More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2905 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2905  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 308 aa  641    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.681424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3722  histone deacetylase superfamily protein  51.34 
 
 		 306 aa  325  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10030  histone deacetylase superfamily  50.17 
 
 		 316 aa  322  6e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0971633  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4295  histone deacetylase superfamily protein  49.17 
 
 		 305 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0656  histone deacetylase superfamily protein  49.16 
 
 		 304 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000855576  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4918  histone deacetylase superfamily protein  48.16 
 
 		 306 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000273279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4777  histone deacetylase superfamily protein  48.82 
 
 		 304 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000599986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4639  histone deacetylase superfamily protein  49.16 
 
 		 317 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000315852  hitchhiker  0.00689363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4764  histone deacetylase superfamily  49.16 
 
 		 304 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000188722  decreased coverage  0.000868257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4662  histone deacetylase family protein  48.18 
 
 		 305 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3551  histone deacetylase superfamily  48.33 
 
 		 305 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2706  histone deacetylase superfamily  50.5 
 
 		 305 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000210159  unclonable  0.000000000120446 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2562  Histone deacetylase  48 
 
 		 305 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3192  histone deacetylase superfamily protein  47.85 
 
 		 305 aa  302  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00911775  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2634  histone deacetylase superfamily protein  47.52 
 
 		 307 aa  301  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1532  histone deacetylase superfamily  47.02 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1827  histone deacetylase superfamily protein  48.37 
 
 		 303 aa  295  9e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2542  histone deacetylase superfamily protein  45.67 
 
 		 300 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2474  histone deacetylase superfamily protein  45.33 
 
 		 300 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188397 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1393  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein-like  46.36 
 
 		 304 aa  286  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.194758  normal  0.700999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1815  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  45.33 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1648  histone deacetylase superfamily protein  45.18 
 
 		 302 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1614  histone deacetylase superfamily protein  45.18 
 
 		 302 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2634  histone deacetylase superfamily protein  44.67 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1625  histone deacetylase superfamily protein  45.18 
 
 		 302 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1245  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  44.52 
 
 		 305 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118499 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1459  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  45.7 
 
 		 305 aa  279  5e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2729  histone deacetylase superfamily  44.85 
 
 		 302 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1764  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  46.33 
 
 		 316 aa  278  1e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0823367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2660  histone deacetylase superfamily protein  44.37 
 
 		 304 aa  276  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2487  histone deacetylase superfamily protein  43.33 
 
 		 300 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.60651  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0713  histone deacetylase superfamily protein  44.9 
 
 		 308 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0726  histone deacetylase superfamily  44.56 
 
 		 297 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0050  histone deacetylase superfamily protein  44.64 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0204903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03035  hypothetical protein  40.07 
 
 		 307 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0686  histone deacetylase superfamily  43.1 
 
 		 294 aa  256  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.611894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6387  histone deacetylase superfamily protein  42.52 
 
 		 298 aa  255  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.006244  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40681  predicted protein  42.86 
 
 		 323 aa  253  3e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000252385  normal  0.188986 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002921  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  39.8 
 
 		 307 aa  252  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3900  histone deacetylase superfamily protein  40.07 
 
 		 305 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4892  histone deacetylase superfamily protein  40.79 
 
 		 305 aa  251  9.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1162  histone deacetylase superfamily protein  42.76 
 
 		 306 aa  248  7e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0998  hypothetical protein  39.73 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3373  histone deacetylase family protein  40.8 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0543734  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04120  Histone deacetylase superfamily protein  38.13 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1629  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  39.87 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6780  histone deacetylase superfamily  43.1 
 
 		 298 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2483  Histone deacetylase  38.38 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  0.140117 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2377  histone deacetylase superfamily protein  40.28 
 
 		 300 aa  232  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.018  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2043  Histone deacetylase  39.93 
 
 		 299 aa  229  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0169314  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_4821  predicted protein  38.27 
 
 		 324 aa  228  7e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1601  histone deacetylase superfamily  39.66 
 
 		 299 aa  228  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6866  histone deacetylase superfamily  37.5 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.859971  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2162  histone deacetylase superfamily protein  37.12 
 
 		 302 aa  222  6e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1152  histone deacetylase superfamily protein  39.46 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0905584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3448  histone deacetylase superfamily protein  38.71 
 
 		 297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.509704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2789  histone deacetylase superfamily protein  38.05 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1584  histone deacetylase superfamily protein  38.57 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2066  deacetylase  38.16 
 
 		 299 aa  218  7.999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.288592  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3915  histone deacetylase superfamily protein  38.19 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0323  deacetylase  34.45 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3030  Histone deacetylase  38.49 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1507  hypothetical protein  39.64 
 
 		 324 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.0000688301  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1201  histone deacetylase superfamily protein  38.06 
 
 		 323 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329608  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2469  Histone deacetylase  41.07 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2116  histone deacetylase superfamily protein  34.78 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02968  histone deacetylase family protein  46.85 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510136  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2506  histone deacetylase superfamily  38.46 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1529  histone deacetylase superfamily protein  36.99 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.188503  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9278  predicted protein  38.44 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1991  histone deacetylase superfamily protein  36.89 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158404 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1606  hypothetical protein  36.49 
 
 		 323 aa  198  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000378797  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3902  histone deacetylase superfamily protein  32.04 
 
 		 357 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000251706  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1768  Histone deacetylase  36.1 
 
 		 311 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1420  histone deacetylase superfamily protein  37.86 
 
 		 306 aa  195  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0496164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1941  histone deacetylase superfamily  38.04 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00172119  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3500  Histone deacetylase  36.24 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1613  histone deacetylase superfamily  35.76 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000964161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1393  histone deacetylase superfamily  34.23 
 
 		 299 aa  185  7e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40492  predicted protein  34.84 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0423597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1613  histone deacetylase superfamily protein  32.04 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000152208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3087  histone deacetylase superfamily protein  30.79 
 
 		 337 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000151146  normal  0.0282587 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  29.7 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  33.33 
 
 		 406 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  29.29 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  27.37 
 
 		 389 aa  99.8  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  27.37 
 
 		 389 aa  99.8  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  29.56 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  29.62 
 
 		 348 aa  97.8  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  26.26 
 
 		 388 aa  95.1  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  28.46 
 
 		 392 aa  95.1  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  33.86 
 
 		 392 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  26.07 
 
 		 404 aa  94.7  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  30.71 
 
 		 360 aa  94.4  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  28.32 
 
 		 387 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  25.78 
 
 		 487 aa  93.6  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  28.4 
 
 		 393 aa  92.4  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  31.64 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  26.55 
 
 		 407 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  28.33 
 
 		 387 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>