More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57812 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  66.89 
 
 		 687 aa  637    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  72.14 
 
 		 500 aa  756    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  100 
 
 		 488 aa  1012    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  67.28 
 
 		 466 aa  558  1e-158  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  59.21 
 
 		 487 aa  505  9.999999999999999e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  59.52 
 
 		 426 aa  488  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  52.78 
 
 		 621 aa  482  1e-135  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  52.43 
 
 		 659 aa  457  1e-127  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  52.2 
 
 		 426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  51.29 
 
 		 424 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  50.13 
 
 		 453 aa  436  1e-121  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  52.66 
 
 		 475 aa  424  1e-117  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  47.36 
 
 		 482 aa  388  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  37.04 
 
 		 385 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  37.03 
 
 		 385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  37.03 
 
 		 385 aa  217  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  35.19 
 
 		 383 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  37.54 
 
 		 385 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  35.88 
 
 		 385 aa  207  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  34.78 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  34.46 
 
 		 370 aa  192  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  38.12 
 
 		 404 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  34.57 
 
 		 403 aa  176  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  31.53 
 
 		 378 aa  176  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  35.85 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  36.22 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  33.52 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  33.52 
 
 		 388 aa  170  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  32.93 
 
 		 417 aa  170  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  31.61 
 
 		 387 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  31.42 
 
 		 378 aa  169  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  33.64 
 
 		 393 aa  170  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  32.32 
 
 		 406 aa  169  9e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  31.29 
 
 		 424 aa  169  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  31.55 
 
 		 397 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  32.42 
 
 		 410 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  33.55 
 
 		 393 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  32.16 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  33.44 
 
 		 393 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  31.87 
 
 		 387 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  31.39 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53146  predicted protein  33.57 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  32.62 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  31.29 
 
 		 351 aa  160  4e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  31.07 
 
 		 392 aa  160  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  30.77 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  30.77 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  32.05 
 
 		 389 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  31.72 
 
 		 393 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  30.77 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  30.77 
 
 		 388 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  30.77 
 
 		 388 aa  158  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  26.99 
 
 		 388 aa  158  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  30.77 
 
 		 388 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  30.77 
 
 		 388 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  30.77 
 
 		 388 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  31.91 
 
 		 435 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  30.45 
 
 		 388 aa  156  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  29.41 
 
 		 396 aa  156  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  33.09 
 
 		 414 aa  154  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  32.91 
 
 		 378 aa  154  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  32.14 
 
 		 348 aa  153  7e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  30.13 
 
 		 388 aa  153  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  30.22 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  30.89 
 
 		 394 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  30.87 
 
 		 396 aa  151  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  32.58 
 
 		 412 aa  150  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  29.78 
 
 		 394 aa  150  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05260  histone deacetylase 3, putative  31.87 
 
 		 555 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  28.49 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  33.22 
 
 		 379 aa  147  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  30.28 
 
 		 389 aa  142  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  30.28 
 
 		 389 aa  142  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  31.48 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87707  predicted protein  31.08 
 
 		 480 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  28.45 
 
 		 392 aa  136  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  31.75 
 
 		 374 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0697  histone deacetylase superfamily protein  31.29 
 
 		 357 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.22424  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  37.67 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  31.75 
 
 		 374 aa  133  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  37.21 
 
 		 369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  30.16 
 
 		 390 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  29.04 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  27.3 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  26.02 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  30.42 
 
 		 364 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  31.27 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  28.12 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  32.1 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  28.12 
 
 		 398 aa  118  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  28.03 
 
 		 321 aa  117  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  34.87 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  26.03 
 
 		 331 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71431  predicted protein  27.14 
 
 		 807 aa  114  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.71958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  31.28 
 
 		 341 aa  110  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  27.94 
 
 		 306 aa  108  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  26.17 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  29.36 
 
 		 322 aa  104  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  26.95 
 
 		 372 aa  103  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3900  histone deacetylase superfamily protein  30.22 
 
 		 305 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0191811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>