More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3788 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  100 
 
 		 393 aa  775    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  60.77 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  58.93 
 
 		 393 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  60.2 
 
 		 393 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  58.48 
 
 		 393 aa  418  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  56.89 
 
 		 393 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  58.61 
 
 		 394 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  57.66 
 
 		 387 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  54.48 
 
 		 410 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  56.7 
 
 		 387 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  55.5 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  56.71 
 
 		 412 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  53.98 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  53.12 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  52.51 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  53.03 
 
 		 403 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  54.29 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  54.55 
 
 		 392 aa  361  1e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  49.88 
 
 		 414 aa  360  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  52.93 
 
 		 394 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  52.17 
 
 		 406 aa  352  8.999999999999999e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  51.3 
 
 		 406 aa  348  6e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  54.73 
 
 		 396 aa  348  9e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  48.71 
 
 		 390 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  48.7 
 
 		 395 aa  316  5e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  48.71 
 
 		 411 aa  311  9e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  51.34 
 
 		 424 aa  308  8e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  49.23 
 
 		 398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  47.46 
 
 		 387 aa  293  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  41.79 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  40.7 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  40.43 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  40.43 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  41.83 
 
 		 388 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  40.16 
 
 		 388 aa  268  8e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  41.09 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  40.16 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  41.09 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  41.09 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  41.09 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  40.16 
 
 		 388 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  39.69 
 
 		 396 aa  265  7e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  43.79 
 
 		 370 aa  256  6e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  44.14 
 
 		 378 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  36.56 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  36.56 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  42.39 
 
 		 378 aa  226  7e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  40.18 
 
 		 378 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  36.13 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  36.36 
 
 		 351 aa  207  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  39.75 
 
 		 385 aa  206  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  37.28 
 
 		 385 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  39.18 
 
 		 385 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  39.18 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  38.51 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  40.28 
 
 		 348 aa  192  6e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  33.53 
 
 		 453 aa  189  5e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  35.56 
 
 		 381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  32.65 
 
 		 659 aa  179  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  33.33 
 
 		 426 aa  173  5e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  33.44 
 
 		 327 aa  173  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  31.55 
 
 		 466 aa  172  9e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  33.43 
 
 		 687 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  35.38 
 
 		 374 aa  170  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  33.55 
 
 		 488 aa  168  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  39.62 
 
 		 379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  35.99 
 
 		 621 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  32.37 
 
 		 500 aa  165  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  35.61 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  35.02 
 
 		 482 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  31.78 
 
 		 487 aa  164  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  35 
 
 		 379 aa  164  3e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  37.42 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  31.76 
 
 		 475 aa  162  7e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  31.6 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  32.04 
 
 		 426 aa  160  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  32.49 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  38.02 
 
 		 404 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  38.02 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  36.22 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  34.58 
 
 		 360 aa  153  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  36.47 
 
 		 369 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  37.27 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  36.47 
 
 		 369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0697  histone deacetylase superfamily protein  36.42 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.22424  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  31.96 
 
 		 315 aa  146  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  45.35 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  34.88 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  39.22 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  35.56 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  32.58 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  38.43 
 
 		 380 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  30.84 
 
 		 364 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  38.13 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  37.86 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  36.99 
 
 		 369 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  36.99 
 
 		 369 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  35.58 
 
 		 369 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  35.99 
 
 		 375 aa  136  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  34.12 
 
 		 331 aa  136  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>