More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2337 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0024  histone deacetylase superfamily  80.41 
 
 		 439 aa  766    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263374 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1093  histone deacetylase superfamily protein  74.03 
 
 		 439 aa  716    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718834  normal  0.264484 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2337  histone deacetylase family protein  100 
 
 		 439 aa  913    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0778  histone deacetylase superfamily  61.56 
 
 		 435 aa  587  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0223  Histone deacetylase  62.24 
 
 		 446 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.195671 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3163  histone deacetylase superfamily protein  59.4 
 
 		 438 aa  547  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114353  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0126  histone deacetylase superfamily  61.21 
 
 		 473 aa  544  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4058  histone deacetylase superfamily protein  57.7 
 
 		 438 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0989  histone deacetylase superfamily protein  59.23 
 
 		 437 aa  531  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2932  histone deacetylase  55.71 
 
 		 528 aa  521  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00716511 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22480  histone deacetylase superfamily  55.19 
 
 		 480 aa  514  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00877873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  52.4 
 
 		 438 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1009  Histone deacetylase  53.95 
 
 		 450 aa  499  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0976  hypothetical protein  54.23 
 
 		 448 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1405  histone deacetylase superfamily protein  52.85 
 
 		 478 aa  490  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1885  histone deacetylase superfamily protein  50 
 
 		 451 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2127  Histone deacetylase  48.3 
 
 		 447 aa  448  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.003009  normal  0.054608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2733  histone deacetylase superfamily  46.17 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  40.54 
 
 		 364 aa  236  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  32.89 
 
 		 331 aa  167  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  39.29 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  35.42 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  34.48 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  36.82 
 
 		 344 aa  156  7e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  35.42 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  33 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  34.87 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  34 
 
 		 326 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  34.96 
 
 		 417 aa  149  9e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  42.79 
 
 		 334 aa  149  9e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  35.02 
 
 		 309 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  35.49 
 
 		 407 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  30.25 
 
 		 373 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  33.65 
 
 		 426 aa  146  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  31.97 
 
 		 322 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  36.28 
 
 		 311 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  35.69 
 
 		 344 aa  144  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  36.28 
 
 		 311 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  36.69 
 
 		 336 aa  143  5e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  38.81 
 
 		 370 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  32.76 
 
 		 309 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  31.75 
 
 		 411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  36.75 
 
 		 345 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  36.33 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  33.1 
 
 		 309 aa  141  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  33.96 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  30.94 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  34.62 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  38.93 
 
 		 352 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  33.46 
 
 		 380 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  42.39 
 
 		 336 aa  140  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  34.26 
 
 		 323 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  32.72 
 
 		 380 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  35.57 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  35.57 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  30.49 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  34.87 
 
 		 369 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  37.5 
 
 		 316 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  32.09 
 
 		 378 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  33.13 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  27.58 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  31.27 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  36.32 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  30.62 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  34.98 
 
 		 369 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  34.98 
 
 		 369 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0381  histone deacetylase superfamily protein  37.05 
 
 		 336 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0601969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  39.49 
 
 		 397 aa  136  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0991  Histone deacetylase  38.39 
 
 		 327 aa  136  8e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.964877  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  32.65 
 
 		 309 aa  136  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  30.36 
 
 		 341 aa  136  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  33 
 
 		 395 aa  136  9e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  34.59 
 
 		 335 aa  136  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1746  histone deacetylase superfamily protein  34.89 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.115562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  30.25 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  30.83 
 
 		 369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  31.21 
 
 		 309 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  31.21 
 
 		 309 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  31.56 
 
 		 309 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  33.45 
 
 		 359 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  33.56 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  37.71 
 
 		 390 aa  133  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  38.39 
 
 		 406 aa  133  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  31.56 
 
 		 314 aa  133  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  35.59 
 
 		 394 aa  133  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  42.69 
 
 		 392 aa  132  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  32.22 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  33.33 
 
 		 403 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  33.91 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  35.21 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  32.52 
 
 		 313 aa  131  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  28.24 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  34.98 
 
 		 348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  34.82 
 
 		 309 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  31.49 
 
 		 306 aa  130  7.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  41.01 
 
 		 336 aa  130  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  36.27 
 
 		 307 aa  129  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  30.9 
 
 		 341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  34.69 
 
 		 340 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  35.98 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>