More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1601 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1601  histone deacetylase superfamily  100 
 
 		 299 aa  608  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3448  histone deacetylase superfamily protein  66.89 
 
 		 297 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.509704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1584  histone deacetylase superfamily protein  66.1 
 
 		 298 aa  397  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2377  histone deacetylase superfamily protein  63.21 
 
 		 300 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.018  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1152  histone deacetylase superfamily protein  61.41 
 
 		 301 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0905584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1201  histone deacetylase superfamily protein  61.07 
 
 		 323 aa  353  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329608  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2469  Histone deacetylase  62.88 
 
 		 305 aa  341  8e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1606  hypothetical protein  59.32 
 
 		 323 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000378797  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1941  histone deacetylase superfamily  58.19 
 
 		 334 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00172119  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1507  hypothetical protein  60.34 
 
 		 324 aa  333  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.0000688301  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1768  Histone deacetylase  57.72 
 
 		 311 aa  332  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1613  histone deacetylase superfamily  58.19 
 
 		 335 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000964161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2066  deacetylase  52.2 
 
 		 299 aa  329  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.288592  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1529  histone deacetylase superfamily protein  53.56 
 
 		 299 aa  328  5.0000000000000004e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.188503  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1991  histone deacetylase superfamily protein  58.05 
 
 		 318 aa  325  4.0000000000000003e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158404 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3500  Histone deacetylase  53.54 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3087  histone deacetylase superfamily protein  55.45 
 
 		 337 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000151146  normal  0.0282587 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1393  histone deacetylase superfamily  51.86 
 
 		 299 aa  315  4e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1613  histone deacetylase superfamily protein  54.1 
 
 		 333 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000152208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2789  histone deacetylase superfamily protein  48.81 
 
 		 298 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1393  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein-like  47.46 
 
 		 304 aa  277  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.194758  normal  0.700999 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04120  Histone deacetylase superfamily protein  44.59 
 
 		 299 aa  275  5e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3551  histone deacetylase superfamily  45.45 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2562  Histone deacetylase  45.45 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2116  histone deacetylase superfamily protein  43.39 
 
 		 305 aa  268  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2706  histone deacetylase superfamily  46.88 
 
 		 305 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000210159  unclonable  0.000000000120446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1532  histone deacetylase superfamily  44.79 
 
 		 304 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6866  histone deacetylase superfamily  44.41 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.859971  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2043  Histone deacetylase  45.52 
 
 		 299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0169314  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3373  histone deacetylase family protein  43.2 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0543734  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2162  histone deacetylase superfamily protein  42.37 
 
 		 302 aa  266  4e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1827  histone deacetylase superfamily protein  44.44 
 
 		 303 aa  265  8.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3192  histone deacetylase superfamily protein  44.75 
 
 		 305 aa  263  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00911775  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10030  histone deacetylase superfamily  45.85 
 
 		 316 aa  256  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0971633  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0323  deacetylase  39.32 
 
 		 300 aa  255  7e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0050  histone deacetylase superfamily protein  48.43 
 
 		 306 aa  255  8e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0204903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3902  histone deacetylase superfamily protein  40.49 
 
 		 357 aa  250  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000251706  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3030  Histone deacetylase  47.52 
 
 		 299 aa  249  5e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3722  histone deacetylase superfamily protein  44.24 
 
 		 306 aa  249  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2483  Histone deacetylase  39.66 
 
 		 300 aa  249  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  0.140117 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2634  histone deacetylase superfamily protein  43.28 
 
 		 300 aa  249  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803062 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1420  histone deacetylase superfamily protein  46.05 
 
 		 306 aa  248  8e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0496164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0656  histone deacetylase superfamily protein  45.29 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000855576  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1162  histone deacetylase superfamily protein  42.86 
 
 		 306 aa  246  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4892  histone deacetylase superfamily protein  48.25 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2542  histone deacetylase superfamily protein  40.94 
 
 		 300 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1815  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  42.03 
 
 		 304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2474  histone deacetylase superfamily protein  41.3 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4777  histone deacetylase superfamily protein  43.84 
 
 		 304 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000599986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1764  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  45.39 
 
 		 316 aa  242  3.9999999999999997e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0823367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4295  histone deacetylase superfamily protein  44.2 
 
 		 305 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1459  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  44.89 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4764  histone deacetylase superfamily  43.12 
 
 		 304 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000188722  decreased coverage  0.000868257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2905  histone deacetylase superfamily protein  39.66 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.681424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4639  histone deacetylase superfamily protein  43.12 
 
 		 317 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000315852  hitchhiker  0.00689363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1625  histone deacetylase superfamily protein  40.22 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2634  histone deacetylase superfamily protein  39.93 
 
 		 307 aa  237  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1245  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  41.82 
 
 		 305 aa  236  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118499 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2729  histone deacetylase superfamily  40.22 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0686  histone deacetylase superfamily  48.75 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.611894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4662  histone deacetylase family protein  43.48 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4918  histone deacetylase superfamily protein  42.03 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000273279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2487  histone deacetylase superfamily protein  41.1 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.60651  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002921  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  41.52 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1614  histone deacetylase superfamily protein  39.49 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1648  histone deacetylase superfamily protein  39.49 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6387  histone deacetylase superfamily protein  44.76 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.006244  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2506  histone deacetylase superfamily  46.92 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40492  predicted protein  40.98 
 
 		 350 aa  231  9e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0423597 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1629  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  39.1 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2660  histone deacetylase superfamily protein  40.7 
 
 		 304 aa  229  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3915  histone deacetylase superfamily protein  43.84 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9278  predicted protein  43.34 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03035  hypothetical protein  39.1 
 
 		 307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6780  histone deacetylase superfamily  45.49 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02968  histone deacetylase family protein  47.73 
 
 		 224 aa  223  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510136  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0713  histone deacetylase superfamily protein  43.71 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0726  histone deacetylase superfamily  44.06 
 
 		 297 aa  218  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3900  histone deacetylase superfamily protein  38.06 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40681  predicted protein  42.11 
 
 		 323 aa  212  5.999999999999999e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000252385  normal  0.188986 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0998  hypothetical protein  37.19 
 
 		 300 aa  205  9e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_4821  predicted protein  36.66 
 
 		 324 aa  179  4.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  35.86 
 
 		 393 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  35.06 
 
 		 370 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  36.4 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  32.53 
 
 		 407 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3389  histone deacetylase superfamily protein  39.13 
 
 		 594 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  30.1 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  30.1 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  33.2 
 
 		 378 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  33.72 
 
 		 403 aa  109  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  29.77 
 
 		 388 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  29.77 
 
 		 388 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  29.77 
 
 		 388 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  29.77 
 
 		 388 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3454  histone deacetylase superfamily protein  37.19 
 
 		 589 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.524181  normal  0.0722274 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  29.77 
 
 		 388 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  36.2 
 
 		 406 aa  108  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  33.71 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  30.43 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>