More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2506 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2506  histone deacetylase superfamily  100 
 
 		 296 aa  603  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3030  Histone deacetylase  75 
 
 		 299 aa  449  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1420  histone deacetylase superfamily protein  48.81 
 
 		 306 aa  266  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0496164 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2789  histone deacetylase superfamily protein  43.73 
 
 		 298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1152  histone deacetylase superfamily protein  47.9 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0905584  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1507  hypothetical protein  46.33 
 
 		 324 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.0000688301  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1201  histone deacetylase superfamily protein  46.9 
 
 		 323 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329608  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1601  histone deacetylase superfamily  46.92 
 
 		 299 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3448  histone deacetylase superfamily protein  46.08 
 
 		 297 aa  245  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.509704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1991  histone deacetylase superfamily protein  45.95 
 
 		 318 aa  242  7e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2377  histone deacetylase superfamily protein  44.15 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.018  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2066  deacetylase  45.61 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.288592  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04120  Histone deacetylase superfamily protein  41.28 
 
 		 299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6866  histone deacetylase superfamily  43.86 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.859971  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1584  histone deacetylase superfamily protein  45.8 
 
 		 298 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3500  Histone deacetylase  44.22 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1613  histone deacetylase superfamily  45.97 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000964161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2162  histone deacetylase superfamily protein  41.34 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1941  histone deacetylase superfamily  43.73 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00172119  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1768  Histone deacetylase  43.14 
 
 		 311 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1606  hypothetical protein  44.75 
 
 		 323 aa  232  6e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000378797  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2043  Histone deacetylase  42.11 
 
 		 299 aa  232  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0169314  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2116  histone deacetylase superfamily protein  39.36 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1529  histone deacetylase superfamily protein  41.1 
 
 		 299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.188503  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2562  Histone deacetylase  42.14 
 
 		 305 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3551  histone deacetylase superfamily  42.14 
 
 		 305 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0323  deacetylase  42.25 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3087  histone deacetylase superfamily protein  42.99 
 
 		 337 aa  222  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000151146  normal  0.0282587 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0686  histone deacetylase superfamily  46.1 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.611894 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2483  Histone deacetylase  40.49 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  0.140117 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2905  histone deacetylase superfamily protein  38.46 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.681424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6387  histone deacetylase superfamily protein  45 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.006244  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3192  histone deacetylase superfamily protein  40.48 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00911775  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40492  predicted protein  39.73 
 
 		 350 aa  212  5.999999999999999e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0423597 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1393  histone deacetylase superfamily  37.88 
 
 		 299 aa  211  9e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3373  histone deacetylase family protein  37.37 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0543734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1532  histone deacetylase superfamily  41.13 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1162  histone deacetylase superfamily protein  39.52 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1393  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein-like  40.85 
 
 		 304 aa  209  5e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.194758  normal  0.700999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0713  histone deacetylase superfamily protein  45.74 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1613  histone deacetylase superfamily protein  42.53 
 
 		 333 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000152208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1764  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  44.44 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0823367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0726  histone deacetylase superfamily  45.39 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6780  histone deacetylase superfamily  45.52 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0050  histone deacetylase superfamily protein  44.48 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0204903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1827  histone deacetylase superfamily protein  39.01 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10030  histone deacetylase superfamily  42.16 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0971633  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2542  histone deacetylase superfamily protein  36.52 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40681  predicted protein  38.83 
 
 		 323 aa  202  4e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000252385  normal  0.188986 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02968  histone deacetylase family protein  45.87 
 
 		 224 aa  199  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510136  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2474  histone deacetylase superfamily protein  36.52 
 
 		 300 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188397 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1815  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  36.52 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2706  histone deacetylase superfamily  38.75 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000210159  unclonable  0.000000000120446 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002921  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  34.32 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1245  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  37.11 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118499 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2634  histone deacetylase superfamily protein  34.67 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0656  histone deacetylase superfamily protein  39.18 
 
 		 304 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000855576  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4918  histone deacetylase superfamily protein  39.78 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000273279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1629  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  34.34 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2634  histone deacetylase superfamily protein  36.73 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803062 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1459  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  40.7 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2487  histone deacetylase superfamily protein  36.08 
 
 		 300 aa  193  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.60651  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4892  histone deacetylase superfamily protein  43.06 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03035  hypothetical protein  31.96 
 
 		 307 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2469  Histone deacetylase  41.92 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3722  histone deacetylase superfamily protein  37.37 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3902  histone deacetylase superfamily protein  37.38 
 
 		 357 aa  189  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000251706  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4295  histone deacetylase superfamily protein  38.06 
 
 		 305 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3900  histone deacetylase superfamily protein  31.88 
 
 		 305 aa  189  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4777  histone deacetylase superfamily protein  39.35 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000599986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4764  histone deacetylase superfamily  38.83 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000188722  decreased coverage  0.000868257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4662  histone deacetylase family protein  38.78 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4639  histone deacetylase superfamily protein  38.83 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000315852  hitchhiker  0.00689363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3915  histone deacetylase superfamily protein  42.44 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1614  histone deacetylase superfamily protein  34.48 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1648  histone deacetylase superfamily protein  34.48 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2729  histone deacetylase superfamily  34.48 
 
 		 302 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2660  histone deacetylase superfamily protein  34.38 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1625  histone deacetylase superfamily protein  34.14 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9278  predicted protein  37.89 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0998  hypothetical protein  31.86 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_4821  predicted protein  34.44 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3389  histone deacetylase superfamily protein  42.5 
 
 		 594 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5329  histone deacetylase superfamily  42.39 
 
 		 577 aa  126  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3454  histone deacetylase superfamily protein  41.25 
 
 		 589 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.524181  normal  0.0722274 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3472  histone deacetylase superfamily  41.67 
 
 		 594 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3536  histone deacetylase superfamily  41.25 
 
 		 594 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.380166  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  31.77 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  31.77 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  34.84 
 
 		 406 aa  116  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  30.2 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  30 
 
 		 385 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  33.73 
 
 		 404 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  32.38 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  30.77 
 
 		 389 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  31.84 
 
 		 392 aa  106  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0463  histone deacetylase superfamily protein  30.07 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.157576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  30.31 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  32.49 
 
 		 379 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  32.85 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>