More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2390 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  100 
 
 		 369 aa  722    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  98.64 
 
 		 369 aa  711    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  85.55 
 
 		 390 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  66.94 
 
 		 375 aa  475  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  66.94 
 
 		 374 aa  473  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0697  histone deacetylase superfamily protein  51.25 
 
 		 357 aa  319  5e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.22424  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  42.58 
 
 		 406 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  45.07 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  41.87 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  41.87 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  34.41 
 
 		 379 aa  242  7e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  36.62 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  36.09 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  34.86 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  35.83 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  34.25 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  36.77 
 
 		 378 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  38.65 
 
 		 397 aa  179  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  31.27 
 
 		 388 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  31.27 
 
 		 388 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  31.27 
 
 		 388 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  31.72 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  31.27 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  31.72 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  35.6 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  31.72 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  31.72 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  35.29 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  31.99 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  38.58 
 
 		 393 aa  172  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  31 
 
 		 388 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  34.08 
 
 		 387 aa  172  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  34.55 
 
 		 389 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  32.52 
 
 		 388 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  36.54 
 
 		 378 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  40.69 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  34.45 
 
 		 475 aa  166  5e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  39.49 
 
 		 393 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  33.94 
 
 		 381 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  36.08 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  32.35 
 
 		 424 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  32.71 
 
 		 370 aa  161  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  36.16 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  37.24 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  35.44 
 
 		 407 aa  159  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  37.91 
 
 		 687 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  35.29 
 
 		 378 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  39.81 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  37.25 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  36.25 
 
 		 410 aa  156  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  36.69 
 
 		 659 aa  154  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  38.49 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  37.85 
 
 		 411 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  30.77 
 
 		 453 aa  153  4e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  33.23 
 
 		 500 aa  153  5e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  35.98 
 
 		 392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  38.2 
 
 		 412 aa  152  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  37.45 
 
 		 396 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  35.84 
 
 		 417 aa  152  8.999999999999999e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  37.94 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  34.84 
 
 		 414 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  34.52 
 
 		 426 aa  149  7e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  38.21 
 
 		 406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  34.62 
 
 		 406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  34.91 
 
 		 621 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  31.86 
 
 		 487 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  36.57 
 
 		 426 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  33.54 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  37 
 
 		 424 aa  142  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  32.89 
 
 		 482 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  32.13 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  37.95 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  34.06 
 
 		 466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  27.51 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  27.51 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  32.73 
 
 		 374 aa  139  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  35.76 
 
 		 394 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  38.7 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  33.33 
 
 		 360 aa  136  5e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53146  predicted protein  37.06 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  31.53 
 
 		 488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  29.81 
 
 		 351 aa  134  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  35.62 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  32.18 
 
 		 321 aa  125  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  34.74 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  35.74 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2789  histone deacetylase superfamily protein  32.8 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  31.38 
 
 		 364 aa  119  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  32.8 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  31.47 
 
 		 308 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  30.79 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1009  Histone deacetylase  39.34 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2302  histone deacetylase superfamily  29.39 
 
 		 319 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  31.13 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2387  histone deacetylase superfamily protein  27.8 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  29.53 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2813  histone deacetylase superfamily protein  29.03 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2127  Histone deacetylase  37.88 
 
 		 447 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.003009  normal  0.054608 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1885  histone deacetylase superfamily protein  35.57 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  29.22 
 
 		 307 aa  109  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>