More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6866 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6866  histone deacetylase superfamily  100 
 
 		 299 aa  623  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.859971  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2043  Histone deacetylase  57.09 
 
 		 299 aa  360  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0169314  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2483  Histone deacetylase  55.41 
 
 		 300 aa  343  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  0.140117 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0323  deacetylase  52.7 
 
 		 300 aa  338  8e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2116  histone deacetylase superfamily protein  52.7 
 
 		 305 aa  332  5e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2162  histone deacetylase superfamily protein  50.68 
 
 		 302 aa  325  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04120  Histone deacetylase superfamily protein  52.36 
 
 		 299 aa  325  4.0000000000000003e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1393  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein-like  44.93 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.194758  normal  0.700999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2562  Histone deacetylase  44.59 
 
 		 305 aa  261  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3192  histone deacetylase superfamily protein  46.28 
 
 		 305 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00911775  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3551  histone deacetylase superfamily  44.59 
 
 		 305 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1601  histone deacetylase superfamily  44.41 
 
 		 299 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1152  histone deacetylase superfamily protein  43.33 
 
 		 301 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0905584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3448  histone deacetylase superfamily protein  43.33 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.509704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1584  histone deacetylase superfamily protein  43.67 
 
 		 298 aa  255  6e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1532  histone deacetylase superfamily  44.59 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2377  histone deacetylase superfamily protein  42.14 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.018  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3500  Histone deacetylase  44.1 
 
 		 311 aa  249  3e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1459  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  42.18 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1201  histone deacetylase superfamily protein  44.26 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329608  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1827  histone deacetylase superfamily protein  44.93 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2789  histone deacetylase superfamily protein  43.75 
 
 		 298 aa  245  8e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2706  histone deacetylase superfamily  46.62 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000210159  unclonable  0.000000000120446 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2066  deacetylase  40.35 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.288592  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1768  Histone deacetylase  41.8 
 
 		 311 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4892  histone deacetylase superfamily protein  43.19 
 
 		 305 aa  238  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3030  Histone deacetylase  43.9 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6387  histone deacetylase superfamily protein  40.88 
 
 		 298 aa  235  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.006244  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1507  hypothetical protein  41.39 
 
 		 324 aa  235  6e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.0000688301  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1613  histone deacetylase superfamily  41.67 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000964161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1941  histone deacetylase superfamily  41 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00172119  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1991  histone deacetylase superfamily protein  41.29 
 
 		 318 aa  232  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158404 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3722  histone deacetylase superfamily protein  40.74 
 
 		 306 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3087  histone deacetylase superfamily protein  41.48 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000151146  normal  0.0282587 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40492  predicted protein  41.78 
 
 		 350 aa  230  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0423597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2469  Histone deacetylase  41.86 
 
 		 305 aa  228  8e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2506  histone deacetylase superfamily  43.86 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10030  histone deacetylase superfamily  40.14 
 
 		 316 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0971633  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4918  histone deacetylase superfamily protein  40.48 
 
 		 306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000273279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1764  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  39.8 
 
 		 316 aa  225  6e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0823367 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1529  histone deacetylase superfamily protein  41.06 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.188503  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2905  histone deacetylase superfamily protein  37.5 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.681424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1613  histone deacetylase superfamily protein  40.58 
 
 		 333 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000152208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1606  hypothetical protein  41.16 
 
 		 323 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000378797  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2634  histone deacetylase superfamily protein  39.72 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4295  histone deacetylase superfamily protein  40.48 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3900  histone deacetylase superfamily protein  38.46 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1420  histone deacetylase superfamily protein  39.39 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0496164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4639  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 		 317 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000315852  hitchhiker  0.00689363 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1393  histone deacetylase superfamily  39.73 
 
 		 299 aa  218  8.999999999999998e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4777  histone deacetylase superfamily protein  39.66 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000599986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4764  histone deacetylase superfamily  39.66 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000188722  decreased coverage  0.000868257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0656  histone deacetylase superfamily protein  39.59 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000855576  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4662  histone deacetylase family protein  40.14 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3373  histone deacetylase family protein  39.86 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0543734  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3902  histone deacetylase superfamily protein  36 
 
 		 357 aa  212  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000251706  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1162  histone deacetylase superfamily protein  38.85 
 
 		 306 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6780  histone deacetylase superfamily  38.85 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0050  histone deacetylase superfamily protein  38.41 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0204903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3915  histone deacetylase superfamily protein  37.02 
 
 		 315 aa  208  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40681  predicted protein  38.41 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000252385  normal  0.188986 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002921  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  38.13 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1245  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  37.41 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0686  histone deacetylase superfamily  36.18 
 
 		 294 aa  205  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.611894 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03035  hypothetical protein  37.12 
 
 		 307 aa  205  9e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2487  histone deacetylase superfamily protein  38.68 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.60651  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2542  histone deacetylase superfamily protein  37.76 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1629  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  38.51 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0713  histone deacetylase superfamily protein  36.86 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2634  histone deacetylase superfamily protein  37.41 
 
 		 300 aa  195  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803062 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2474  histone deacetylase superfamily protein  37.06 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188397 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1815  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  37.41 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0726  histone deacetylase superfamily  36.52 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02968  histone deacetylase family protein  42.79 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1648  histone deacetylase superfamily protein  36.71 
 
 		 302 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1614  histone deacetylase superfamily protein  36.71 
 
 		 302 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2660  histone deacetylase superfamily protein  35.93 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2729  histone deacetylase superfamily  36.71 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0998  hypothetical protein  36.71 
 
 		 300 aa  185  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1625  histone deacetylase superfamily protein  36.36 
 
 		 302 aa  185  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9278  predicted protein  34.81 
 
 		 294 aa  177  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_4821  predicted protein  31.83 
 
 		 324 aa  155  8e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1831  hypothetical protein  50.45 
 
 		 133 aa  124  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.330593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  28.24 
 
 		 404 aa  108  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  26.91 
 
 		 393 aa  102  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  28.46 
 
 		 388 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  28.46 
 
 		 404 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  29.67 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  27.05 
 
 		 393 aa  99.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  29.84 
 
 		 344 aa  99.8  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  28.37 
 
 		 387 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  28.33 
 
 		 403 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  28.51 
 
 		 365 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3454  histone deacetylase superfamily protein  34.83 
 
 		 589 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.524181  normal  0.0722274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3389  histone deacetylase superfamily protein  34.59 
 
 		 594 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  28.17 
 
 		 407 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  34.68 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  29.47 
 
 		 385 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  27.52 
 
 		 385 aa  96.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  27.52 
 
 		 385 aa  96.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>