More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1825 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 
389 aa  813    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 
389 aa  813    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  50.39 
 
 
388 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  49.48 
 
 
388 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  49.18 
 
 
396 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  49.06 
 
 
389 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  49.74 
 
 
388 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  49.74 
 
 
388 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  49.74 
 
 
388 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  49.74 
 
 
388 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  49.74 
 
 
388 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  49.21 
 
 
388 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  49.74 
 
 
388 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  49.48 
 
 
388 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  49.74 
 
 
388 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  42.51 
 
 
387 aa  300  4e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  40.64 
 
 
417 aa  263  4e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  36.9 
 
 
406 aa  253  6e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  35.75 
 
 
403 aa  246  6.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  38.19 
 
 
378 aa  242  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  39.88 
 
 
407 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  36.34 
 
 
378 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  38.69 
 
 
393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  37.17 
 
 
397 aa  233  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  34.63 
 
 
394 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  35.35 
 
 
424 aa  231  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  35.88 
 
 
410 aa  230  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  38.07 
 
 
387 aa  229  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  34.93 
 
 
378 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  36.56 
 
 
393 aa  226  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  34.66 
 
 
387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  36.18 
 
 
426 aa  222  8e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  37.07 
 
 
392 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  34.77 
 
 
370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  38.24 
 
 
393 aa  219  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  34.27 
 
 
393 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  37.16 
 
 
394 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  36.56 
 
 
435 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  33.91 
 
 
412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  37.58 
 
 
414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  36.33 
 
 
395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  35.96 
 
 
411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  35.17 
 
 
406 aa  213  5.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  34.65 
 
 
392 aa  212  7e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  35.05 
 
 
351 aa  210  3e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  34.25 
 
 
398 aa  206  7e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  35.74 
 
 
393 aa  205  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  36.06 
 
 
390 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  35.04 
 
 
396 aa  193  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  35.76 
 
 
383 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  33.14 
 
 
385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  33.14 
 
 
385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  35.06 
 
 
385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  35.85 
 
 
385 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  33.13 
 
 
327 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  32.7 
 
 
374 aa  176  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  35.02 
 
 
385 aa  172  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  31.12 
 
 
381 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  29.74 
 
 
424 aa  159  7e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  31.63 
 
 
487 aa  157  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  34.81 
 
 
348 aa  157  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  34.14 
 
 
475 aa  157  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  31.53 
 
 
453 aa  157  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  31.46 
 
 
321 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  33.03 
 
 
316 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  32.51 
 
 
343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  35.41 
 
 
306 aa  152  7e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  32.79 
 
 
344 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  31.61 
 
 
426 aa  149  8e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  33.7 
 
 
315 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  27.93 
 
 
426 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  29.91 
 
 
406 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  29.49 
 
 
331 aa  144  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  30.28 
 
 
488 aa  142  7e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  34.19 
 
 
621 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  28.84 
 
 
390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  29.75 
 
 
500 aa  140  3.9999999999999997e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  38.81 
 
 
438 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  31.03 
 
 
379 aa  138  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  34.09 
 
 
360 aa  139  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  36.73 
 
 
326 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  29.47 
 
 
364 aa  137  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  27.04 
 
 
659 aa  136  5e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  28.57 
 
 
404 aa  136  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  32.89 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  28.8 
 
 
687 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  28.72 
 
 
466 aa  134  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  31.94 
 
 
309 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  32 
 
 
311 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  31.38 
 
 
309 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0697  histone deacetylase superfamily protein  27.02 
 
 
357 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.22424  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  30.67 
 
 
311 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  27.1 
 
 
388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  27.1 
 
 
404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  30.82 
 
 
314 aa  130  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  30.22 
 
 
482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  33.11 
 
 
345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  30.41 
 
 
309 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  31.17 
 
 
346 aa  127  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  28.43 
 
 
375 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>