More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2789 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2789  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 298 aa  607  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1507  hypothetical protein  48.15 
 
 		 324 aa  278  6e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.0000688301  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1601  histone deacetylase superfamily  48.81 
 
 		 299 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1991  histone deacetylase superfamily protein  47.83 
 
 		 318 aa  272  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1152  histone deacetylase superfamily protein  47.26 
 
 		 301 aa  269  5e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0905584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3448  histone deacetylase superfamily protein  46.26 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.509704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3192  histone deacetylase superfamily protein  45 
 
 		 305 aa  259  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00911775  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1584  histone deacetylase superfamily protein  46.05 
 
 		 298 aa  259  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04120  Histone deacetylase superfamily protein  43 
 
 		 299 aa  258  9e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2562  Histone deacetylase  43.71 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3551  histone deacetylase superfamily  43.38 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1827  histone deacetylase superfamily protein  43.29 
 
 		 303 aa  255  8e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1941  histone deacetylase superfamily  45.48 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00172119  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1201  histone deacetylase superfamily protein  46.9 
 
 		 323 aa  251  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329608  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2043  Histone deacetylase  45.17 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0169314  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1768  Histone deacetylase  43.48 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2116  histone deacetylase superfamily protein  43.29 
 
 		 305 aa  249  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3030  Histone deacetylase  44.33 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1420  histone deacetylase superfamily protein  44.9 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0496164 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1529  histone deacetylase superfamily protein  43.3 
 
 		 299 aa  249  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.188503  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1393  histone deacetylase superfamily  43.64 
 
 		 299 aa  249  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1613  histone deacetylase superfamily  45.27 
 
 		 335 aa  248  8e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000964161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2469  Histone deacetylase  48.17 
 
 		 305 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1532  histone deacetylase superfamily  43.71 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2506  histone deacetylase superfamily  43.73 
 
 		 296 aa  247  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3087  histone deacetylase superfamily protein  43.32 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000151146  normal  0.0282587 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6866  histone deacetylase superfamily  43.75 
 
 		 299 aa  245  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.859971  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2377  histone deacetylase superfamily protein  43.34 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.018  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3500  Histone deacetylase  42.18 
 
 		 311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40492  predicted protein  42.86 
 
 		 350 aa  242  6e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0423597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1613  histone deacetylase superfamily protein  43.09 
 
 		 333 aa  242  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000152208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1393  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein-like  43.05 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.194758  normal  0.700999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1606  hypothetical protein  44.75 
 
 		 323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000378797  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2483  Histone deacetylase  43.05 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  0.140117 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0323  deacetylase  41.24 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2162  histone deacetylase superfamily protein  40.27 
 
 		 302 aa  230  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3373  histone deacetylase family protein  39.53 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0543734  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1245  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  42.23 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0050  histone deacetylase superfamily protein  43.26 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0204903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6387  histone deacetylase superfamily protein  43.75 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.006244  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10030  histone deacetylase superfamily  43.11 
 
 		 316 aa  222  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0971633  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2706  histone deacetylase superfamily  40.67 
 
 		 305 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000210159  unclonable  0.000000000120446 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1459  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  42.81 
 
 		 305 aa  222  7e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2905  histone deacetylase superfamily protein  38.05 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.681424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2660  histone deacetylase superfamily protein  40.74 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1764  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  42.71 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0823367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0686  histone deacetylase superfamily  42.66 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.611894 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4295  histone deacetylase superfamily protein  40.86 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4662  histone deacetylase family protein  40.86 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3722  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4918  histone deacetylase superfamily protein  40.78 
 
 		 306 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000273279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2634  histone deacetylase superfamily protein  40.94 
 
 		 307 aa  215  8e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0656  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000855576  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2066  deacetylase  37.84 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.288592  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0713  histone deacetylase superfamily protein  42.31 
 
 		 308 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4777  histone deacetylase superfamily protein  40.43 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000599986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6780  histone deacetylase superfamily  43.94 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2474  histone deacetylase superfamily protein  40.58 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1162  histone deacetylase superfamily protein  39.46 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9278  predicted protein  38.91 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2542  histone deacetylase superfamily protein  40.22 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0726  histone deacetylase superfamily  41.96 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1815  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  38.93 
 
 		 304 aa  209  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2729  histone deacetylase superfamily  38.67 
 
 		 302 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2634  histone deacetylase superfamily protein  41.79 
 
 		 300 aa  208  9e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803062 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40681  predicted protein  40.34 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000252385  normal  0.188986 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4639  histone deacetylase superfamily protein  39.72 
 
 		 317 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000315852  hitchhiker  0.00689363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1614  histone deacetylase superfamily protein  38.67 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1648  histone deacetylase superfamily protein  38.67 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4764  histone deacetylase superfamily  39.72 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000188722  decreased coverage  0.000868257 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3902  histone deacetylase superfamily protein  38.84 
 
 		 357 aa  206  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000251706  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1625  histone deacetylase superfamily protein  38.46 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2487  histone deacetylase superfamily protein  39.26 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.60651  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1629  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  39.43 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002921  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  37.42 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3900  histone deacetylase superfamily protein  37.42 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3915  histone deacetylase superfamily protein  42.32 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03035  hypothetical protein  36.88 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4892  histone deacetylase superfamily protein  41.55 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02968  histone deacetylase family protein  43.18 
 
 		 224 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510136  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0998  hypothetical protein  36.68 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_4821  predicted protein  31.15 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  35.91 
 
 		 374 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  35.27 
 
 		 417 aa  115  7.999999999999999e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  31.98 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  39.3 
 
 		 378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  32.73 
 
 		 396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  37.09 
 
 		 378 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  33.2 
 
 		 369 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  31.51 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  32.43 
 
 		 389 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1831  hypothetical protein  45.19 
 
 		 133 aa  110  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.330593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  31.33 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  32.8 
 
 		 369 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  29.97 
 
 		 309 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  33.19 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  31.8 
 
 		 393 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  31.6 
 
 		 388 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  34.11 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  29.24 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>