More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6387 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6387  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 298 aa  577  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.006244  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6780  histone deacetylase superfamily  87.21 
 
 		 298 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0686  histone deacetylase superfamily  75.51 
 
 		 294 aa  424  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.611894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0713  histone deacetylase superfamily protein  75.93 
 
 		 308 aa  425  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0726  histone deacetylase superfamily  76.95 
 
 		 297 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0050  histone deacetylase superfamily protein  72.66 
 
 		 306 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0204903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4892  histone deacetylase superfamily protein  56.27 
 
 		 305 aa  295  5e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1459  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  48.82 
 
 		 305 aa  278  1e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3192  histone deacetylase superfamily protein  45.61 
 
 		 305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00911775  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2562  Histone deacetylase  45.55 
 
 		 305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3551  histone deacetylase superfamily  45.55 
 
 		 305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3915  histone deacetylase superfamily protein  50 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1393  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein-like  46.28 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.194758  normal  0.700999 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1827  histone deacetylase superfamily protein  44.18 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1764  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  49.33 
 
 		 316 aa  265  8.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0823367 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1532  histone deacetylase superfamily  44.71 
 
 		 304 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2905  histone deacetylase superfamily protein  42.52 
 
 		 308 aa  255  7e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.681424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2706  histone deacetylase superfamily  45.27 
 
 		 305 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000210159  unclonable  0.000000000120446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4918  histone deacetylase superfamily protein  43.69 
 
 		 306 aa  249  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000273279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0656  histone deacetylase superfamily protein  44.26 
 
 		 304 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000855576  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3373  histone deacetylase family protein  40.48 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0543734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10030  histone deacetylase superfamily  45.3 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0971633  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4295  histone deacetylase superfamily protein  43.34 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1245  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  42.67 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118499 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2162  histone deacetylase superfamily protein  41.44 
 
 		 302 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2377  histone deacetylase superfamily protein  46.38 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.018  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4764  histone deacetylase superfamily  42.37 
 
 		 304 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000188722  decreased coverage  0.000868257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4639  histone deacetylase superfamily protein  42.37 
 
 		 317 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000315852  hitchhiker  0.00689363 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3722  histone deacetylase superfamily protein  44.48 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4777  histone deacetylase superfamily protein  42.37 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000599986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6866  histone deacetylase superfamily  40.88 
 
 		 299 aa  235  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.859971  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4662  histone deacetylase family protein  43 
 
 		 305 aa  234  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40681  predicted protein  45.21 
 
 		 323 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000252385  normal  0.188986 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002921  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  41.39 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2043  Histone deacetylase  42.66 
 
 		 299 aa  231  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0169314  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04120  Histone deacetylase superfamily protein  39.59 
 
 		 299 aa  229  3e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1152  histone deacetylase superfamily protein  46.24 
 
 		 301 aa  229  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0905584  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3900  histone deacetylase superfamily protein  39.33 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1201  histone deacetylase superfamily protein  47.55 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329608  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2487  histone deacetylase superfamily protein  41 
 
 		 300 aa  225  6e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.60651  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1991  histone deacetylase superfamily protein  46.08 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158404 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2066  deacetylase  41.61 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.288592  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1601  histone deacetylase superfamily  44.76 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2542  histone deacetylase superfamily protein  38.31 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0323  deacetylase  38.38 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2634  histone deacetylase superfamily protein  39.32 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2789  histone deacetylase superfamily protein  43.75 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2474  histone deacetylase superfamily protein  38.64 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188397 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2634  histone deacetylase superfamily protein  38 
 
 		 307 aa  222  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1815  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  38.64 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2483  Histone deacetylase  40.4 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  0.140117 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2116  histone deacetylase superfamily protein  38.7 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1529  histone deacetylase superfamily protein  43.48 
 
 		 299 aa  220  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.188503  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03035  hypothetical protein  38.46 
 
 		 307 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3448  histone deacetylase superfamily protein  43.93 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.509704 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3030  Histone deacetylase  46.18 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40492  predicted protein  41.58 
 
 		 350 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0423597 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1507  hypothetical protein  45.15 
 
 		 324 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.0000688301  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1162  histone deacetylase superfamily protein  39.38 
 
 		 306 aa  211  9e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1614  histone deacetylase superfamily protein  36.95 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1648  histone deacetylase superfamily protein  36.95 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0998  hypothetical protein  37.12 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2660  histone deacetylase superfamily protein  35.93 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1584  histone deacetylase superfamily protein  42.14 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1629  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  37.67 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1625  histone deacetylase superfamily protein  36.61 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2729  histone deacetylase superfamily  36.27 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3087  histone deacetylase superfamily protein  40.63 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000151146  normal  0.0282587 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1606  hypothetical protein  46.07 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000378797  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1941  histone deacetylase superfamily  44.04 
 
 		 334 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00172119  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_4821  predicted protein  42.14 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1768  Histone deacetylase  45.26 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2506  histone deacetylase superfamily  44.56 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1420  histone deacetylase superfamily protein  44.64 
 
 		 306 aa  202  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0496164 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1393  histone deacetylase superfamily  39.27 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1613  histone deacetylase superfamily protein  43.52 
 
 		 333 aa  202  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000152208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1613  histone deacetylase superfamily  44.04 
 
 		 335 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000964161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3500  Histone deacetylase  41.28 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2469  Histone deacetylase  46.95 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3902  histone deacetylase superfamily protein  36.54 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000251706  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9278  predicted protein  37.41 
 
 		 294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02968  histone deacetylase family protein  41.28 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510136  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  32.9 
 
 		 344 aa  119  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0697  histone deacetylase superfamily protein  33.21 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.22424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  31.8 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  37.1 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  35.11 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  31.45 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  35.39 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  32.43 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  28.21 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1831  hypothetical protein  44.44 
 
 		 133 aa  101  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.330593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  30.46 
 
 		 385 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  34.82 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  35.16 
 
 		 393 aa  99.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  32.17 
 
 		 403 aa  99.4  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  32.17 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  36.4 
 
 		 417 aa  97.8  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  36.22 
 
 		 397 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  38.04 
 
 		 392 aa  97.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>