More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_40681 on replicon NC_009369
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009369  OSTLU_40681  predicted protein  100 
 
 
323 aa  654    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000252385  normal  0.188986 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2562  Histone deacetylase  47.7 
 
 
305 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3551  histone deacetylase superfamily  47.37 
 
 
305 aa  298  8e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1827  histone deacetylase superfamily protein  47.56 
 
 
303 aa  296  5e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1532  histone deacetylase superfamily  46.53 
 
 
304 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1393  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein-like  49.01 
 
 
304 aa  287  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.194758  normal  0.700999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2706  histone deacetylase superfamily  48.05 
 
 
305 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000210159  unclonable  0.000000000120446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3192  histone deacetylase superfamily protein  46.25 
 
 
305 aa  285  8e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00911775  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2542  histone deacetylase superfamily protein  43.05 
 
 
300 aa  269  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2474  histone deacetylase superfamily protein  42.38 
 
 
300 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188397 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3722  histone deacetylase superfamily protein  46.58 
 
 
306 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2634  histone deacetylase superfamily protein  42.72 
 
 
300 aa  263  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00803062 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2905  histone deacetylase superfamily protein  42.86 
 
 
308 aa  263  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.681424  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1162  histone deacetylase superfamily protein  44.48 
 
 
306 aa  263  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2660  histone deacetylase superfamily protein  42.38 
 
 
304 aa  262  6e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0656  histone deacetylase superfamily protein  46.69 
 
 
304 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000855576  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4295  histone deacetylase superfamily protein  45.78 
 
 
305 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4764  histone deacetylase superfamily  46.64 
 
 
304 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000188722  decreased coverage  0.000868257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4639  histone deacetylase superfamily protein  46.64 
 
 
317 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000315852  hitchhiker  0.00689363 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3373  histone deacetylase family protein  42.42 
 
 
300 aa  258  7e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0543734  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4918  histone deacetylase superfamily protein  45.1 
 
 
306 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000273279  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2729  histone deacetylase superfamily  42.72 
 
 
302 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1614  histone deacetylase superfamily protein  42.38 
 
 
302 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4777  histone deacetylase superfamily protein  46.31 
 
 
304 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000599986  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1648  histone deacetylase superfamily protein  42.38 
 
 
302 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2487  histone deacetylase superfamily protein  44.52 
 
 
300 aa  257  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.60651  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1625  histone deacetylase superfamily protein  42.38 
 
 
302 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4662  histone deacetylase family protein  45.45 
 
 
305 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1245  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  43.38 
 
 
305 aa  256  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1815  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  40.79 
 
 
304 aa  255  6e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4892  histone deacetylase superfamily protein  47.49 
 
 
305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10030  histone deacetylase superfamily  45.78 
 
 
316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0971633  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002921  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  40.66 
 
 
307 aa  252  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2634  histone deacetylase superfamily protein  41.91 
 
 
307 aa  249  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03035  hypothetical protein  39.93 
 
 
307 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1459  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  44.37 
 
 
305 aa  243  3e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6387  histone deacetylase superfamily protein  45.21 
 
 
298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.006244  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3900  histone deacetylase superfamily protein  37.62 
 
 
305 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0998  hypothetical protein  39.12 
 
 
300 aa  236  5.0000000000000005e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0050  histone deacetylase superfamily protein  44.71 
 
 
306 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0204903  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04120  Histone deacetylase superfamily protein  37.29 
 
 
299 aa  231  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1764  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  43.56 
 
 
316 aa  230  3e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0823367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0726  histone deacetylase superfamily  43.54 
 
 
297 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1629  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  38.82 
 
 
306 aa  226  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1152  histone deacetylase superfamily protein  43.79 
 
 
301 aa  226  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0905584  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0713  histone deacetylase superfamily protein  43.2 
 
 
308 aa  225  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0686  histone deacetylase superfamily  43.25 
 
 
294 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.611894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6780  histone deacetylase superfamily  44.9 
 
 
298 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02968  histone deacetylase family protein  48.18 
 
 
224 aa  221  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510136  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1201  histone deacetylase superfamily protein  40.2 
 
 
323 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329608  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2116  histone deacetylase superfamily protein  37.8 
 
 
305 aa  219  6e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2377  histone deacetylase superfamily protein  40.14 
 
 
300 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.018  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2043  Histone deacetylase  38.03 
 
 
299 aa  217  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0169314  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2789  histone deacetylase superfamily protein  40.34 
 
 
298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1601  histone deacetylase superfamily  42.11 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6866  histone deacetylase superfamily  38.41 
 
 
299 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.859971  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2483  Histone deacetylase  35.52 
 
 
300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  0.140117 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1606  hypothetical protein  43.86 
 
 
323 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000378797  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3915  histone deacetylase superfamily protein  40.66 
 
 
315 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2469  Histone deacetylase  44.18 
 
 
305 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2162  histone deacetylase superfamily protein  35.86 
 
 
302 aa  209  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0323  deacetylase  36.09 
 
 
300 aa  207  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1507  hypothetical protein  41.64 
 
 
324 aa  206  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.0000688301  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3448  histone deacetylase superfamily protein  38.74 
 
 
297 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.509704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1941  histone deacetylase superfamily  40.48 
 
 
334 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00172119  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1420  histone deacetylase superfamily protein  40.79 
 
 
306 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0496164 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_4821  predicted protein  40.74 
 
 
324 aa  202  6e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1529  histone deacetylase superfamily protein  37.86 
 
 
299 aa  202  6e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.188503  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1768  Histone deacetylase  39.93 
 
 
311 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3030  Histone deacetylase  38.41 
 
 
299 aa  202  8e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1584  histone deacetylase superfamily protein  39.79 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1613  histone deacetylase superfamily  41.72 
 
 
335 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000964161  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2506  histone deacetylase superfamily  38.83 
 
 
296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1991  histone deacetylase superfamily protein  39.04 
 
 
318 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3087  histone deacetylase superfamily protein  39.27 
 
 
337 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000151146  normal  0.0282587 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40492  predicted protein  34.86 
 
 
350 aa  189  5.999999999999999e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0423597 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1393  histone deacetylase superfamily  36.3 
 
 
299 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1613  histone deacetylase superfamily protein  38.33 
 
 
333 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000152208  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3500  Histone deacetylase  36.88 
 
 
311 aa  182  7e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2066  deacetylase  38.32 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.288592  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9278  predicted protein  34.11 
 
 
294 aa  175  7e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3902  histone deacetylase superfamily protein  33.75 
 
 
357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000251706  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  30.49 
 
 
393 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  30.34 
 
 
407 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  32.51 
 
 
360 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1831  hypothetical protein  42.86 
 
 
133 aa  104  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.330593  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  31.03 
 
 
344 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  34.01 
 
 
397 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  31.35 
 
 
344 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  34.54 
 
 
393 aa  102  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  30 
 
 
306 aa  103  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  31.87 
 
 
393 aa  102  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  28.63 
 
 
351 aa  101  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  31.85 
 
 
406 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  32.12 
 
 
393 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  34.8 
 
 
417 aa  100  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  36.84 
 
 
403 aa  99.8  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  31.1 
 
 
387 aa  99.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0697  histone deacetylase superfamily protein  28.94 
 
 
357 aa  99  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.22424  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  30 
 
 
659 aa  98.2  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>