More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2066 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2066  deacetylase  100 
 
 		 299 aa  616  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.288592  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3448  histone deacetylase superfamily protein  53.51 
 
 		 297 aa  335  7.999999999999999e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.509704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1584  histone deacetylase superfamily protein  52.35 
 
 		 298 aa  326  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2377  histone deacetylase superfamily protein  49.49 
 
 		 300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.018  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1601  histone deacetylase superfamily  52.2 
 
 		 299 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1152  histone deacetylase superfamily protein  50.84 
 
 		 301 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0905584  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3500  Histone deacetylase  48.15 
 
 		 311 aa  286  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1941  histone deacetylase superfamily  47.37 
 
 		 334 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00172119  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1201  histone deacetylase superfamily protein  50.17 
 
 		 323 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329608  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1613  histone deacetylase superfamily  48.16 
 
 		 335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000964161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2469  Histone deacetylase  50.5 
 
 		 305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1768  Histone deacetylase  45.97 
 
 		 311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1606  hypothetical protein  47.33 
 
 		 323 aa  266  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000378797  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1507  hypothetical protein  46.69 
 
 		 324 aa  266  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.0000688301  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1529  histone deacetylase superfamily protein  47.32 
 
 		 299 aa  265  8.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.188503  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2116  histone deacetylase superfamily protein  41.5 
 
 		 305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2162  histone deacetylase superfamily protein  40.14 
 
 		 302 aa  255  7e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2562  Histone deacetylase  44.33 
 
 		 305 aa  255  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3551  histone deacetylase superfamily  44.33 
 
 		 305 aa  254  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0323  deacetylase  40.74 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1991  histone deacetylase superfamily protein  43.71 
 
 		 318 aa  252  7e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3087  histone deacetylase superfamily protein  43.23 
 
 		 337 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000151146  normal  0.0282587 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1393  histone deacetylase superfamily  44.3 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04120  Histone deacetylase superfamily protein  41.69 
 
 		 299 aa  248  7e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1532  histone deacetylase superfamily  44.37 
 
 		 304 aa  248  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1393  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein-like  44.01 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.194758  normal  0.700999 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2634  histone deacetylase superfamily protein  42.03 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6866  histone deacetylase superfamily  40.35 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.859971  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3373  histone deacetylase family protein  41.16 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0543734  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1613  histone deacetylase superfamily protein  41.35 
 
 		 333 aa  239  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000152208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1420  histone deacetylase superfamily protein  44.71 
 
 		 306 aa  238  5.999999999999999e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0496164 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2542  histone deacetylase superfamily protein  39.86 
 
 		 300 aa  238  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2474  histone deacetylase superfamily protein  40.21 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188397 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3030  Histone deacetylase  44.52 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3192  histone deacetylase superfamily protein  42.25 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00911775  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10030  histone deacetylase superfamily  41.4 
 
 		 316 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0971633  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1815  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  39.22 
 
 		 304 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1162  histone deacetylase superfamily protein  40.43 
 
 		 306 aa  231  9e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2483  Histone deacetylase  40 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  0.140117 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2729  histone deacetylase superfamily  39.22 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1614  histone deacetylase superfamily protein  38.87 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1648  histone deacetylase superfamily protein  38.87 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2487  histone deacetylase superfamily protein  41.98 
 
 		 300 aa  229  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.60651  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3902  histone deacetylase superfamily protein  39.01 
 
 		 357 aa  229  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000251706  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4777  histone deacetylase superfamily protein  40.35 
 
 		 304 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000599986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0656  histone deacetylase superfamily protein  41.22 
 
 		 304 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000855576  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4892  histone deacetylase superfamily protein  46.49 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1625  histone deacetylase superfamily protein  38.87 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2043  Histone deacetylase  40.14 
 
 		 299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0169314  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4639  histone deacetylase superfamily protein  40.28 
 
 		 317 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000315852  hitchhiker  0.00689363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6387  histone deacetylase superfamily protein  41.61 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.006244  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4764  histone deacetylase superfamily  39.93 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000188722  decreased coverage  0.000868257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2706  histone deacetylase superfamily  41.2 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000210159  unclonable  0.000000000120446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4918  histone deacetylase superfamily protein  40.14 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000273279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2506  histone deacetylase superfamily  45.61 
 
 		 296 aa  221  8e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1827  histone deacetylase superfamily protein  40.14 
 
 		 303 aa  221  9e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1245  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  39.46 
 
 		 305 aa  221  9e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118499 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1764  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  41.02 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0823367 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1629  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  38.41 
 
 		 306 aa  218  7e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2634  histone deacetylase superfamily protein  39.5 
 
 		 307 aa  218  7e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2905  histone deacetylase superfamily protein  38.16 
 
 		 308 aa  218  7.999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.681424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002921  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  41.46 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1459  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  40.88 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0050  histone deacetylase superfamily protein  45.76 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0204903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4295  histone deacetylase superfamily protein  39.78 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3722  histone deacetylase superfamily protein  39.93 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6780  histone deacetylase superfamily  41.7 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0686  histone deacetylase superfamily  43.01 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.611894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4662  histone deacetylase family protein  39.78 
 
 		 305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2789  histone deacetylase superfamily protein  37.84 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02968  histone deacetylase family protein  43.75 
 
 		 224 aa  210  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510136  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0713  histone deacetylase superfamily protein  41.34 
 
 		 308 aa  208  9e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0726  histone deacetylase superfamily  41.34 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2660  histone deacetylase superfamily protein  38.73 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03035  hypothetical protein  38.11 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3900  histone deacetylase superfamily protein  38.23 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0998  hypothetical protein  35.71 
 
 		 300 aa  192  8e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40492  predicted protein  35.31 
 
 		 350 aa  189  7e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0423597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3915  histone deacetylase superfamily protein  39.08 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_4821  predicted protein  37.46 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9278  predicted protein  39.59 
 
 		 294 aa  178  9e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40681  predicted protein  38.32 
 
 		 323 aa  169  4e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000252385  normal  0.188986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  28.57 
 
 		 352 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  31 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  31.52 
 
 		 379 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  30.81 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  30.74 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3389  histone deacetylase superfamily protein  36.6 
 
 		 594 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  26.71 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  26.71 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  30.69 
 
 		 379 aa  99.4  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3454  histone deacetylase superfamily protein  34.55 
 
 		 589 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.524181  normal  0.0722274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  31.82 
 
 		 380 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  31.82 
 
 		 380 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  31.58 
 
 		 378 aa  95.9  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1831  hypothetical protein  40.98 
 
 		 133 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.330593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  31.15 
 
 		 364 aa  95.9  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5329  histone deacetylase superfamily  34.4 
 
 		 577 aa  95.9  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  35.26 
 
 		 345 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  29.27 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>