More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3448 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3448  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 297 aa  596  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.509704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1584  histone deacetylase superfamily protein  85.86 
 
 		 298 aa  525  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1601  histone deacetylase superfamily  66.89 
 
 		 299 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2377  histone deacetylase superfamily protein  62.67 
 
 		 300 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.018  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1152  histone deacetylase superfamily protein  59.46 
 
 		 301 aa  363  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0905584  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3500  Histone deacetylase  57.38 
 
 		 311 aa  335  5.999999999999999e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2066  deacetylase  53.51 
 
 		 299 aa  335  7.999999999999999e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.288592  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1201  histone deacetylase superfamily protein  59.66 
 
 		 323 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329608  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1768  Histone deacetylase  56.04 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1606  hypothetical protein  57.29 
 
 		 323 aa  315  5e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000378797  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1941  histone deacetylase superfamily  56.52 
 
 		 334 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00172119  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1613  histone deacetylase superfamily  56.52 
 
 		 335 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000964161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1529  histone deacetylase superfamily protein  52.01 
 
 		 299 aa  310  1e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.188503  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1507  hypothetical protein  56.95 
 
 		 324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.0000688301  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2469  Histone deacetylase  57.28 
 
 		 305 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1393  histone deacetylase superfamily  50.85 
 
 		 299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1991  histone deacetylase superfamily protein  51.83 
 
 		 318 aa  291  7e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3087  histone deacetylase superfamily protein  50.33 
 
 		 337 aa  287  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000151146  normal  0.0282587 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1613  histone deacetylase superfamily protein  49.51 
 
 		 333 aa  275  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000152208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2789  histone deacetylase superfamily protein  46.26 
 
 		 298 aa  264  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04120  Histone deacetylase superfamily protein  43.62 
 
 		 299 aa  263  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2116  histone deacetylase superfamily protein  42.95 
 
 		 305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2483  Histone deacetylase  41.95 
 
 		 300 aa  258  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  0.140117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2043  Histone deacetylase  43.54 
 
 		 299 aa  257  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0169314  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6866  histone deacetylase superfamily  43.33 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.859971  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0323  deacetylase  41.28 
 
 		 300 aa  252  5.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2162  histone deacetylase superfamily protein  40.6 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1393  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein-like  42.28 
 
 		 304 aa  246  4.9999999999999997e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.194758  normal  0.700999 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1420  histone deacetylase superfamily protein  45.67 
 
 		 306 aa  243  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0496164 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3902  histone deacetylase superfamily protein  40.19 
 
 		 357 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000251706  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2562  Histone deacetylase  40.42 
 
 		 305 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3551  histone deacetylase superfamily  40.42 
 
 		 305 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1532  histone deacetylase superfamily  40.34 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3192  histone deacetylase superfamily protein  40.86 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00911775  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2706  histone deacetylase superfamily  40.94 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000210159  unclonable  0.000000000120446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3030  Histone deacetylase  45.61 
 
 		 299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1162  histone deacetylase superfamily protein  42.61 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1827  histone deacetylase superfamily protein  39.93 
 
 		 303 aa  232  7.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3373  histone deacetylase family protein  40.07 
 
 		 300 aa  228  7e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0543734  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2506  histone deacetylase superfamily  46.08 
 
 		 296 aa  226  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40492  predicted protein  38.61 
 
 		 350 aa  225  8e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0423597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2905  histone deacetylase superfamily protein  38.71 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.681424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0050  histone deacetylase superfamily protein  45.96 
 
 		 306 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0204903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1245  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  41.58 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6387  histone deacetylase superfamily protein  43.93 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.006244  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10030  histone deacetylase superfamily  42.29 
 
 		 316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0971633  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0656  histone deacetylase superfamily protein  41.22 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000855576  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1764  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  40.47 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0823367 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2634  histone deacetylase superfamily protein  39.93 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1459  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  39.39 
 
 		 305 aa  212  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2542  histone deacetylase superfamily protein  40.43 
 
 		 300 aa  212  7e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02968  histone deacetylase family protein  46.67 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510136  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002921  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  39.73 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2474  histone deacetylase superfamily protein  40.43 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188397 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3722  histone deacetylase superfamily protein  40.5 
 
 		 306 aa  209  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2634  histone deacetylase superfamily protein  41.33 
 
 		 300 aa  210  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4777  histone deacetylase superfamily protein  40.14 
 
 		 304 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000599986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2660  histone deacetylase superfamily protein  39.64 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2487  histone deacetylase superfamily protein  39.93 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.60651  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4918  histone deacetylase superfamily protein  39.78 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000273279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03035  hypothetical protein  39.36 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4764  histone deacetylase superfamily  39.43 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000188722  decreased coverage  0.000868257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4639  histone deacetylase superfamily protein  39.43 
 
 		 317 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000315852  hitchhiker  0.00689363 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1629  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  39.38 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0686  histone deacetylase superfamily  41.36 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.611894 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9278  predicted protein  39.32 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1815  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  38.93 
 
 		 304 aa  201  9e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1625  histone deacetylase superfamily protein  38.57 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4295  histone deacetylase superfamily protein  38.71 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4892  histone deacetylase superfamily protein  42.03 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3900  histone deacetylase superfamily protein  36.52 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4662  histone deacetylase family protein  38.71 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2729  histone deacetylase superfamily  37.86 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3915  histone deacetylase superfamily protein  41.09 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1648  histone deacetylase superfamily protein  37.86 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1614  histone deacetylase superfamily protein  37.86 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0713  histone deacetylase superfamily protein  42.75 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40681  predicted protein  38.74 
 
 		 323 aa  195  7e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000252385  normal  0.188986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0726  histone deacetylase superfamily  42.03 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6780  histone deacetylase superfamily  42.14 
 
 		 298 aa  192  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0998  hypothetical protein  36.04 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_4821  predicted protein  33.99 
 
 		 324 aa  148  9e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87707  predicted protein  29.19 
 
 		 480 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  31.88 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  32.8 
 
 		 380 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  33.19 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3454  histone deacetylase superfamily protein  40.21 
 
 		 589 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.524181  normal  0.0722274 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  32.75 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3389  histone deacetylase superfamily protein  38.62 
 
 		 594 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  31.28 
 
 		 389 aa  99  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  28.62 
 
 		 396 aa  99  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  33.33 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  31.45 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  30 
 
 		 371 aa  97.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  31.6 
 
 		 380 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  28.73 
 
 		 344 aa  97.1  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  27.03 
 
 		 388 aa  96.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  31.14 
 
 		 393 aa  96.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3472  histone deacetylase superfamily  39.68 
 
 		 594 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  30.62 
 
 		 370 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>