More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0697 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0697  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 357 aa  694    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.22424  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  49.29 
 
 		 390 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  50.14 
 
 		 374 aa  316  4e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  45.86 
 
 		 375 aa  306  4.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  49.86 
 
 		 369 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  49.58 
 
 		 369 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  36.69 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  36.69 
 
 		 404 aa  210  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  37.57 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  34.69 
 
 		 406 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  38.56 
 
 		 385 aa  179  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  30.25 
 
 		 379 aa  172  7.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  36.62 
 
 		 385 aa  169  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  35.56 
 
 		 385 aa  169  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  36.76 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  36.76 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  36.57 
 
 		 383 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  37.06 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  31.07 
 
 		 424 aa  152  8.999999999999999e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  37.3 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  38.67 
 
 		 435 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  31.29 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  31.58 
 
 		 687 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  33.22 
 
 		 500 aa  147  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  36.42 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  32.43 
 
 		 381 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  36.22 
 
 		 403 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  36.54 
 
 		 407 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  36.33 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  31.88 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  36.75 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  34.3 
 
 		 659 aa  142  6e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  31.36 
 
 		 388 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  31.36 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  31.36 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  31.36 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  31.36 
 
 		 388 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  31.36 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  31.07 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  31.8 
 
 		 426 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  34.54 
 
 		 394 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  31.07 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  31.07 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  36.25 
 
 		 424 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  31.07 
 
 		 388 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  36.88 
 
 		 411 aa  139  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  29.94 
 
 		 388 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  31.63 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  35.81 
 
 		 397 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  30.92 
 
 		 487 aa  136  5e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  35.74 
 
 		 426 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  31.29 
 
 		 488 aa  136  7.000000000000001e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  35.76 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  34.62 
 
 		 410 aa  133  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  35.96 
 
 		 393 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  33.01 
 
 		 387 aa  132  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  35.09 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  34.62 
 
 		 414 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  32.13 
 
 		 475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  27.02 
 
 		 389 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  27.02 
 
 		 389 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  36.33 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  31.91 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  36.48 
 
 		 393 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  31.7 
 
 		 466 aa  129  7.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  31.41 
 
 		 426 aa  129  7.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  36.24 
 
 		 394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  30.29 
 
 		 482 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  36.86 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  35.65 
 
 		 392 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  33.33 
 
 		 621 aa  127  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  36.77 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  37.29 
 
 		 387 aa  123  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53146  predicted protein  29.3 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  31.56 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  32.77 
 
 		 393 aa  119  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  35.44 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  35.89 
 
 		 398 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  30.53 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6387  histone deacetylase superfamily protein  33.21 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.006244  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  32.23 
 
 		 406 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  27.61 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0050  histone deacetylase superfamily protein  32.41 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0204903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1459  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  32.73 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  30.6 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0686  histone deacetylase superfamily  34.48 
 
 		 294 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.611894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0713  histone deacetylase superfamily protein  35.98 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  29.48 
 
 		 360 aa  106  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2706  histone deacetylase superfamily  27.9 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000210159  unclonable  0.000000000120446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0726  histone deacetylase superfamily  35.61 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1764  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  32.27 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0823367 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  30.24 
 
 		 348 aa  104  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3551  histone deacetylase superfamily  29.58 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2562  Histone deacetylase  29.58 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1532  histone deacetylase superfamily  27.85 
 
 		 304 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2483  Histone deacetylase  28.73 
 
 		 300 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  0.140117 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1152  histone deacetylase superfamily protein  33.2 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0905584  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3030  Histone deacetylase  31.87 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1827  histone deacetylase superfamily protein  30.42 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  29.89 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>