More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_119545 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  100 
 
 
487 aa  1026    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  60 
 
 
426 aa  555  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  62.8 
 
 
687 aa  548  1e-155  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  53.66 
 
 
500 aa  528  1e-149  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  59.21 
 
 
488 aa  505  9.999999999999999e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  59.69 
 
 
424 aa  489  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  55.5 
 
 
426 aa  486  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  56.73 
 
 
466 aa  479  1e-134  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  48.48 
 
 
621 aa  455  1e-127  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  50.12 
 
 
659 aa  450  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  51.04 
 
 
453 aa  419  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  51.45 
 
 
475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  45.64 
 
 
482 aa  378  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  35.26 
 
 
385 aa  213  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  35.26 
 
 
385 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  35.26 
 
 
385 aa  203  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  34.04 
 
 
385 aa  202  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  35.47 
 
 
385 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  33.95 
 
 
383 aa  196  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  32.93 
 
 
381 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  34.35 
 
 
370 aa  187  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  34.58 
 
 
393 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  36.99 
 
 
404 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53146  predicted protein  29.03 
 
 
398 aa  181  2.9999999999999997e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  37.11 
 
 
406 aa  180  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  32.93 
 
 
378 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  31.42 
 
 
397 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  32.65 
 
 
387 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  36.86 
 
 
404 aa  174  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  36.86 
 
 
388 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  33.82 
 
 
403 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  32.84 
 
 
407 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  32.73 
 
 
393 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  32.81 
 
 
417 aa  169  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  32.06 
 
 
389 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  31.53 
 
 
424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  31.66 
 
 
406 aa  165  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  31.96 
 
 
387 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  30.65 
 
 
410 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  31.78 
 
 
393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  31.75 
 
 
396 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  32.05 
 
 
388 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  31.07 
 
 
378 aa  161  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  32.26 
 
 
435 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  30.6 
 
 
387 aa  160  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  30.42 
 
 
351 aa  160  7e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  30.3 
 
 
393 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  31.17 
 
 
426 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  33.12 
 
 
392 aa  158  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  31.63 
 
 
389 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  31.63 
 
 
389 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  31.94 
 
 
388 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  31.61 
 
 
388 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  31.36 
 
 
378 aa  156  9e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  31.29 
 
 
388 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  31.29 
 
 
388 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  32.58 
 
 
388 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  31.29 
 
 
388 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  31.29 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  31.29 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  31.29 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  31.29 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  30.41 
 
 
394 aa  154  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  30.22 
 
 
406 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  31.15 
 
 
414 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  31.79 
 
 
379 aa  150  5e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  33.21 
 
 
396 aa  150  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  30.94 
 
 
348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05260  histone deacetylase 3, putative  30.65 
 
 
555 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  32.15 
 
 
412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  30.09 
 
 
393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  30.38 
 
 
411 aa  146  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  35.15 
 
 
360 aa  145  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  31.76 
 
 
392 aa  145  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  29.28 
 
 
394 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  37.66 
 
 
369 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  30.32 
 
 
374 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  31.58 
 
 
390 aa  139  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  26.91 
 
 
327 aa  137  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  36.8 
 
 
369 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0697  histone deacetylase superfamily protein  30.92 
 
 
357 aa  136  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.22424  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  30 
 
 
375 aa  134  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  30 
 
 
395 aa  133  6.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  30.67 
 
 
390 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  30.36 
 
 
398 aa  130  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  29.35 
 
 
374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  28.73 
 
 
364 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  28.98 
 
 
321 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03035  hypothetical protein  31.54 
 
 
307 aa  121  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  34.78 
 
 
330 aa  120  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87707  predicted protein  27.3 
 
 
480 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18467  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  27.92 
 
 
315 aa  113  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3900  histone deacetylase superfamily protein  30.08 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  24.25 
 
 
380 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  24.18 
 
 
380 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002921  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  28.96 
 
 
307 aa  107  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  27.76 
 
 
331 aa  107  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2090  Histone deacetylase  29.07 
 
 
345 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  28.24 
 
 
378 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  31.55 
 
 
345 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>