More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1629 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1629  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  100 
 
 		 306 aa  630  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3900  histone deacetylase superfamily protein  61.97 
 
 		 305 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002921  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  62.13 
 
 		 307 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03035  hypothetical protein  61.46 
 
 		 307 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0998  hypothetical protein  63.16 
 
 		 300 aa  391  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2660  histone deacetylase superfamily protein  52.82 
 
 		 304 aa  311  9e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1815  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  49.5 
 
 		 304 aa  305  6e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2474  histone deacetylase superfamily protein  49.5 
 
 		 300 aa  305  6e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2542  histone deacetylase superfamily protein  49.17 
 
 		 300 aa  305  7e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1614  histone deacetylase superfamily protein  48.5 
 
 		 302 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2634  histone deacetylase superfamily protein  49.17 
 
 		 300 aa  298  8e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1648  histone deacetylase superfamily protein  48.5 
 
 		 302 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2729  histone deacetylase superfamily  48.5 
 
 		 302 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1625  histone deacetylase superfamily protein  48.5 
 
 		 302 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2487  histone deacetylase superfamily protein  50 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.60651  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1162  histone deacetylase superfamily protein  48.49 
 
 		 306 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1245  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  48.17 
 
 		 305 aa  293  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118499 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2634  histone deacetylase superfamily protein  48 
 
 		 307 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3373  histone deacetylase family protein  46.18 
 
 		 300 aa  285  9e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0543734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4295  histone deacetylase superfamily protein  44.37 
 
 		 305 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3722  histone deacetylase superfamily protein  45.05 
 
 		 306 aa  258  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10030  histone deacetylase superfamily  44.37 
 
 		 316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0971633  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1393  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein-like  43.67 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.194758  normal  0.700999 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02968  histone deacetylase family protein  55.45 
 
 		 224 aa  253  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510136  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4918  histone deacetylase superfamily protein  43 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000273279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4662  histone deacetylase family protein  43.34 
 
 		 305 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4764  histone deacetylase superfamily  44.37 
 
 		 304 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000188722  decreased coverage  0.000868257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4639  histone deacetylase superfamily protein  44.37 
 
 		 317 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000315852  hitchhiker  0.00689363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4777  histone deacetylase superfamily protein  44.03 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000599986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2706  histone deacetylase superfamily  43.28 
 
 		 305 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000210159  unclonable  0.000000000120446 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2905  histone deacetylase superfamily protein  39.87 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.681424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0656  histone deacetylase superfamily protein  43.34 
 
 		 304 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000855576  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1827  histone deacetylase superfamily protein  42.62 
 
 		 303 aa  242  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3192  histone deacetylase superfamily protein  43 
 
 		 305 aa  242  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00911775  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2562  Histone deacetylase  42.47 
 
 		 305 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3551  histone deacetylase superfamily  42.47 
 
 		 305 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1532  histone deacetylase superfamily  42.33 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1764  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  42.57 
 
 		 316 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0823367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1601  histone deacetylase superfamily  39.1 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1152  histone deacetylase superfamily protein  39.24 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0905584  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3915  histone deacetylase superfamily protein  39.66 
 
 		 315 aa  219  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40681  predicted protein  38.82 
 
 		 323 aa  220  3e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000252385  normal  0.188986 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1459  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  39.67 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2066  deacetylase  38.41 
 
 		 299 aa  218  7.999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.288592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2377  histone deacetylase superfamily protein  39.14 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.018  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2469  Histone deacetylase  40.53 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0050  histone deacetylase superfamily protein  40.07 
 
 		 306 aa  211  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0204903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0726  histone deacetylase superfamily  39.14 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2483  Histone deacetylase  36.54 
 
 		 300 aa  208  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  0.140117 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04120  Histone deacetylase superfamily protein  36.21 
 
 		 299 aa  208  9e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1507  hypothetical protein  38.64 
 
 		 324 aa  208  9e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.0000688301  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1584  histone deacetylase superfamily protein  39.12 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4892  histone deacetylase superfamily protein  39.74 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2162  histone deacetylase superfamily protein  37.21 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0713  histone deacetylase superfamily protein  38.49 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0686  histone deacetylase superfamily  38.85 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.611894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6387  histone deacetylase superfamily protein  37.67 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.006244  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1941  histone deacetylase superfamily  37.88 
 
 		 334 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00172119  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1201  histone deacetylase superfamily protein  37.58 
 
 		 323 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329608  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1606  hypothetical protein  39.31 
 
 		 323 aa  206  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000378797  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3448  histone deacetylase superfamily protein  39.38 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.509704 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2043  Histone deacetylase  37.09 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0169314  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1991  histone deacetylase superfamily protein  39.8 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1613  histone deacetylase superfamily  37.2 
 
 		 335 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000964161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2789  histone deacetylase superfamily protein  39.43 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6780  histone deacetylase superfamily  39.33 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0323  deacetylase  33.89 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_4821  predicted protein  37.38 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3500  Histone deacetylase  36.62 
 
 		 311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6866  histone deacetylase superfamily  38.51 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.859971  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1529  histone deacetylase superfamily protein  35.79 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.188503  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1393  histone deacetylase superfamily  36.08 
 
 		 299 aa  193  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1768  Histone deacetylase  36.39 
 
 		 311 aa  192  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1420  histone deacetylase superfamily protein  35.02 
 
 		 306 aa  191  9e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0496164 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2116  histone deacetylase superfamily protein  34.55 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3030  Histone deacetylase  33.66 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2506  histone deacetylase superfamily  34.34 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1613  histone deacetylase superfamily protein  36.27 
 
 		 333 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000152208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9278  predicted protein  32.2 
 
 		 294 aa  177  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3087  histone deacetylase superfamily protein  35.31 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000151146  normal  0.0282587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3902  histone deacetylase superfamily protein  31.23 
 
 		 357 aa  176  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000251706  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40492  predicted protein  31.25 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0423597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  28.52 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  28.37 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  29.89 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  29.89 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  29.84 
 
 		 378 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  26.47 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  25.25 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  35.53 
 
 		 344 aa  95.5  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  26.78 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  30.11 
 
 		 659 aa  94.4  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  28.38 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  28.51 
 
 		 393 aa  92.4  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  29.9 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  26.15 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  27.21 
 
 		 344 aa  91.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  29.04 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  29.95 
 
 		 378 aa  90.5  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  28.94 
 
 		 475 aa  90.1  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>