More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1739 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  81.56 
 
 		 385 aa  648    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 385 aa  792    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  71.95 
 
 		 385 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  70.98 
 
 		 385 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  70.71 
 
 		 385 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  65.25 
 
 		 383 aa  529  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  51.34 
 
 		 381 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  42.57 
 
 		 370 aa  256  6e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  42.43 
 
 		 387 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  39.63 
 
 		 378 aa  229  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  39.51 
 
 		 500 aa  229  8e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  39.16 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  37.56 
 
 		 388 aa  223  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  38.2 
 
 		 453 aa  223  4.9999999999999996e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  39.1 
 
 		 388 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  39.76 
 
 		 388 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  39.1 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  39.1 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  39.1 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  36.06 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  39.1 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  39.1 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  39.46 
 
 		 388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  36.36 
 
 		 417 aa  220  3.9999999999999997e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  39.46 
 
 		 388 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  39.46 
 
 		 388 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  35.75 
 
 		 403 aa  219  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  37.56 
 
 		 397 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  37.4 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  37.65 
 
 		 687 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  35.9 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  38.05 
 
 		 396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  34.49 
 
 		 393 aa  213  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  35.9 
 
 		 406 aa  212  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  40.84 
 
 		 435 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  36.07 
 
 		 378 aa  209  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  36.73 
 
 		 393 aa  209  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  36.13 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  36.53 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  35.88 
 
 		 488 aa  207  3e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  34.92 
 
 		 410 aa  206  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  39.63 
 
 		 426 aa  206  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  34.24 
 
 		 659 aa  206  8e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  36.18 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  34.31 
 
 		 426 aa  204  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  36.31 
 
 		 426 aa  202  7e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  34.15 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  40.65 
 
 		 414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  35.62 
 
 		 412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  36.69 
 
 		 393 aa  199  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  32.61 
 
 		 424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  35.47 
 
 		 487 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  35.67 
 
 		 404 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  34.87 
 
 		 387 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  35.67 
 
 		 388 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  35.49 
 
 		 466 aa  196  7e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  38.46 
 
 		 621 aa  196  8.000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  34.53 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  36.23 
 
 		 475 aa  194  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  35.75 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  36.62 
 
 		 369 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  35.84 
 
 		 424 aa  192  9e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  33.23 
 
 		 351 aa  191  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  36.29 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  33.59 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  34.86 
 
 		 394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  34.39 
 
 		 390 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  36.31 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  35.69 
 
 		 482 aa  186  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  34.07 
 
 		 404 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  32.61 
 
 		 406 aa  184  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  36.5 
 
 		 374 aa  182  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  34.98 
 
 		 375 aa  182  9.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  35.71 
 
 		 360 aa  180  4e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  33.16 
 
 		 390 aa  179  9e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  35.85 
 
 		 389 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  35.85 
 
 		 389 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  33.92 
 
 		 398 aa  176  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  36.05 
 
 		 348 aa  174  2.9999999999999996e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  35.06 
 
 		 406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0697  histone deacetylase superfamily protein  35.56 
 
 		 357 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.22424  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  35.15 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  30.82 
 
 		 327 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  32.75 
 
 		 395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  32.89 
 
 		 306 aa  146  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  31.85 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  31.35 
 
 		 364 aa  144  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  35.77 
 
 		 357 aa  143  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  33.97 
 
 		 341 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  31.55 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  31.61 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  42.11 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  40.48 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2090  Histone deacetylase  35.19 
 
 		 345 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  39.88 
 
 		 340 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  30.75 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  42.26 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  40.94 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  40.94 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  40.94 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>