57.84 
 
 
393 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  52.81 
 
 
403 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  57.14 
 
 
397 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  51.52 
 
 
407 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  52.75 
 
 
417 aa  394  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  52.3 
 
 
395 aa  390  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  53.47 
 
 
411 aa  383  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  53.87 
 
 
393 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  51.03 
 
 
406 aa  363  2e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  54.73 
 
 
393 aa  363  3e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  53.09 
 
 
398 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  50.52 
 
 
390 aa  351  1e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  48.89 
 
 
410 aa  349  6e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  48.17 
 
 
424 aa  343  4e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  46.38 
 
 
414 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  47.08 
 
 
387 aa  287  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  42.94 
 
 
389 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  40.95 
 
 
396 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  43.66 
 
 
370 aa  258  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  44.16 
 
 
388 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  43 
 
 
388 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  43 
 
 
388 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  42.67 
 
 
388 aa  250  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  42.67 
 
 
388 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  42.67 
 
 
388 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  42.67 
 
 
388 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  42.67 
 
 
388 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  42.67 
 
 
388 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  42.67 
 
 
388 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  43 
 
 
388 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  37.47 
 
 
383 aa  226  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  39.68 
 
 
351 aa  219  5e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  37.93 
 
 
385 aa  219  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  38.81 
 
 
378 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  35.04 
 
 
389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  35.04 
 
 
389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  41.54 
 
 
385 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  39.76 
 
 
378 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  36.29 
 
 
385 aa  206  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  39.52 
 
 
378 aa  206  8e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  40.51 
 
 
385 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  40.19 
 
 
385 aa  202  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  40.06 
 
 
381 aa  195  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  40.21 
 
 
348 aa  187  3e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  36.28 
 
 
453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  35.13 
 
 
374 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  34.16 
 
 
475 aa  171  3e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  29.84 
 
 
466 aa  169  9e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  34.44 
 
 
379 aa  168  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  32.61 
 
 
659 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  35.06 
 
 
426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  31.87 
 
 
488 aa  162  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  35.87 
 
 
482 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  31.79 
 
 
487 aa  158  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  32.49 
 
 
500 aa  158  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  32.49 
 
 
360 aa  157  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  31.76 
 
 
424 aa  157  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  32.63 
 
 
426 aa  156  6e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  30.11 
 
 
364 aa  155  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  33.77 
 
 
316 aa  156  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  38.22 
 
 
404 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  38.34 
 
 
388 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  35.44 
 
 
406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  32.41 
 
 
687 aa  153  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  36.39 
 
 
375 aa  152  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  38 
 
 
344 aa  152  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  33.64 
 
 
404 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  35.78 
 
 
321 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  33.02 
 
 
327 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  38.97 
 
 
374 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  37.58 
 
 
369 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1009  Histone deacetylase  34 
 
 
450 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  42.2 
 
 
352 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  37.58 
 
 
369 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  36.55 
 
 
390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2932  histone deacetylase  40.36 
 
 
528 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00716511 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  32.79 
 
 
438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  36.84 
 
 
621 aa  146  6e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2127  Histone deacetylase  36.65 
 
 
447 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.003009  normal  0.054608 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0223  Histone deacetylase  34.66 
 
 
446 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.195671 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  30.53 
 
 
346 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  30.88 
 
 
315 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1885  histone deacetylase superfamily protein  33.11 
 
 
451 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  39.53 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  34.2 
 
 
380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  35.6 
 
 
336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  34.67 
 
 
343 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>