More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1882 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 390 aa  771    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  86.4 
 
 		 369 aa  561  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  85.55 
 
 		 369 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  67.02 
 
 		 375 aa  480  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  65.4 
 
 		 374 aa  458  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0697  histone deacetylase superfamily protein  49.72 
 
 		 357 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.22424  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  43.06 
 
 		 404 aa  276  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  43.06 
 
 		 388 aa  276  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  41.48 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  43.4 
 
 		 404 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  35.03 
 
 		 379 aa  240  4e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  34.39 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  36.36 
 
 		 385 aa  189  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  34.13 
 
 		 385 aa  182  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  35.08 
 
 		 383 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  31.02 
 
 		 388 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  31.02 
 
 		 388 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  31.02 
 
 		 388 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  31.02 
 
 		 388 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  31.02 
 
 		 388 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  31.02 
 
 		 388 aa  179  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  31.02 
 
 		 388 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  31.02 
 
 		 388 aa  179  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  31.02 
 
 		 388 aa  179  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  34.22 
 
 		 381 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  35.55 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  35.26 
 
 		 385 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  30.75 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  32.32 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  37.09 
 
 		 378 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  32.71 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  33.13 
 
 		 396 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  40.06 
 
 		 393 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  32.81 
 
 		 389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  39.67 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  32.4 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  33.33 
 
 		 475 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  33.52 
 
 		 378 aa  163  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  33.33 
 
 		 403 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  41.03 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  35.89 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  37.07 
 
 		 393 aa  159  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  34.6 
 
 		 393 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  36.48 
 
 		 394 aa  156  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  31.32 
 
 		 453 aa  156  7e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  35.76 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  35.98 
 
 		 411 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  36.53 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  30.58 
 
 		 687 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  36.66 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  35.35 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  34.74 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  36.16 
 
 		 426 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  33.12 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  34.24 
 
 		 406 aa  150  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  34.38 
 
 		 414 aa  150  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  36.84 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  34.78 
 
 		 659 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  35.82 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  36.62 
 
 		 424 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  36.22 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  30.66 
 
 		 424 aa  147  5e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  36.88 
 
 		 406 aa  146  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  33.01 
 
 		 426 aa  145  9e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  31.33 
 
 		 500 aa  145  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  36.89 
 
 		 412 aa  143  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  36.96 
 
 		 387 aa  143  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  30.87 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  31.94 
 
 		 482 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  35.87 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  28.84 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  28.84 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  35.24 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  31.85 
 
 		 426 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  32.85 
 
 		 621 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  30.67 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  30.16 
 
 		 488 aa  130  5.0000000000000004e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  29.94 
 
 		 351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  32.07 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  37.37 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  32.26 
 
 		 466 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53146  predicted protein  30.8 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  29.73 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  35.29 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  33.66 
 
 		 395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2789  histone deacetylase superfamily protein  31.98 
 
 		 298 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  31.68 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  31.06 
 
 		 348 aa  110  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  30.93 
 
 		 369 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  30.93 
 
 		 369 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  30.9 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  32.63 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  30.24 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  29.74 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2302  histone deacetylase superfamily  32.95 
 
 		 319 aa  106  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2164  histone deacetylase superfamily protein  30.37 
 
 		 318 aa  106  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  33.62 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  32.28 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  29.76 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2813  histone deacetylase superfamily protein  32.37 
 
 		 319 aa  104  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  0.411949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>