More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0112 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  100 
 
 		 378 aa  764    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  61.64 
 
 		 378 aa  457  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  58.2 
 
 		 378 aa  406  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  41.33 
 
 		 388 aa  288  7e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  46.31 
 
 		 387 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  39.73 
 
 		 388 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  39.73 
 
 		 388 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  39.73 
 
 		 388 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  40 
 
 		 388 aa  280  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  39.73 
 
 		 388 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  39.73 
 
 		 388 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  39.73 
 
 		 388 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  39.73 
 
 		 388 aa  279  6e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  39.73 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  39.41 
 
 		 396 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  39.47 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  40.53 
 
 		 370 aa  276  3e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  40.16 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  47.53 
 
 		 393 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  45.12 
 
 		 397 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  44.24 
 
 		 417 aa  246  3e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  41.98 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  43.24 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  44.41 
 
 		 393 aa  243  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  38.19 
 
 		 389 aa  242  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  38.19 
 
 		 389 aa  242  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  42.86 
 
 		 410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  41.74 
 
 		 383 aa  239  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  44.14 
 
 		 393 aa  239  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  44.08 
 
 		 426 aa  238  9e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  46.08 
 
 		 435 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  43.5 
 
 		 407 aa  236  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  39.35 
 
 		 385 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  39.63 
 
 		 385 aa  229  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  43.06 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  44.41 
 
 		 393 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  40.8 
 
 		 385 aa  223  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  41.92 
 
 		 414 aa  222  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  39.88 
 
 		 385 aa  222  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  41.38 
 
 		 393 aa  222  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  40.37 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  41.46 
 
 		 387 aa  219  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  41.87 
 
 		 392 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  36.07 
 
 		 351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  39.94 
 
 		 424 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  41.62 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  42.22 
 
 		 412 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  39.94 
 
 		 395 aa  210  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  39.84 
 
 		 390 aa  210  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  37.33 
 
 		 374 aa  209  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  38.32 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  42.09 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  40.76 
 
 		 411 aa  207  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  37.58 
 
 		 381 aa  205  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  37.74 
 
 		 398 aa  203  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  39.11 
 
 		 394 aa  202  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  41.64 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  36.1 
 
 		 424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  40.83 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  33.74 
 
 		 453 aa  190  4e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  33.81 
 
 		 426 aa  189  9e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  34.46 
 
 		 475 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  32.13 
 
 		 500 aa  179  5.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  32.93 
 
 		 487 aa  179  7e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  31.53 
 
 		 488 aa  176  6e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  30.88 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  36.96 
 
 		 316 aa  173  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  32.16 
 
 		 466 aa  172  6.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  30.19 
 
 		 687 aa  172  7.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  32.14 
 
 		 659 aa  172  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  37.28 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  33.92 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  38.96 
 
 		 343 aa  166  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  34.08 
 
 		 360 aa  164  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  32.02 
 
 		 621 aa  161  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  38.08 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  36.33 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  31.91 
 
 		 379 aa  159  9e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  32.33 
 
 		 404 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  32.33 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  34.8 
 
 		 482 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  35.66 
 
 		 379 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  32.26 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  37.68 
 
 		 380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  34.85 
 
 		 374 aa  152  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  37.1 
 
 		 380 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  32.05 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0697  histone deacetylase superfamily protein  37.3 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.22424  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  35.61 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  36.69 
 
 		 369 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  33.11 
 
 		 364 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  31.87 
 
 		 375 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  34.21 
 
 		 340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  36.45 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  35.79 
 
 		 399 aa  146  6e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  35.79 
 
 		 399 aa  146  6e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  34.47 
 
 		 345 aa  146  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  36.13 
 
 		 369 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  34.09 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  31.67 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>