More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3389 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3454  histone deacetylase superfamily protein  77 
 
 		 589 aa  866    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.524181  normal  0.0722274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3389  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 594 aa  1155    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3472  histone deacetylase superfamily  96.36 
 
 		 594 aa  1040    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3536  histone deacetylase superfamily  96.19 
 
 		 594 aa  1036    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.380166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5329  histone deacetylase superfamily  51.04 
 
 		 577 aa  506  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3030  Histone deacetylase  46.15 
 
 		 299 aa  134  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2506  histone deacetylase superfamily  42.5 
 
 		 296 aa  123  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1152  histone deacetylase superfamily protein  40.16 
 
 		 301 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0905584  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0323  deacetylase  28.97 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1420  histone deacetylase superfamily protein  39.92 
 
 		 306 aa  107  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0496164 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2066  deacetylase  35.89 
 
 		 299 aa  107  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.288592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2483  Histone deacetylase  33.77 
 
 		 300 aa  107  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  0.140117 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3500  Histone deacetylase  38.19 
 
 		 311 aa  104  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1601  histone deacetylase superfamily  39.13 
 
 		 299 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2377  histone deacetylase superfamily protein  35.68 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.018  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1459  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  33.09 
 
 		 305 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1201  histone deacetylase superfamily protein  38.27 
 
 		 323 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329608  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0686  histone deacetylase superfamily  39.74 
 
 		 294 aa  100  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.611894 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1991  histone deacetylase superfamily protein  36.67 
 
 		 318 aa  100  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3448  histone deacetylase superfamily protein  38.62 
 
 		 297 aa  100  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.509704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6866  histone deacetylase superfamily  34.59 
 
 		 299 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.859971  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2162  histone deacetylase superfamily protein  34.12 
 
 		 302 aa  99.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1768  Histone deacetylase  39.11 
 
 		 311 aa  98.6  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3902  histone deacetylase superfamily protein  29.94 
 
 		 357 aa  97.8  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000251706  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2116  histone deacetylase superfamily protein  35.12 
 
 		 305 aa  97.1  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1529  histone deacetylase superfamily protein  37.17 
 
 		 299 aa  97.1  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.188503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3087  histone deacetylase superfamily protein  38.69 
 
 		 337 aa  96.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000151146  normal  0.0282587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1584  histone deacetylase superfamily protein  36.32 
 
 		 298 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1764  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  33.33 
 
 		 316 aa  95.5  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0823367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1507  hypothetical protein  40.49 
 
 		 324 aa  95.5  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.0000688301  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  35.52 
 
 		 426 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1606  hypothetical protein  41 
 
 		 323 aa  94.4  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000378797  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  38.18 
 
 		 435 aa  94  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1613  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 		 333 aa  93.6  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000152208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2469  Histone deacetylase  42.71 
 
 		 305 aa  92  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02968  histone deacetylase family protein  33.85 
 
 		 224 aa  92  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510136  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  33.11 
 
 		 393 aa  91.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2043  Histone deacetylase  37.28 
 
 		 299 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0169314  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6387  histone deacetylase superfamily protein  39.2 
 
 		 298 aa  92  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.006244  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0050  histone deacetylase superfamily protein  34.44 
 
 		 306 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0204903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2562  Histone deacetylase  33.16 
 
 		 305 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3551  histone deacetylase superfamily  33.16 
 
 		 305 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0713  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 		 308 aa  90.9  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2789  histone deacetylase superfamily protein  32.62 
 
 		 298 aa  90.9  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3373  histone deacetylase family protein  31.1 
 
 		 300 aa  90.5  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0543734  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  32.64 
 
 		 406 aa  90.1  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0726  histone deacetylase superfamily  40 
 
 		 297 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1393  histone deacetylase superfamily  34.74 
 
 		 299 aa  89.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  30.32 
 
 		 410 aa  89.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1613  histone deacetylase superfamily  36.59 
 
 		 335 aa  88.6  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000964161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1393  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein-like  36.17 
 
 		 304 aa  88.6  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.194758  normal  0.700999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3192  histone deacetylase superfamily protein  35.64 
 
 		 305 aa  88.2  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00911775  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04120  Histone deacetylase superfamily protein  30.89 
 
 		 299 aa  87.8  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1941  histone deacetylase superfamily  37.5 
 
 		 334 aa  87.4  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00172119  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  31.77 
 
 		 414 aa  86.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1532  histone deacetylase superfamily  34.57 
 
 		 304 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2474  histone deacetylase superfamily protein  29.39 
 
 		 300 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188397 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2660  histone deacetylase superfamily protein  29.73 
 
 		 304 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2542  histone deacetylase superfamily protein  28.24 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2905  histone deacetylase superfamily protein  28.42 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.681424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  31.17 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  25.93 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1827  histone deacetylase superfamily protein  30 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40492  predicted protein  32.82 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0423597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6780  histone deacetylase superfamily  31.79 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4892  histone deacetylase superfamily protein  37.5 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2634  histone deacetylase superfamily protein  30.15 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803062 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2487  histone deacetylase superfamily protein  33.19 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.60651  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2729  histone deacetylase superfamily  27.86 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  25.29 
 
 		 488 aa  82.8  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  29.77 
 
 		 396 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  31.29 
 
 		 397 aa  83.2  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1614  histone deacetylase superfamily protein  27.86 
 
 		 302 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1648  histone deacetylase superfamily protein  27.86 
 
 		 302 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  29.97 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  35.24 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  29.18 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  33.22 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2634  histone deacetylase superfamily protein  29.91 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4662  histone deacetylase family protein  34.85 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1625  histone deacetylase superfamily protein  28.74 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  35.4 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  38.78 
 
 		 395 aa  79.7  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  29.62 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  35.29 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4918  histone deacetylase superfamily protein  34.03 
 
 		 306 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000273279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  30.43 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3722  histone deacetylase superfamily protein  33.77 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4295  histone deacetylase superfamily protein  33.84 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  25 
 
 		 500 aa  78.6  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  25.65 
 
 		 687 aa  78.2  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  26.05 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1245  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  34.57 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118499 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0656  histone deacetylase superfamily protein  37.19 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000855576  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  29.49 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  28.53 
 
 		 737 aa  77.4  0.0000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  32.57 
 
 		 381 aa  77  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  32.51 
 
 		 407 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  25.26 
 
 		 388 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  25.9 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>