238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL05260 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006681  CNL05260  histone deacetylase 3, putative  100 
 
 		 555 aa  1147    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  32.29 
 
 		 424 aa  162  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  33.33 
 
 		 426 aa  157  5.0000000000000005e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  32.48 
 
 		 687 aa  156  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  33.13 
 
 		 466 aa  154  4e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  30.31 
 
 		 488 aa  154  4e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  32.8 
 
 		 500 aa  154  4e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  30.65 
 
 		 487 aa  152  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  29.68 
 
 		 475 aa  150  8e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  28.68 
 
 		 426 aa  150  8e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  31.55 
 
 		 482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  27.31 
 
 		 621 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  29.12 
 
 		 453 aa  139  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  30.49 
 
 		 659 aa  136  8e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53146  predicted protein  27.78 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  30.92 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  29.39 
 
 		 385 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  26.33 
 
 		 383 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  26.27 
 
 		 385 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  26.27 
 
 		 385 aa  107  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  26.96 
 
 		 385 aa  104  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  28.06 
 
 		 387 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  24.36 
 
 		 378 aa  97.1  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  28.43 
 
 		 393 aa  95.5  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  26.53 
 
 		 393 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  25.77 
 
 		 370 aa  94.7  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  26.87 
 
 		 397 aa  94.4  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  24.29 
 
 		 381 aa  93.2  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  30.28 
 
 		 404 aa  92.8  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  26.73 
 
 		 388 aa  91.3  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  26.73 
 
 		 404 aa  91.3  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  28.69 
 
 		 406 aa  88.6  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  26.43 
 
 		 410 aa  87  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  25.34 
 
 		 378 aa  87  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  25.45 
 
 		 379 aa  87  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  23.68 
 
 		 378 aa  86.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  26.09 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  27.72 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  26.28 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  25.47 
 
 		 396 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  24.34 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  24.34 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  29.2 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  26.4 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  25.37 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  24.34 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  25.46 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  24.41 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  23.97 
 
 		 388 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  23.97 
 
 		 388 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  23.97 
 
 		 388 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  25.14 
 
 		 392 aa  80.1  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  25 
 
 		 424 aa  79.7  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  23.97 
 
 		 388 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  25.36 
 
 		 403 aa  80.1  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  23.97 
 
 		 388 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  23.97 
 
 		 388 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  25.23 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  23.6 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  28.83 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  24.88 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  24.67 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  26.73 
 
 		 411 aa  76.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  25.09 
 
 		 360 aa  76.3  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  27.04 
 
 		 390 aa  76.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  27.21 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  26.21 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  27.41 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  24.01 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  25.08 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  26.06 
 
 		 375 aa  73.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  26.35 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  25.51 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  27.09 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  25.67 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  25.64 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  26.05 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  22.39 
 
 		 389 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  22.39 
 
 		 389 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  24.48 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  23.29 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0697  histone deacetylase superfamily protein  25.24 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.22424  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002921  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  23.55 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  27.74 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  25.34 
 
 		 342 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  25.62 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  24.18 
 
 		 321 aa  62  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0050  histone deacetylase superfamily protein  24.43 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0204903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  21.9 
 
 		 578 aa  62  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0686  histone deacetylase superfamily  24.61 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.611894 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03035  hypothetical protein  25.21 
 
 		 307 aa  62  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3900  histone deacetylase superfamily protein  26.05 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1420  histone deacetylase superfamily protein  26.46 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0496164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0726  histone deacetylase superfamily  25.59 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  21.74 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0713  histone deacetylase superfamily protein  25.93 
 
 		 308 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2164  histone deacetylase superfamily protein  25 
 
 		 318 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04120  Histone deacetylase superfamily protein  22.27 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  24.07 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  28.81 
 
 		 737 aa  58.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>